More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1857 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1857  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  100 
 
 
322 aa  657    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.566225  hitchhiker  0.00271003 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3673  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  39.51 
 
 
320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.475948  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0964  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  38.89 
 
 
320 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2242  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  38.04 
 
 
321 aa  249  5e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.853779  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3408  ribose ABC transporter, periplasmic D-ribose-binding protein  39.51 
 
 
320 aa  243  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0544  ribose ABC transporter, periplasmic D-ribose-binding protein  41.53 
 
 
320 aa  241  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0546563  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3407  putative sugar ABC transporter, substrate-binding protein  39.88 
 
 
315 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.68481  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3705  putative sugar ABC transporter, substrate-binding protein  39.69 
 
 
315 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.838921  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0546  ribose ABC transporter, periplasmic D-ribose-binding protein  41.53 
 
 
320 aa  239  6.999999999999999e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2825  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  40.8 
 
 
316 aa  237  2e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.223477  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4261  putative sugar uptake ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  40.44 
 
 
316 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0302326  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4864  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  38.87 
 
 
321 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3269  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.13 
 
 
330 aa  228  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.605596  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5265  putative ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  37.73 
 
 
322 aa  223  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.108745  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4771  ABC ribose transporter, periplasmic solute-binding protein  37.54 
 
 
319 aa  213  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1249  ABC ribose transporter, periplasmic solute-binding protein  36.82 
 
 
320 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2909  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.82 
 
 
320 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2685  transcriptional regulators-like protein  36.82 
 
 
319 aa  202  9e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139219  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2882  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.34 
 
 
354 aa  158  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.79248 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3849  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.67 
 
 
354 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10520  monosaccharide-binding protein  34.38 
 
 
366 aa  150  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8257  periplasmic ribose-binding protein  33.67 
 
 
353 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.01712 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1353  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.27 
 
 
360 aa  149  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.146603  normal  0.383491 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3728  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.92 
 
 
351 aa  145  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.524714  normal  0.0159805 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11060  monosaccharide-binding protein  33.67 
 
 
347 aa  142  8e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0166  monosaccharide-transporting ATPase  37.13 
 
 
307 aa  142  9e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1794  monosaccharide-transporting ATPase  32.22 
 
 
295 aa  136  5e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.37883  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2399  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.53 
 
 
351 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0923  monosaccharide-transporting ATPase  30.68 
 
 
289 aa  123  5e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3328  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.94 
 
 
311 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2371  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  33.33 
 
 
341 aa  119  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0713  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.22 
 
 
333 aa  119  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0832389  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2522  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.84 
 
 
315 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0266  putative sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein ABC transporter  29 
 
 
341 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0948  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.4 
 
 
311 aa  112  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2026  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.26 
 
 
320 aa  112  7.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1618  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.17 
 
 
316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2277  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.86 
 
 
321 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.455143  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0344  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.01 
 
 
306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1985  monosaccharide-transporting ATPase  28.37 
 
 
306 aa  109  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4318  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.29 
 
 
322 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0871118  normal  0.0590725 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2475  monosaccharide-transporting ATPase  28.74 
 
 
321 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.498676  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3265  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.71 
 
 
311 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0610984  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0867  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.9 
 
 
330 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000788488 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2435  ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein  29.07 
 
 
316 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.919395  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06143  D-ribose transporter subunit RbsB  28.43 
 
 
292 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1486  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.2 
 
 
342 aa  107  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2666  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.05 
 
 
372 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.157111  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2147  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.41 
 
 
313 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0159332  normal  0.228113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1401  ribose ABC transporter, substrate binding protein  26.64 
 
 
315 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2160  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.49 
 
 
301 aa  106  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22710  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.74 
 
 
308 aa  106  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0934818  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2837  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.93 
 
 
309 aa  105  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.165899  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2059  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.56 
 
 
313 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000339  ribose ABC transport system ribose-binding protein RbsB  28.09 
 
 
292 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2790  bifunctional carbohydrate binding and transport protein  31.38 
 
 
312 aa  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.614175 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3058  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.05 
 
 
370 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062327 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0008  D-ribose transporter subunit RbsB  31.4 
 
 
294 aa  104  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3490  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  28.38 
 
 
309 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.70516  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3071  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.59 
 
 
309 aa  103  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.636476  normal  0.77485 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0343  D-ribose transporter subunit RbsB  30.61 
 
 
292 aa  103  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0398  periplasmic sugar binding protein-like protein  30.42 
 
 
365 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00152665  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26220  Periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator protein  27.36 
 
 
308 aa  103  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0517  D-ribose transporter subunit RbsB  28.68 
 
 
299 aa  103  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50320  ABC transporter substrate binding protein  28.85 
 
 
315 aa  102  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.193489  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4136  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.57 
 
 
322 aa  102  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2780  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.1 
 
 
351 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2824  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.1 
 
 
351 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0298901 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2807  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.1 
 
 
351 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104692  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4235  D-ribose transporter subunit RbsB  29.35 
 
 
295 aa  101  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000930744  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4525  D-ribose transporter subunit RbsB  29.35 
 
 
295 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00203677  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0500  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.38 
 
 
321 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00779206 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1369  D-ribose transporter subunit RbsB  29.96 
 
 
292 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4011  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.32 
 
 
319 aa  101  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4113  D-ribose transporter subunit RbsB  28.11 
 
 
296 aa  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.114782  normal  0.0406773 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2685  Monosaccharide-transporting ATPase  29.66 
 
 
306 aa  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.450778  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2806  transcriptional regulator, periplasmic binding protein of LacI family protein  27.69 
 
 
313 aa  101  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4229  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.81 
 
 
318 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2906  Monosaccharide-transporting ATPase  30.92 
 
 
308 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0655902 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4768  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.25 
 
 
318 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.379262  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4039  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.49 
 
 
318 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2073  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.14 
 
 
313 aa  100  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.269264  hitchhiker  0.00000246592 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4898  D-ribose transporter subunit RbsB  27.27 
 
 
296 aa  100  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00612951  hitchhiker  0.000000869292 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0577  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.77 
 
 
358 aa  100  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.130999  normal  0.503483 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1986  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.14 
 
 
313 aa  100  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277686  normal  0.0546729 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1988  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.14 
 
 
313 aa  100  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188386  hitchhiker  0.000242477 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4112  putative sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein ABC transporter  26.34 
 
 
340 aa  99.8  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2861  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.34 
 
 
309 aa  99.4  8e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00405542  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4489  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.68 
 
 
334 aa  99.4  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  decreased coverage  0.000667621 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2124  Monosaccharide-transporting ATPase  26.98 
 
 
316 aa  99.4  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2781  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.34 
 
 
349 aa  99  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2825  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.34 
 
 
349 aa  99  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.0535027 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2808  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.34 
 
 
349 aa  99  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122332  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03582  hypothetical protein  27.4 
 
 
296 aa  99  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00518541  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4119  D-ribose transporter subunit RbsB  27.4 
 
 
296 aa  99  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.161287 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4172  D-ribose transporter subunit RbsB  29.51 
 
 
296 aa  98.6  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000287299  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3967  D-ribose transporter subunit RbsB  27.4 
 
 
294 aa  99  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.56483  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4267  D-ribose transporter subunit RbsB  27.4 
 
 
294 aa  99  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00505283  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4540  ABC transporter substrate-binding protein  32.93 
 
 
344 aa  99  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.695215 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4243  D-ribose transporter subunit RbsB  27.4 
 
 
296 aa  99  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00260164 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>