More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1819 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1819  ABC transporter related  100 
 
 
253 aa  512  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2940  ABC transporter related  69.48 
 
 
255 aa  359  3e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0524506  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1520  ABC transporter related  69.96 
 
 
270 aa  358  4e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0909  ABC transporter related  70.33 
 
 
248 aa  354  7.999999999999999e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.179486  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4099  ABC transporter related  66.67 
 
 
251 aa  331  5e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3361  ABC transporter related  63.64 
 
 
247 aa  312  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280372  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0988  ABC transporter-related protein  62.4 
 
 
247 aa  312  3.9999999999999997e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0027  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  61.98 
 
 
254 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0575  ABC transporter related  62.29 
 
 
248 aa  306  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3906  ABC transporter related  61.57 
 
 
250 aa  306  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01742  amino-acid composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  61.57 
 
 
247 aa  303  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.823741  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3510  ABC transporter-related protein  61.98 
 
 
247 aa  303  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0093  ABC transporter related  60 
 
 
252 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.899173  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3274  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  60.57 
 
 
251 aa  300  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.760616  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0083  ABC transporter related  59.6 
 
 
252 aa  300  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4656  ABC transporter related  61.16 
 
 
247 aa  300  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.114918 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0803  ABC transporter related  60.42 
 
 
252 aa  300  2e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4524  ABC transporter related  61.16 
 
 
247 aa  300  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180068  normal  0.792034 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0092  ABC transporter related  60.57 
 
 
251 aa  298  5e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.65269  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2963  ABC transporter related  60.16 
 
 
251 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0092  ABC transporter related  60.16 
 
 
251 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0191  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.48 
 
 
251 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.148253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4057  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.48 
 
 
251 aa  295  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0109  ABC transporter related  59.76 
 
 
251 aa  295  5e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2943  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.07 
 
 
251 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1600  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60 
 
 
252 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671798  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3002  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.07 
 
 
251 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3368  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.07 
 
 
251 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0695  ABC transporter related  57.38 
 
 
252 aa  291  5e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.321828  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3040  ABC transporter related  58.06 
 
 
253 aa  291  6e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0266  ABC transporter related  59.41 
 
 
249 aa  290  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3890  ABC transporter related  57.2 
 
 
255 aa  289  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563961  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3983  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.25 
 
 
251 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3321  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58 
 
 
252 aa  289  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4631  ABC transporter related  62.55 
 
 
241 aa  289  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723682  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0778  ABC transporter related  62.13 
 
 
241 aa  288  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113362  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1507  ABC transporter related  59.75 
 
 
243 aa  285  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3234  ABC transporter related  57.37 
 
 
248 aa  281  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171288  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3247  putative high-affinity branched-chain amino acid transport protein, ATP binding protein  63.88 
 
 
231 aa  280  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2873  ABC transporter related  59.83 
 
 
252 aa  280  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.296726  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2319  ABC transporter related protein  55.6 
 
 
249 aa  279  3e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1890  ABC transporter related  58.47 
 
 
239 aa  278  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.865524  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1227  ABC transporter related  58.82 
 
 
243 aa  277  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0998  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  57.08 
 
 
271 aa  277  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1325  ABC transporter-like protein  55.19 
 
 
243 aa  276  3e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0593111 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1993  ABC transporter related  58.9 
 
 
239 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.535094  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7087  ABC transporter, ATP-binding protein  57.81 
 
 
241 aa  272  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3573  ABC transporter related  58.05 
 
 
239 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.402201 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5330  ABC transporter related  57.5 
 
 
251 aa  268  7e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.240884  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2426  ABC transporter-related protein  56.84 
 
 
249 aa  266  2e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  53.16 
 
 
237 aa  247  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  54.04 
 
 
235 aa  246  3e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  51.03 
 
 
247 aa  244  6.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  49.79 
 
 
239 aa  244  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0479  ABC transporter related protein  51.28 
 
 
231 aa  242  3e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000373417  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  50.62 
 
 
265 aa  242  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  50.62 
 
 
247 aa  241  7e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  51.27 
 
 
237 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.49 
 
 
234 aa  241  9e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  49.36 
 
 
234 aa  240  1e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  51.44 
 
 
247 aa  240  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  51.49 
 
 
234 aa  240  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.84 
 
 
247 aa  240  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  52.32 
 
 
239 aa  240  2e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  50.82 
 
 
242 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  51.49 
 
 
235 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3818  ABC transporter related  49.58 
 
 
253 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0166098  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  52.52 
 
 
238 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  51.9 
 
 
239 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  51.44 
 
 
247 aa  238  6.999999999999999e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  49.79 
 
 
264 aa  238  8e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0113  ABC transporter related  51.27 
 
 
236 aa  238  8e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  51.9 
 
 
236 aa  238  9e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3007  ABC transporter-related protein  47.72 
 
 
258 aa  237  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0515162  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  51.49 
 
 
245 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0762  ABC transporter-related protein  48.56 
 
 
241 aa  238  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000284565 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  50 
 
 
242 aa  237  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  48.09 
 
 
236 aa  237  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0335  ABC transporter related  52.21 
 
 
249 aa  236  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1115  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.43 
 
 
231 aa  236  3e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3709  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  53.88 
 
 
244 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561977  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  50.62 
 
 
247 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  51.27 
 
 
234 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  52.77 
 
 
235 aa  235  6e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  51.28 
 
 
237 aa  234  7e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  50.21 
 
 
247 aa  234  9e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3361  ABC transporter related  49.79 
 
 
242 aa  234  9e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  50.63 
 
 
238 aa  234  9e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3518  ABC transporter related  52.3 
 
 
240 aa  234  9e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  52.34 
 
 
233 aa  234  9e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4056  ABC transporter related  51.87 
 
 
240 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2709  ABC transporter related  49.79 
 
 
242 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20640  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  47.88 
 
 
239 aa  233  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.171574  normal  0.883119 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  52.34 
 
 
238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  50.42 
 
 
237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  51.26 
 
 
249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0912  ABC transporter related  53.06 
 
 
244 aa  233  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  48.58 
 
 
247 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  52.77 
 
 
244 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  48.58 
 
 
247 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>