50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1422 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1422  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  244  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.6699 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003821  hypothetical protein  42.73 
 
 
129 aa  99  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0228492  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01861  hypothetical protein  40.91 
 
 
129 aa  96.7  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1019  hypothetical protein  40.65 
 
 
128 aa  93.2  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00054643  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0614  hypothetical protein  42.42 
 
 
128 aa  92.8  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1354  hypothetical protein  36.94 
 
 
128 aa  90.9  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2974  hypothetical protein  41.11 
 
 
132 aa  90.1  8e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.534779  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1205  hypothetical protein  43.33 
 
 
125 aa  89.4  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.069384  hitchhiker  0.000375223 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3147  hypothetical protein  36.89 
 
 
126 aa  87  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00243141  normal  0.887855 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1166  hypothetical protein  36.89 
 
 
126 aa  87  7e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.599086  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1243  hypothetical protein  36.89 
 
 
126 aa  87  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.442213  normal  0.338722 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1210  hypothetical protein  36.89 
 
 
126 aa  87  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0293  hypothetical protein  36.36 
 
 
130 aa  86.3  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000415499  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2813  hypothetical protein  36.61 
 
 
128 aa  86.3  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.215215  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1097  hypothetical protein  39.81 
 
 
123 aa  85.5  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0458042  hitchhiker  0.00682906 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3065  hypothetical protein  37.25 
 
 
126 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0335891  decreased coverage  0.0000000160498 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3246  hypothetical protein  39.13 
 
 
135 aa  85.9  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1291  hypothetical protein  40.78 
 
 
184 aa  85.9  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0987  hypothetical protein  39.81 
 
 
126 aa  85.1  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.411283  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0845  hypothetical protein  35.25 
 
 
150 aa  84.3  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.567455 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2887  hypothetical protein  36.27 
 
 
126 aa  83.6  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.884859  hitchhiker  0.00000327359 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2969  hypothetical protein  36.27 
 
 
126 aa  83.6  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.092913  unclonable  0.0000376275 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1306  hypothetical protein  36.27 
 
 
113 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1125  hypothetical protein  34.31 
 
 
126 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0604212  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01018  hypothetical protein  40.78 
 
 
116 aa  79  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000655555  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1760  hypothetical protein  34.75 
 
 
130 aa  77  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0395  hypothetical protein  38.32 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0369  hypothetical protein  33.33 
 
 
127 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0352181  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0390  hypothetical protein  32.65 
 
 
127 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2422  hypothetical protein  32.73 
 
 
130 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1711  hypothetical protein  33.33 
 
 
116 aa  59.7  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1921  hypothetical protein  26.73 
 
 
122 aa  56.6  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.105576  normal  0.743807 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0867  hypothetical protein  30.91 
 
 
131 aa  55.1  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000349479  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02428  hypothetical protein  33.33 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02381  hypothetical protein  32.69 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003401  hypothetical protein  31.73 
 
 
117 aa  50.4  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000284049  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2943  hypothetical protein  32.35 
 
 
135 aa  50.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869989  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2631  hypothetical protein  30.23 
 
 
119 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000548567  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2706  hypothetical protein  30.23 
 
 
119 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000140382  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1754  hypothetical protein  30.23 
 
 
119 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000786654  hitchhiker  0.00155716 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2592  hypothetical protein  30.23 
 
 
119 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000971711  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1991  hypothetical protein  31.4 
 
 
119 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2342  hypothetical protein  31.4 
 
 
119 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000117371  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2270  hypothetical protein  31.4 
 
 
119 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0614903  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2460  hypothetical protein  31.4 
 
 
119 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000033516  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2265  hypothetical protein  25.88 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2718  hypothetical protein  27.66 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.145637 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2142  hypothetical protein  30 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000300583  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2317  hypothetical protein  30.23 
 
 
119 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000394227  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2314  hypothetical protein  23.96 
 
 
135 aa  40.4  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>