More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1527 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1527  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
714 aa  1473    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.698269  normal  0.163231 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2461  TonB-dependent siderophore receptor  43.88 
 
 
713 aa  580  1e-164  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01148  TonB-dependent outer membrane Receptor  44.53 
 
 
708 aa  578  1.0000000000000001e-163  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0846293  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0391  TonB-dependent siderophore receptor  42.42 
 
 
712 aa  532  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.196206  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  40.99 
 
 
742 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  40.28 
 
 
742 aa  521  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  39.08 
 
 
738 aa  520  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  39.62 
 
 
749 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  39.77 
 
 
740 aa  505  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  39.62 
 
 
748 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  39.62 
 
 
748 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  38.52 
 
 
737 aa  498  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1142  TonB-dependent siderophore receptor  38.81 
 
 
711 aa  473  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.634377  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  27.85 
 
 
850 aa  241  4e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  26.69 
 
 
710 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  26.42 
 
 
708 aa  239  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.88 
 
 
711 aa  238  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  27.02 
 
 
711 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  27.56 
 
 
814 aa  234  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  28.93 
 
 
736 aa  231  3e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  26.81 
 
 
709 aa  228  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  26.9 
 
 
708 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  26.88 
 
 
824 aa  224  6e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3331  TonB-dependent siderophore receptor  28.31 
 
 
766 aa  222  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153274  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  29.33 
 
 
815 aa  221  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  29.26 
 
 
722 aa  219  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  28.08 
 
 
703 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 
794 aa  218  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  28.32 
 
 
789 aa  215  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  27.89 
 
 
817 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  26.9 
 
 
703 aa  213  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  26.02 
 
 
710 aa  212  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  26.27 
 
 
712 aa  212  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 
820 aa  210  6e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  27.15 
 
 
860 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  27.99 
 
 
825 aa  208  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  27.82 
 
 
726 aa  208  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  28.09 
 
 
701 aa  207  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  27.31 
 
 
825 aa  206  9e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  25.99 
 
 
843 aa  206  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  27.53 
 
 
859 aa  205  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  28.59 
 
 
837 aa  205  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  27.82 
 
 
726 aa  203  7e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  27.58 
 
 
696 aa  203  8e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  27.72 
 
 
692 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  27.72 
 
 
701 aa  201  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  26.14 
 
 
799 aa  201  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  27.84 
 
 
821 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  25.64 
 
 
689 aa  201  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  27.56 
 
 
779 aa  200  6e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 
696 aa  200  6e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  26.45 
 
 
708 aa  200  7e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  26.85 
 
 
701 aa  200  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  24.87 
 
 
732 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  27.3 
 
 
705 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  25.33 
 
 
703 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  26.74 
 
 
713 aa  198  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0909  ferrioxamine B receptor  25.88 
 
 
716 aa  197  4.0000000000000005e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  28.05 
 
 
706 aa  196  9e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  27.39 
 
 
710 aa  195  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  25.89 
 
 
808 aa  195  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  24.62 
 
 
736 aa  194  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  28.43 
 
 
822 aa  194  5e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  25.62 
 
 
709 aa  194  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  27.12 
 
 
743 aa  194  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  24.59 
 
 
714 aa  194  6e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  25.58 
 
 
689 aa  194  7e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06299  hypothetical protein  26.85 
 
 
715 aa  194  7e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  27 
 
 
828 aa  193  9e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  25.78 
 
 
689 aa  193  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  25.23 
 
 
738 aa  193  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  24.28 
 
 
734 aa  192  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  26.11 
 
 
701 aa  192  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  26.96 
 
 
819 aa  192  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  26.61 
 
 
809 aa  191  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  26.85 
 
 
796 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  27.31 
 
 
723 aa  188  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  27.13 
 
 
722 aa  188  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  26.32 
 
 
757 aa  188  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  27.17 
 
 
724 aa  188  4e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  27.17 
 
 
724 aa  187  7e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  26.96 
 
 
705 aa  187  7e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  27.38 
 
 
726 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0008  TonB-dependent siderophore receptor  25.39 
 
 
713 aa  186  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000108759 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  26.49 
 
 
733 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  26.02 
 
 
722 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0974  TonB-dependent siderophore receptor  24.39 
 
 
737 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.930305 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  25.99 
 
 
696 aa  185  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  27.02 
 
 
745 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1045  TonB-dependent siderophore receptor  28 
 
 
699 aa  185  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616371  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  27.78 
 
 
702 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  27.78 
 
 
702 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  25.88 
 
 
740 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  26.66 
 
 
796 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  26.08 
 
 
717 aa  184  5.0000000000000004e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  25.73 
 
 
721 aa  184  7e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1876  TonB-dependent siderophore receptor  27.23 
 
 
744 aa  183  8.000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.0292257 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  26.59 
 
 
791 aa  183  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  26.35 
 
 
795 aa  183  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1595  TonB-dependent siderophore receptor  27.38 
 
 
744 aa  182  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  0.0988814 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>