More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1698 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
448 aa  912    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00759671  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1660  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.9 
 
 
451 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1682  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.9 
 
 
451 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.747215  normal  0.719236 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1645  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.9 
 
 
451 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.55741  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2514  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.43 
 
 
449 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000164023 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2698  DEAD/DEAH box helicase domain protein  60.9 
 
 
451 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029027  hitchhiker  0.0000852127 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2838  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  59.1 
 
 
449 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2444  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.2 
 
 
449 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000483539 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2445  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.24 
 
 
451 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.959093  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1537  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.81 
 
 
449 aa  513  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.713304  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3053  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.08 
 
 
447 aa  511  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.643926  normal  0.011472 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1417  DEAD/DEAH box helicase-like protein  57.17 
 
 
468 aa  512  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0306268  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2606  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.1 
 
 
449 aa  512  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.581519  hitchhiker  0.0000000487661 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1594  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  62.83 
 
 
465 aa  509  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.509668  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.79 
 
 
460 aa  501  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000327397 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1273  DEAD/DEAH box helicase-like protein  57.08 
 
 
456 aa  501  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163925 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3215  putative ATP-dependent RNA helicase SrmB  56.85 
 
 
448 aa  500  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.571925  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001255  ATP-dependent RNA helicase  55.98 
 
 
443 aa  499  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2624  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  62.24 
 
 
448 aa  500  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.394652  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0076  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  60.95 
 
 
452 aa  495  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000113664  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0882  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  57.18 
 
 
439 aa  488  1e-137  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.18261  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05125  ATP-dependent RNA helicase  55.71 
 
 
447 aa  483  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1618  DEAD/DEAH box helicase-like  54.57 
 
 
447 aa  457  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0657  ATP-dependent RNA helicase  53.05 
 
 
450 aa  452  1.0000000000000001e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01939  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  45.77 
 
 
441 aa  389  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0271466  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0368  putative ATP-dependent RNA helicase  44.31 
 
 
435 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00019163  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.27 
 
 
430 aa  332  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0439  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.33 
 
 
441 aa  325  8.000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0491  ATP-dependent RNA helicase RhlE  44.55 
 
 
450 aa  323  3e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.14662  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2564  DEAD/DEAH box helicase-like protein  44.53 
 
 
634 aa  323  3e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.347829  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0919  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  44.28 
 
 
632 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0370  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.79 
 
 
453 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000976473  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3043  DEAD/DEAH box helicase-like  45.26 
 
 
452 aa  320  5e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000626056  normal  0.930079 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0952  putative ATP-dependent RNA helicase protein  43.41 
 
 
608 aa  317  3e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.850051  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0894  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.57 
 
 
627 aa  316  5e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0823  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.57 
 
 
627 aa  316  6e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.3 
 
 
454 aa  316  6e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.208353  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1367  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.58 
 
 
556 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.871756 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2815  DEAD/DEAH box helicase  44.79 
 
 
533 aa  312  6.999999999999999e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.386188  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1799  DEAD/DEAH box helicase-like  42.89 
 
 
472 aa  310  2e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0187  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.54 
 
 
453 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0169  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.54 
 
 
449 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000249286 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2485  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.82 
 
 
542 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375937  hitchhiker  0.000530427 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1948  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.73 
 
 
512 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1652  putative ATP-dependent RNA helicase  42.82 
 
 
537 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0851991  normal  0.031328 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2079  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.73 
 
 
512 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394714  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5356  DEAD/DEAH box helicase  42.86 
 
 
516 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.157646 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.24 
 
 
514 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.632287 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2047  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43 
 
 
516 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6030  DEAD/DEAH box helicase-like  43 
 
 
516 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1258  DEAD/DEAH box helicase-like protein  42.63 
 
 
456 aa  300  4e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.410672 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1999  ATP-dependent RNA helicase RhlE  42.26 
 
 
482 aa  299  6e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605501  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1584  ATP-dependent RNA helicase RhlE, putative  42.26 
 
 
516 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.958576  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2086  DEAD/DEAH box helicase  42.26 
 
 
516 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757912  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2612  ATP-dependent RNA helicase  42.26 
 
 
529 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3226  putative ATP-dependent RNA helicase RhlE  42.26 
 
 
516 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2523  DEAD/DEAH box helicase  42.26 
 
 
513 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239801  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2468  DEAD/DEAH box helicase  42.26 
 
 
514 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1359  DEAD/DEAH box helicase  42.26 
 
 
516 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.635166  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1230  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.01 
 
 
505 aa  296  5e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.802286  normal  0.130037 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1379  DEAD/DEAH box helicase-like  43.04 
 
 
552 aa  292  7e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3284  ATP-dependent RNA helicase SrmB  39.85 
 
 
412 aa  286  7e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2918  putative ATP-dependent RNA helicase  40.44 
 
 
516 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.616126  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1082  ATP-dependent DEAD/DEAH box RNA-helicase  41.99 
 
 
567 aa  283  4.0000000000000003e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0659  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.64 
 
 
500 aa  281  1e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19120  ATP-dependent DEAD/DEAH box helicase  39.81 
 
 
439 aa  280  4e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  38.77 
 
 
425 aa  280  5e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.121425 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1197  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.38 
 
 
482 aa  280  5e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.174751 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.37 
 
 
516 aa  279  8e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3252  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.81 
 
 
504 aa  279  8e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0717985  normal  0.458029 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3711  putative ATP-dependent RNA helicase  39.16 
 
 
436 aa  277  3e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0132588  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3827  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.22 
 
 
452 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141763  normal  0.273496 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1733  DEAD/DEAH box helicase  39.76 
 
 
477 aa  276  5e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210981  normal  0.24417 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2742  ATP-dependent RNA helicase SrmB  40.84 
 
 
613 aa  276  6e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4532  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  38.48 
 
 
440 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1378  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.48 
 
 
453 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512002  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4039  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.96 
 
 
453 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.541201 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2618  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.95 
 
 
439 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000143919  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19290  putative ATP-dependent RNA helicase  39.71 
 
 
446 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0359  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.76 
 
 
453 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.992502  normal  0.993295 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1342  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.57 
 
 
426 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2527  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.75 
 
 
502 aa  273  4.0000000000000004e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0263323 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1661  putative ATP-dependent RNA helicase  40.26 
 
 
441 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1150  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.68 
 
 
418 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3679  ATP-dependent RNA helicase SrmB  38.64 
 
 
441 aa  273  5.000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0397087  normal  0.205211 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1433  ATP-dependent RNA helicase RhlE  40.68 
 
 
418 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.858886  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2015  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.68 
 
 
493 aa  272  7e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.73004  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5283  DEAD/DEAH box helicase-like  40 
 
 
622 aa  272  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0828  ATP-dependent RNA helicase RhlE  39.79 
 
 
482 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00138839  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1201  DEAD/DEAH box helicase  39.79 
 
 
482 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1193  DEAD/DEAH box helicase  39.79 
 
 
481 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1917  ATP-dependent RNA helicase RhlE  39.79 
 
 
482 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0135106  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3791  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  36.74 
 
 
445 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.138512  hitchhiker  0.00122531 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0899  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  39.74 
 
 
537 aa  271  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3601  ATP-dependent RNA helicase SrmB  38.41 
 
 
441 aa  271  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1352  putative ATP-dependent RNA helicase 2  39.79 
 
 
559 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.051549  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1040  DEAD/DEAH box helicase  39.79 
 
 
482 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.33431  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0981  ATP-dependent RNA helicase RhlE  39.68 
 
 
571 aa  271  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0323  DEAD/DEAH box helicase  39.79 
 
 
482 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0723689  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.68 
 
 
480 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0181544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>