53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1670 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1670  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 526 aa  1070    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000434789  normal  0.249137 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3184  outer membrane efflux protein  48.59 
 
 		 515 aa  472  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.911982 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0564  outer membrane efflux protein  38.82 
 
 		 502 aa  347  3e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0469  outer membrane efflux protein  38.82 
 
 		 502 aa  347  4e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0676  outer membrane efflux protein  37.9 
 
 		 516 aa  340  5e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773648  hitchhiker  0.0000779831 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0483  outer membrane efflux protein  38.45 
 
 		 502 aa  339  7e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.219911  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0393  outer membrane efflux protein  37.72 
 
 		 502 aa  334  2e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0161  Outer membrane efflux protein  37.3 
 
 		 504 aa  332  8e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.467001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0420  outer membrane efflux protein  33.76 
 
 		 552 aa  301  3e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0368  Outer membrane protein-like  36.59 
 
 		 609 aa  293  4e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0297  outer membrane efflux protein  35.17 
 
 		 537 aa  286  9e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0329394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2053  hypothetical protein  34.06 
 
 		 605 aa  281  3e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.13895  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0906  hypothetical protein  33.27 
 
 		 600 aa  266  5.999999999999999e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0678  hypothetical protein  31.09 
 
 		 595 aa  261  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5408  putative efflux outer membrane protein  33.4 
 
 		 506 aa  256  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3076  outer membrane efflux protein  31.35 
 
 		 502 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3737  outer membrane efflux protein  31.04 
 
 		 496 aa  230  5e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1150  outer membrane efflux protein  30.57 
 
 		 746 aa  227  5.0000000000000005e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1740  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.48 
 
 		 517 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1710  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  25.33 
 
 		 519 aa  57  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.733437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  22.58 
 
 		 467 aa  55.5  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6455  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.29 
 
 		 516 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.220531 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2606  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  21.94 
 
 		 478 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0037798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0329  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23 
 
 		 472 aa  49.7  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2864  outer membrane efflux protein  23.51 
 
 		 476 aa  49.3  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0121  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  21.5 
 
 		 469 aa  48.9  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3265  outer membrane efflux protein  23.51 
 
 		 476 aa  49.3  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3709  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.29 
 
 		 485 aa  48.9  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3169  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.73 
 
 		 471 aa  48.9  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.228737  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0391  Outer membrane efflux family protein  25.99 
 
 		 437 aa  47.4  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1666  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.9 
 
 		 546 aa  46.6  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3466  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.82 
 
 		 461 aa  46.2  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  33.33 
 
 		 446 aa  45.8  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.95 
 
 		 470 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1085  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.86 
 
 		 486 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.377293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1977  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  29.56 
 
 		 465 aa  45.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0822  outer membrane efflux family protein  21.51 
 
 		 472 aa  44.7  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5505  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.71 
 
 		 496 aa  44.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0649  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.71 
 
 		 496 aa  44.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.814679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0007  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.88 
 
 		 465 aa  43.9  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000120725  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1267  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  23.58 
 
 		 512 aa  44.3  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0522165  normal  0.0121166 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2297  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.64 
 
 		 634 aa  44.3  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0952  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.64 
 
 		 634 aa  44.3  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2105  Outer membrane protein  27.24 
 
 		 574 aa  43.9  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275801  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2164  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  26.64 
 
 		 634 aa  43.9  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1054  outer membrane efflux protein  24.3 
 
 		 514 aa  43.9  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000452487  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1994  outer membrane efflux protein  21.09 
 
 		 495 aa  43.5  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.184092  normal  0.0261874 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0802  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.66 
 
 		 476 aa  43.5  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.102308  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0827  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.34 
 
 		 483 aa  43.5  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00460212  hitchhiker  0.00000000259986 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  24.76 
 
 		 462 aa  43.5  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3454  outer membrane efflux protein  26.11 
 
 		 477 aa  43.5  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00515771  hitchhiker  0.00444269 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3237  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.94 
 
 		 461 aa  43.5  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2193  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.59 
 
 		 495 aa  43.5  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0126086  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>