More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1239 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1239  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 766 aa  1583    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.191968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1002  penicillin-binding protein 1B  39.78 
 
 		 772 aa  533  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000067337 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4792  penicillin-binding protein 1B  39.66 
 
 		 774 aa  529  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000464587  hitchhiker  0.000389854 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4681  penicillin-binding protein 1B  39.15 
 
 		 773 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  hitchhiker  0.00000000000605496 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4683  penicillin-binding protein 1B  38.51 
 
 		 773 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000305505 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4547  penicillin-binding protein 1B  38.65 
 
 		 773 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.428177  hitchhiker  0.00000222687 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0977  penicillin-binding protein  38.66 
 
 		 773 aa  521  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0441683  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0842  peptidoglycan glycosyltransferase  38.66 
 
 		 773 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122469 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0751  penicillin-binding protein 1B  37.79 
 
 		 773 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.288465  hitchhiker  0.0000000000686308 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5415  penicillin-binding protein 1B  38.91 
 
 		 775 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62200  penicillin-binding protein 1B  38.78 
 
 		 774 aa  511  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.379753 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1646  penicillin-binding protein 1B  37.63 
 
 		 827 aa  506  9.999999999999999e-143  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.201466  hitchhiker  0.00102238 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1468  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  37.42 
 
 		 827 aa  503  1e-141  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.614381  unclonable  0.0000024056 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42560  penicillin-binding protein 1B  38.9 
 
 		 780 aa  501  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1620  penicillin-binding protein 1B  38.15 
 
 		 881 aa  495  9.999999999999999e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000878907  unclonable  0.000000000879141 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0679  penicillin-binding protein 1B  38.04 
 
 		 772 aa  491  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.963541  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1672  penicillin-binding protein, putative  37.55 
 
 		 759 aa  481  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2557  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1B  38.84 
 
 		 778 aa  480  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000207966  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2163  penicillin-binding protein 1B  39.97 
 
 		 732 aa  473  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0489  penicillin-binding protein 1B  36.64 
 
 		 781 aa  473  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.290067  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0650  penicillin-binding protein 1B  37.36 
 
 		 830 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002568  multimodular transpeptidase-transglycosylase  38.4 
 
 		 790 aa  472  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0825  Mutator MutT  36.33 
 
 		 777 aa  464  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00304949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1297  penicillin-binding protein 1B  37.14 
 
 		 780 aa  462  1e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03443  hypothetical protein  38.27 
 
 		 796 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2602  penicillin-binding protein transpeptidase  37.94 
 
 		 791 aa  459  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.809187  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3123  penicillin-binding protein 1B  37.6 
 
 		 789 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000774308 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1154  penicillin-binding protein 1B  36.93 
 
 		 776 aa  452  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1407  penicillin-binding protein 1B  37.83 
 
 		 748 aa  449  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0297434  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3463  penicillin-binding protein 1b  37.98 
 
 		 826 aa  448  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.995661  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1000  penicillin-binding protein 1b  37.88 
 
 		 824 aa  449  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3334  penicillin-binding protein 1b  37.98 
 
 		 826 aa  448  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3270  penicillin-binding protein 1B  36.23 
 
 		 766 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0633  penicillin-binding protein 1B  34.75 
 
 		 768 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0705  penicillin-binding protein 1B  34.91 
 
 		 790 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.559633  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1168  penicillin-binding protein 1b  38.23 
 
 		 826 aa  439  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0131  penicillin-binding protein 1B  37.5 
 
 		 777 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3685  penicillin-binding protein 1B  35.18 
 
 		 774 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3981  penicillin-binding protein 1b  38.16 
 
 		 836 aa  442  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.289458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3110  penicillin-binding protein 1b  38.37 
 
 		 826 aa  442  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0624  penicillin-binding protein 1B  35.96 
 
 		 764 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3406  penicillin-binding protein 1B  35.82 
 
 		 764 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0623  penicillin-binding protein 1B  35.82 
 
 		 764 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494369 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00472  penicillin-binding protein 1B  34.62 
 
 		 742 aa  438  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0656  penicillin-binding protein 1B  36.21 
 
 		 779 aa  437  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3742  penicillin-binding protein 1B  35.04 
 
 		 791 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1036  penicillin-binding protein 1b  37.75 
 
 		 833 aa  439  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.970019  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3868  penicillin-binding protein 1B  35.04 
 
 		 774 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2815  penicillin-binding protein 1b  38.07 
 
 		 827 aa  436  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.692041  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0583  penicillin-binding protein 1B  35.18 
 
 		 774 aa  438  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2971  peptidoglycan glycosyltransferase  34.74 
 
 		 779 aa  434  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3792  penicillin-binding protein 1B  36.63 
 
 		 790 aa  434  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.692226  decreased coverage  0.000000907679 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3164  penicillin-binding protein 1B  36.22 
 
 		 768 aa  430  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4301  penicillin-binding protein  34.61 
 
 		 769 aa  428  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3894  peptidoglycan glycosyltransferase  35.93 
 
 		 787 aa  429  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3095  penicillin-binding protein 1B  36.59 
 
 		 813 aa  426  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.911918 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0225  penicillin-binding protein 1b  38.8 
 
 		 840 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0207  penicillin-binding protein 1b  38.8 
 
 		 840 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0218  penicillin-binding protein 1b  38.8 
 
 		 840 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0596  penicillin-binding protein 1B  36.21 
 
 		 730 aa  422  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0222  penicillin-binding protein 1b  38.66 
 
 		 840 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0206  penicillin-binding protein 1b  38.66 
 
 		 840 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0825  penicillin-binding protein 1B  36.15 
 
 		 754 aa  416  9.999999999999999e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.524532  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00148  penicillin-binding protein 1b  37.8 
 
 		 841 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3453  penicillin-binding protein 1B  37.8 
 
 		 844 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.9649  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0153  penicillin-binding protein 1b  37.8 
 
 		 844 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.267501  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3510  penicillin-binding protein 1b  37.8 
 
 		 844 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.933967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0160  penicillin-binding protein 1b  37.94 
 
 		 844 aa  402  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00147  hypothetical protein  37.8 
 
 		 841 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0158  penicillin-binding protein 1b  37.94 
 
 		 844 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0152  penicillin-binding protein 1b  37.8 
 
 		 844 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.94433  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0140  penicillin-binding protein 1b  37.8 
 
 		 840 aa  401  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01595  penicillin-binding protein 1B  36.53 
 
 		 814 aa  402  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1965  peptidoglycan glycosyltransferase  36.17 
 
 		 792 aa  398  1e-109  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0689  penicillin-binding protein 1b  37.88 
 
 		 841 aa  397  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1899  penicillin-binding protein 1B  36.2 
 
 		 792 aa  398  1e-109  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0290  1A family penicillin-binding protein  33.19 
 
 		 757 aa  369  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0908  1A family penicillin-binding protein  32.83 
 
 		 766 aa  367  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1065  penicillin-binding protein 1A  29.59 
 
 		 890 aa  318  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.375339  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  32.91 
 
 		 625 aa  281  5e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  32.66 
 
 		 618 aa  279  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  31.11 
 
 		 648 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  31.28 
 
 		 643 aa  274  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0832  1A family penicillin-binding protein  33.56 
 
 		 713 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313161  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1832  1A family penicillin-binding protein  33.56 
 
 		 713 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.421648  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1773  1A family penicillin-binding protein  33.56 
 
 		 713 aa  273  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  34 
 
 		 735 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0339  1A family penicillin-binding protein  33.56 
 
 		 713 aa  273  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1123  1A family penicillin-binding protein  33.56 
 
 		 713 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438177  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0432  1A family penicillin-binding protein  33.56 
 
 		 713 aa  273  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  31.42 
 
 		 649 aa  271  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0615  penicillin-binding protein 1A  32.2 
 
 		 643 aa  270  7e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1427  penicillin-binding protein 1A  31.98 
 
 		 643 aa  270  7e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0536  penicillin-binding protein 1A  32.2 
 
 		 643 aa  270  7e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  34.54 
 
 		 734 aa  269  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  32.83 
 
 		 642 aa  269  2e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  32.47 
 
 		 720 aa  267  4e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  31.08 
 
 		 654 aa  267  5e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4779  1A family penicillin-binding protein  32.86 
 
 		 705 aa  266  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.819685 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5438  1A family penicillin-binding protein  33.03 
 
 		 709 aa  266  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.899041 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>