101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1833 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1833  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 274 aa  563  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0887778  normal  0.832681 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1479  helix-turn-helix domain-containing protein  34.63 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0993365  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1835  helix-turn-helix domain-containing protein  28.88 
 
 		 277 aa  93.6  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140482  normal  0.818318 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  26.16 
 
 		 274 aa  89.7  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  25.88 
 
 		 277 aa  87.4  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0433  transcriptional regulator, AraC family  24.81 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1097  AraC family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1643  transcriptional regulator, AraC family  30.73 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  23.38 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.5 
 
 		 260 aa  67  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1224  Helix-turn-helix, AraC domain protein  25.44 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0575  transcriptional regulator, AraC family  26.12 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1684  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  34.62 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.465215  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  25.58 
 
 		 244 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1969  transcriptional regulator, AraC family  28.28 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0909841  normal  0.074502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2695  transcriptional regulator, AraC family  25.57 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0816587  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  26.6 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7200  AraC family transcriptional regulator  22.6 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1304  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.73 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.407333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  28.7 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  24.38 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4694  AraC family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1931  helix-turn-helix, AraC type  27.6 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3275  transcriptional regulator, AraC family  25.11 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  23.4 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3509  transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.551098  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0825  AraC family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0546  AraC family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6449  AraC family transcriptional regulator  20 
 
 		 239 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  27.97 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  26.71 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5791  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1310  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 244 aa  57  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2483  AraC family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3512  AraC family transcriptional regulator  21.66 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0099  transcriptional regulator, AraC family  28.91 
 
 		 287 aa  55.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0497  helix-turn-helix domain-containing protein  27.36 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.516029  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2016  transcriptional regulator, AraC family  24.52 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5627  transcriptional regulator, AraC family  26.47 
 
 		 256 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0030  transcriptional regulator, AraC family  23.14 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2325  Helix-turn-helix, AraC domain protein  34 
 
 		 249 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0165435  normal  0.523007 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1440  transcriptional regulator, AraC family  26.32 
 
 		 275 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0651  transcriptional regulator, AraC family  24.65 
 
 		 290 aa  54.3  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8641  transcriptional regulator  23.81 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 271 aa  53.9  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0579  transcriptional regulator, AraC family  25.98 
 
 		 257 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2660  transcriptional regulator, AraC family  23.94 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  24.56 
 
 		 260 aa  53.9  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000237  transcriptional regulator AraC family  24.03 
 
 		 246 aa  53.9  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  26.16 
 
 		 279 aa  53.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  29.79 
 
 		 268 aa  52.8  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0749  hypothetical protein  23.79 
 
 		 271 aa  52.8  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  25.93 
 
 		 272 aa  52.4  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1886  transcriptional regulator, AraC family  38.75 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.979359  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4467  helix-turn-helix domain-containing protein  24.63 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0353023 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4542  Helix-turn-helix, AraC domain protein  25 
 
 		 265 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6058  transcriptional regulator, AraC family  20.6 
 
 		 291 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0979  transcriptional regulator, AraC family  26.92 
 
 		 279 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal  0.0613388 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1733  helix-turn-helix domain-containing protein  24.14 
 
 		 305 aa  50.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0271524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2329  AraC family transcriptional regulator  22.45 
 
 		 310 aa  49.3  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5120  transcriptional regulator, AraC family  26.36 
 
 		 275 aa  49.3  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.282168 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1925  transcriptional regulator  31.13 
 
 		 252 aa  49.3  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5257  transcriptional regulator, AraC family  22.88 
 
 		 289 aa  49.3  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2824  helix-turn-helix domain-containing protein  32.65 
 
 		 251 aa  49.3  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0253929  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6750  transcriptional regulator, AraC family  26.05 
 
 		 327 aa  48.9  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2622  AraC family transcriptional regulator  26 
 
 		 228 aa  48.9  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0370  AraC family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 281 aa  48.5  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1278  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.07 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.711886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2143  Helix-turn-helix, AraC domain protein  28.79 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4151  transcriptional regulator, AraC family  31.71 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0354643  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1671  Helix-turn-helix, AraC domain protein  23.26 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1632  AraC family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 291 aa  47  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0196517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2463  helix-turn-helix domain-containing protein  27.71 
 
 		 257 aa  47  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1713  AraC family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 286 aa  47  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2737  AraC family transcriptional regulator  21.08 
 
 		 262 aa  46.6  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0062511  hitchhiker  0.000065853 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2350  transcriptional regulator, AraC family  30.34 
 
 		 263 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0397043 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3305  transcriptional regulator, AraC family  22.22 
 
 		 271 aa  46.2  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000908006 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4893  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 340 aa  45.8  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6610  AraC family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 277 aa  45.8  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  29 
 
 		 255 aa  45.8  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2672  transcriptional regulator, AraC family  32.04 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3491  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  18.34 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.873447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1375  transcriptional regulator, AraC family  27.37 
 
 		 275 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.372829  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6191  transcriptional regulator, AraC family  23.2 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2318  AraC family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4320  AraC family transcriptional regulator  21.72 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400643  normal  0.300736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1962  transcriptional regulator, AraC family  24.34 
 
 		 271 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3502  transcriptional regulator, AraC family  27.96 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3504  transcriptional regulator, AraC family  23.6 
 
 		 281 aa  43.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0678  AraC family transcriptional regulator  21.85 
 
 		 295 aa  43.5  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2202  transcriptional regulator, AraC family  24.3 
 
 		 287 aa  43.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3448  transcriptional regulator, AraC family  23.53 
 
 		 281 aa  43.5  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327362  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4318  transcriptional regulator, AraC family  24.18 
 
 		 267 aa  43.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.642666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0782  AraC family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 131 aa  43.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2108  transcriptional regulator, AraC family  29.89 
 
 		 263 aa  42.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0188933 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1656  transcriptional regulator, AraC family  26.88 
 
 		 273 aa  42.7  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0328818 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>