More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1918 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1918  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  662    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02689  methyltransferase  60.52 
 
 
310 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003801  methyltransferase  60.52 
 
 
310 aa  404  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3530  hypothetical protein  61.09 
 
 
313 aa  401  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.524505  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3633  hypothetical protein  61.54 
 
 
321 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1143  hypothetical protein  60.44 
 
 
321 aa  397  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3872  hypothetical protein  60.65 
 
 
308 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4306  hypothetical protein  60.19 
 
 
318 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2527  hypothetical protein  58.39 
 
 
320 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1561  hypothetical protein  60 
 
 
318 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207063  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3577  SAM-dependent methyltransferase-like protein  62.38 
 
 
308 aa  385  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.586441 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2337  hypothetical protein  58.39 
 
 
320 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.623791 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46250  hypothetical protein  57.05 
 
 
313 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0321722  normal  0.0483373 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3932  hypothetical protein  57.05 
 
 
313 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2890  hypothetical protein  46.3 
 
 
302 aa  286  4e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0038147  hitchhiker  0.00000713173 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3313  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  45.33 
 
 
314 aa  282  7.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1491  hypothetical protein  47.85 
 
 
308 aa  281  1e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000879827  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2777  hypothetical protein  47.92 
 
 
305 aa  272  7e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00142049  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2385  hypothetical protein  47.59 
 
 
304 aa  270  2e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000477017  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2680  hypothetical protein  47.22 
 
 
305 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00757466  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1666  hypothetical protein  48.29 
 
 
303 aa  270  4e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000201275  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1686  hypothetical protein  47.22 
 
 
305 aa  268  7e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000452263  normal  0.0252505 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2701  hypothetical protein  46.88 
 
 
305 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000560458  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1551  hypothetical protein  45.96 
 
 
303 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0147626  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1545  hypothetical protein  46.32 
 
 
303 aa  266  4e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013291  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1701  hypothetical protein  46.88 
 
 
302 aa  265  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000328328  normal  0.027964 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2556  hypothetical protein  46.76 
 
 
302 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2919  hypothetical protein  45.8 
 
 
303 aa  260  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1486  hypothetical protein  45.61 
 
 
303 aa  259  3e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000118993  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1661  hypothetical protein  43.89 
 
 
319 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519453  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2397  hypothetical protein  47.42 
 
 
305 aa  250  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00356323  normal  0.487755 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4405  hypothetical protein  43 
 
 
299 aa  249  6e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.134753  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2094  hypothetical protein  42.28 
 
 
319 aa  248  8e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.120571 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2359  hypothetical protein  48.79 
 
 
305 aa  248  1e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3357  hypothetical protein  42.62 
 
 
319 aa  246  4.9999999999999997e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416158  normal  0.98402 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2468  hypothetical protein  40.72 
 
 
310 aa  238  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219028  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1214  hypothetical protein  42.57 
 
 
309 aa  228  1e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2881  SAM-dependent methyltransferases  41.24 
 
 
305 aa  209  6e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000986982  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1161  hypothetical protein  39.18 
 
 
320 aa  209  6e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3598  hypothetical protein  35.71 
 
 
338 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3492  pseudouridine synthase  31.6 
 
 
560 aa  117  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1462  hypothetical protein  36.16 
 
 
318 aa  115  8.999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.685404  normal  0.241812 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3324  hypothetical protein  30.72 
 
 
353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3633  hypothetical protein  32.22 
 
 
350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4815  hypothetical protein  33.58 
 
 
338 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195224  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3286  hypothetical protein  29.97 
 
 
335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1873  hypothetical protein  32.01 
 
 
335 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2451  hypothetical protein  31.84 
 
 
380 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0704  hypothetical protein  30.74 
 
 
363 aa  107  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0070  hypothetical protein  29.79 
 
 
338 aa  107  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2105  hypothetical protein  31.43 
 
 
335 aa  107  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4260  hypothetical protein  30.37 
 
 
335 aa  106  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00951955 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3930  protein of unknown function Met10  31.25 
 
 
479 aa  105  7e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4172  hypothetical protein  32.97 
 
 
338 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  28.06 
 
 
400 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3595  hypothetical protein  28.12 
 
 
335 aa  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.222828  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  28.06 
 
 
400 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4481  hypothetical protein  33.21 
 
 
338 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2449  hypothetical protein  30.04 
 
 
335 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.861715  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2332  hypothetical protein  30.04 
 
 
335 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.946528  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2332  hypothetical protein  30.04 
 
 
335 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.97863  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2014  hypothetical protein  29.33 
 
 
335 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  27.7 
 
 
400 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.86 
 
 
713 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.86 
 
 
713 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0650  putative SAM-dependent methyltransferase  36 
 
 
400 aa  99.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  33.33 
 
 
408 aa  99.4  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1912  hypothetical protein  31.56 
 
 
321 aa  98.6  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1380  hypothetical protein  27.91 
 
 
385 aa  99  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0930599  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2998  hypothetical protein  30.68 
 
 
397 aa  98.6  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0259  SAM-dependent methyltransferase  27.94 
 
 
389 aa  98.6  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.966549  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1601  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.72 
 
 
713 aa  99  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.867514 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1771  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.81 
 
 
807 aa  97.4  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1851  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.88 
 
 
711 aa  97.1  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2661  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.33 
 
 
712 aa  96.7  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3712  SAM-dependent methyltransferase  29.82 
 
 
393 aa  96.7  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.100663 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  31.28 
 
 
392 aa  96.3  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  34.83 
 
 
397 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0772  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.25 
 
 
776 aa  94.4  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.829763 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6906  Methyltransferase type 11  40.16 
 
 
315 aa  94  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4665  hypothetical protein  27.05 
 
 
399 aa  94  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0766  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.25 
 
 
768 aa  93.6  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.1454 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1774  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.24 
 
 
709 aa  93.6  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.828749  hitchhiker  0.000200873 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4997  SAM-dependent methyltransferase-like  30.45 
 
 
334 aa  93.6  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4650  hypothetical protein  27.05 
 
 
399 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2685  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.24 
 
 
709 aa  93.6  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4274  methyltransferase  27.05 
 
 
399 aa  92.8  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.314948  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4666  hypothetical protein  27.05 
 
 
399 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0587  hypothetical protein  27.05 
 
 
399 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4435  hypothetical protein  27.05 
 
 
399 aa  92.8  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4780  hypothetical protein  27.05 
 
 
399 aa  92.8  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4653  hypothetical protein  27.05 
 
 
399 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4368  PUA domain-containing protein  26.64 
 
 
399 aa  92.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3279  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  27.92 
 
 
715 aa  92  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2470  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.52 
 
 
711 aa  92  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000238626  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1812  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.64 
 
 
711 aa  92  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0884579  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4285  methyltransferase  26.64 
 
 
399 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  34.87 
 
 
396 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  34.87 
 
 
396 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  34.87 
 
 
396 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>