38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1442 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1442  MOSC domain-containing protein  100 
 
 
158 aa  322  1e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1811  MOSC  45.21 
 
 
158 aa  142  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98215  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4639  MOSC domain containing protein  35.85 
 
 
163 aa  102  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3206  MOSC domain containing protein  33.97 
 
 
200 aa  100  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0881785  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3073  MOSC domain containing protein  39.33 
 
 
153 aa  100  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1460  hypothetical protein  40 
 
 
160 aa  87.8  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00774  mosc  36.72 
 
 
151 aa  78.6  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00950006  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0530  alpha amylase domain-containing protein  33.09 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1008  MOSC  38.46 
 
 
181 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1741  MOSC domain-containing protein  37.5 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.296315  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1758  MOSC domain containing protein  36.17 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.175574  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4111  putative sulferase  30.61 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.641133  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3575  hypothetical protein  33.33 
 
 
190 aa  70.9  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1526  MOSC domain containing protein  31.51 
 
 
178 aa  68.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0106  hypothetical protein  30.67 
 
 
190 aa  67.8  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1294  hypothetical protein  37.69 
 
 
176 aa  67.4  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247549  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2516  MOSC  37.7 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406281  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7200  MOSC domain-containing protein  29.63 
 
 
167 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1459  MOSC domain-containing protein  27.14 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.126815 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0082  MOSC domain-containing protein  31.87 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4294  hypothetical protein  30.82 
 
 
197 aa  63.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.17157  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4829  MOSC  29.73 
 
 
175 aa  62  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142865  normal  0.399285 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5926  hypothetical protein  33.57 
 
 
189 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0229267  normal  0.231206 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0791  MOSC  29.25 
 
 
177 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2927  hypothetical protein  36.72 
 
 
165 aa  57.8  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113815  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2906  MOSC domain containing protein  26.39 
 
 
167 aa  57.4  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58850  hypothetical protein  28 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.111042 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4831  hypothetical protein  32.12 
 
 
189 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.000000085919  hitchhiker  0.00670464 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0265  MOSC domain containing protein  29.41 
 
 
184 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798311  normal  0.0276593 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5172  hypothetical protein  28 
 
 
146 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0919  MOSC domain protein  27.89 
 
 
174 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0767  MOSC domain-containing protein  27.21 
 
 
182 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2412  MOSC domain-containing protein  26.32 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.255229  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2719  MOSC domain-containing protein  26.13 
 
 
148 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.005456  normal  0.132425 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2674  MOSC domain-containing protein  26.13 
 
 
148 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216386  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2705  MOSC domain-containing protein  26.13 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.705945  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0007  MOSC domain-containing protein  28.43 
 
 
206 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.278634  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2447  hypothetical protein  30.51 
 
 
187 aa  43.9  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.537217  decreased coverage  0.0000000310841 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>