231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1386 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1386  major facilitator transporter  100 
 
 
570 aa  1149    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.863121  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4689  major facilitator transporter  47.42 
 
 
467 aa  449  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  0.0558767 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2270  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  46.7 
 
 
467 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248871  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6036  major facilitator superfamily MFS_1  46.7 
 
 
467 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.475953 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3829  major facilitator superfamily transporter  43.05 
 
 
547 aa  426  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257719  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4281  major facilitator superfamily MFS_1  41.96 
 
 
575 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4391  major facilitator superfamily MFS_1  41.96 
 
 
575 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.796533 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5340  MFS permease-like protein  42.78 
 
 
553 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4899  major facilitator transporter  42.61 
 
 
553 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0322  major facilitator transporter  42.69 
 
 
554 aa  421  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.41241  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4078  major facilitator superfamily oxalate/formate antiporter  44.27 
 
 
475 aa  420  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.801255  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4642  major facilitator transporter  42.17 
 
 
548 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1334  major facilitator transporter  42.02 
 
 
545 aa  417  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0620  major facilitator transporter  42.37 
 
 
549 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4006  major facilitator transporter  39.29 
 
 
550 aa  414  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0313  major facilitator transporter  42.35 
 
 
553 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0308  major facilitator transporter  42.18 
 
 
553 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00531015 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0288  major facilitator superfamily MFS_1  42.01 
 
 
553 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000241924 
 
 
-
 
NC_003296  RS02384  transporter transmembrane protein  40.95 
 
 
549 aa  410  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.458603 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4920  major facilitator transporter  42.61 
 
 
552 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0958503  hitchhiker  0.000474897 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6345  major facilitator superfamily permease  41.7 
 
 
551 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0404816  normal  0.0784492 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0490  major facilitator transporter  42.98 
 
 
537 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.685431  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2386  major facilitator transporter  41.9 
 
 
556 aa  407  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3633  major facilitator superfamily MFS_1  43.03 
 
 
552 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3578  major facilitator transporter  41.29 
 
 
553 aa  405  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0111  major facilitator superfamily MFS_1  41.31 
 
 
546 aa  403  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1307  major facilitator superfamily MFS_1  42.83 
 
 
538 aa  405  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0808  major facilitator superfamily MFS_1  40.89 
 
 
549 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2008  major facilitator transporter  44.92 
 
 
467 aa  405  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4093  MFS permease  42.01 
 
 
552 aa  405  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00470  integral membrane transporter  41.81 
 
 
558 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0394066  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3696  major facilitator superfamily MFS_1  39.76 
 
 
545 aa  391  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.662162  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3191  major facilitator superfamily MFS_1  40.1 
 
 
545 aa  391  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5500  major facilitator superfamily MFS_1  39.59 
 
 
545 aa  388  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1293  major facilitator transporter  41.81 
 
 
566 aa  383  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0986  major facilitator transporter  39.62 
 
 
556 aa  379  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32095  predicted protein  37.74 
 
 
679 aa  371  1e-101  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0961  major facilitator transporter  41.21 
 
 
463 aa  361  2e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4762  major facilitator superfamily MFS_1  41.25 
 
 
471 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1045  major facilitator superfamily MFS_1  40.46 
 
 
464 aa  353  4e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2301  major facilitator superfamily MFS_1  40.79 
 
 
518 aa  342  9e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3185  major facilitator superfamily MFS_1  39.05 
 
 
464 aa  336  7.999999999999999e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13430  nitrate/nitrite transporter  39.21 
 
 
507 aa  324  3e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0010455  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1158  major facilitator superfamily MFS_1  38.42 
 
 
448 aa  309  8e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.791207  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2808  major facilitator superfamily MFS_1  38.71 
 
 
456 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.018941 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1169  major facilitator superfamily MFS_1  37.79 
 
 
455 aa  296  5e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.968326  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  36.3 
 
 
433 aa  274  4.0000000000000004e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3922  major facilitator superfamily MFS_1  42.01 
 
 
552 aa  257  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92025  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  39.21 
 
 
421 aa  256  6e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  35.02 
 
 
413 aa  255  2.0000000000000002e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  34.95 
 
 
412 aa  245  9.999999999999999e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  32.54 
 
 
424 aa  224  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  31.25 
 
 
418 aa  214  3.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0769  oxalate:formate antiporter  33.19 
 
 
406 aa  212  1e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00153428  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0872  major facilitator superfamily MFS_1  33.84 
 
 
453 aa  193  8e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0593371  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0868  major facilitator superfamily MFS_1  33.19 
 
 
453 aa  193  8e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  40.95 
 
 
424 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  34.43 
 
 
411 aa  150  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 
425 aa  143  9e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  46.91 
 
 
397 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1890  major facilitator superfamily transporter  33.18 
 
 
424 aa  138  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00250834  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  45.03 
 
 
401 aa  135  3e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0820  major facilitator transporter  39.71 
 
 
453 aa  120  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  25.89 
 
 
442 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  26.85 
 
 
412 aa  118  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  26.35 
 
 
421 aa  117  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  24.68 
 
 
415 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 
421 aa  117  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2629  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 
465 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  34.22 
 
 
442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 
421 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3142  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 
434 aa  107  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2394  major facilitator superfamily MFS_1  24.12 
 
 
414 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000021703  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 
432 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1405  putative permease  26.91 
 
 
428 aa  103  6e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2490  oxalate/formate antiporter, putative  24.55 
 
 
455 aa  103  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  24.89 
 
 
432 aa  102  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  24.89 
 
 
432 aa  102  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  25.73 
 
 
410 aa  100  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  26.54 
 
 
412 aa  100  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  25.39 
 
 
412 aa  99.4  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  35.33 
 
 
408 aa  97.4  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 
407 aa  97.4  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 
407 aa  97.1  8e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2465  major facilitator transporter  24.94 
 
 
454 aa  97.1  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  36.6 
 
 
432 aa  95.5  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 
411 aa  94  6e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0904  major facilitator superfamily MFS_1  33.55 
 
 
393 aa  94  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1032  putative oxalate/formate antiporter  34.34 
 
 
404 aa  94  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  22.2 
 
 
398 aa  94  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0177  oxalate/formate antiporter  22.49 
 
 
400 aa  93.2  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  22.2 
 
 
398 aa  93.2  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  22.2 
 
 
398 aa  92.8  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  30.81 
 
 
402 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  29.78 
 
 
402 aa  92  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  30.81 
 
 
402 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  22.2 
 
 
398 aa  92.8  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  22.2 
 
 
398 aa  92.8  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  29.78 
 
 
402 aa  92  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  30.81 
 
 
402 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>