75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1914 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1914  histidine kinase  100 
 
 
221 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.116894  normal  0.357859 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3309  histidine kinase  65.28 
 
 
219 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1100  histidine kinase  65.28 
 
 
219 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000104684 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3267  histidine kinase  65.28 
 
 
219 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3445  histidine kinase  65.28 
 
 
219 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303754 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2861  histidine kinase  62.96 
 
 
219 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2848  histidine kinase  56.48 
 
 
217 aa  261  6e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.531025  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3014  hypothetical protein  52.78 
 
 
230 aa  236  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4036  histidine kinase  51.15 
 
 
221 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2589  hypothetical protein  42.18 
 
 
240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0513  hypothetical protein  39.45 
 
 
220 aa  161  8.000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2435  hypothetical protein  41.01 
 
 
237 aa  154  7e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.77423 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01421  hypothetical protein  45.22 
 
 
129 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.232872  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0824  methyltransferase type 12  30.63 
 
 
200 aa  86.7  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1319  Lipocalin  29.05 
 
 
260 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00248779 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0686  Methyltransferase type 12  32.31 
 
 
236 aa  73.6  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0475  hypothetical protein  30.6 
 
 
227 aa  72.8  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0149122 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1764  hypothetical protein  32.61 
 
 
232 aa  71.6  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1760  hypothetical protein  28.76 
 
 
229 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1626  hypothetical protein  29.21 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.220792 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1098  methyltransferase small  30 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391663  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0452  methyltransferase type 12  30.43 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0562  methyltransferase type 12  29.23 
 
 
239 aa  66.2  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0609  Methyltransferase type 12  29.23 
 
 
235 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1383  Methyltransferase type 12  30.52 
 
 
249 aa  63.5  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1029  methyltransferase small  28.95 
 
 
240 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2955  hypothetical protein  27.63 
 
 
237 aa  61.6  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0919903  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0005  methyltransferase small  30.48 
 
 
264 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125741 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0580  Methyltransferase type 12  25.95 
 
 
233 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.260933 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0211  Methyltransferase type 12  28.68 
 
 
214 aa  61.6  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.873381  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3232  Methyltransferase type 11  26.36 
 
 
218 aa  59.3  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.74588  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1002  methyltransferase small  27.91 
 
 
240 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1737  Methyltransferase-16, putative  29.76 
 
 
246 aa  56.6  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.762946 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0515  Methyltransferase type 12  24.05 
 
 
235 aa  52.4  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3694  putative methyltransferase protein  28.36 
 
 
217 aa  52.4  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4015  putative methyltransferase protein  27.94 
 
 
215 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0687  hypothetical protein  29.91 
 
 
217 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0043  hypothetical protein  27.21 
 
 
232 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0970  hypothetical protein  24.63 
 
 
218 aa  48.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2163  hypothetical protein  24.63 
 
 
214 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2402  Methyltransferase type 11  31.76 
 
 
296 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92077  predicted protein  28.8 
 
 
215 aa  47  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00026919  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  28.81 
 
 
218 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2490  Methyltransferase type 11  28.44 
 
 
296 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1460  methyltransferase type 11  31.76 
 
 
295 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.60854  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5047  hypothetical protein  28.68 
 
 
232 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  29.23 
 
 
244 aa  46.2  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0091  hypothetical protein  31.88 
 
 
240 aa  46.2  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0346514  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0281  hypothetical protein  31.82 
 
 
263 aa  45.4  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1892  hypothetical protein  25.37 
 
 
218 aa  45.4  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0759  hypothetical protein  25.74 
 
 
219 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.580871 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  29.63 
 
 
276 aa  44.3  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2961  hypothetical protein  25.37 
 
 
218 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210334  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4465  hypothetical protein  29.06 
 
 
217 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  32 
 
 
270 aa  43.9  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06680  hypothetical protein  28.21 
 
 
219 aa  43.5  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5354  hypothetical protein  27.34 
 
 
216 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190586  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3349  Methyltransferase type 11  34.15 
 
 
145 aa  43.5  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47578  predicted protein  29.08 
 
 
333 aa  43.5  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.226314  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  31.82 
 
 
275 aa  43.9  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.73 
 
 
238 aa  43.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  27.61 
 
 
269 aa  43.1  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  28.57 
 
 
279 aa  43.1  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0640  hypothetical protein  24.83 
 
 
223 aa  42.7  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335057  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1672  hypothetical protein  30.17 
 
 
268 aa  42.4  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.51834  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2946  hypothetical protein  30.43 
 
 
217 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.669539 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1820  hypothetical protein  24.63 
 
 
218 aa  42.7  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.385222  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0546  methyltransferase type 12  27.35 
 
 
218 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_35002  predicted protein  28.12 
 
 
302 aa  42  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.353104  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2246  hypothetical protein  24.24 
 
 
219 aa  41.6  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0818704 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0253  hypothetical protein  23.75 
 
 
220 aa  41.6  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0573  hypothetical protein  25.37 
 
 
216 aa  41.6  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0289  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  27.78 
 
 
222 aa  41.6  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1878  methyltransferase-like protein  25.68 
 
 
214 aa  41.6  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.627264  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1932  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  27.78 
 
 
222 aa  41.6  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>