More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1212 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1194  Rhs element Vgr protein  95.4 
 
 		 655 aa  1268    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1212  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 699 aa  1457    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0014  vgrG protein  56.92 
 
 		 1017 aa  750    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1183  Rhs element Vgr protein  89.38 
 
 		 694 aa  1285    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1026  vgrG protein  55.97 
 
 		 1095 aa  784    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0115  vgrG protein  59.4 
 
 		 694 aa  836    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2513  type VI secretion system Vgr family protein  44.13 
 
 		 682 aa  579  1e-164  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2188  type VI secretion system Vgr family protein  46.57 
 
 		 656 aa  550  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.33539  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2825  type VI secretion system Vgr family protein  42.75 
 
 		 678 aa  546  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3238  type VI secretion system Vgr family protein  43.48 
 
 		 678 aa  543  1e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3719  Rhs element Vgr protein  44.13 
 
 		 723 aa  543  1e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331309  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2151  Rhs element Vgr protein  44.29 
 
 		 706 aa  540  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2572  Rhs element Vgr protein  42.94 
 
 		 687 aa  538  1e-151  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0544876  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2579  Rhs element Vgr protein  42.94 
 
 		 687 aa  538  1e-151  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0472026  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2565  Rhs element Vgr protein  42.94 
 
 		 687 aa  538  1e-151  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125293  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3454  type VI secretion system Vgr family protein  46.41 
 
 		 655 aa  533  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0418  type VI secretion system Vgr family protein  44.59 
 
 		 617 aa  519  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0345  type VI secretion system Vgr family protein  44.99 
 
 		 619 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1502  type VI secretion system Vgr family protein  44.59 
 
 		 617 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1607  type VI secretion system Vgr family protein  44.44 
 
 		 616 aa  514  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1162  type VI secretion system Vgr family protein  44.11 
 
 		 617 aa  514  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.754803  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2696  type VI secretion system Vgr family protein  43.44 
 
 		 615 aa  511  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.187576  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2559  type VI secretion system Vgr family protein  43.88 
 
 		 618 aa  511  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0648  type VI secretion system Vgr family protein  44.01 
 
 		 609 aa  506  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0650  Rhs element Vgr protein  42.45 
 
 		 727 aa  504  1e-141  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0732792  normal  0.0253872 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4257  type VI secretion system Vgr family protein  44.34 
 
 		 610 aa  504  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0838  Rhs element Vgr protein  40.78 
 
 		 697 aa  501  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0764  type VI secretion system Vgr family protein  39.77 
 
 		 741 aa  499  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0696  putative VgrG protein  39.77 
 
 		 741 aa  498  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0053  type VI secretion system Vgr family protein  43.22 
 
 		 617 aa  491  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0401  type VI secretion system Vgr family protein  41.65 
 
 		 740 aa  489  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0328  Rhs element Vgr protein  41.5 
 
 		 740 aa  486  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1145  Rhs element Vgr protein  41.82 
 
 		 706 aa  487  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0339  putative VgrG protein  40.19 
 
 		 732 aa  463  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3533  type VI secretion system Vgr family protein  40.22 
 
 		 725 aa  451  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5436  Rhs element Vgr protein  36.56 
 
 		 680 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1114  type VI secretion system Vgr family protein  39.09 
 
 		 713 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1234  Vgr family type VI secretion system  39.1 
 
 		 704 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.270466 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3234  type VI secretion system Vgr family protein  38.24 
 
 		 722 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0107  Rhs element Vgr protein  37.41 
 
 		 693 aa  429  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2117  Rhs element Vgr protein  37.15 
 
 		 722 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2614  vgrG protein  36.89 
 
 		 722 aa  422  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0110775 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2371  Rhs element Vgr protein  36.82 
 
 		 725 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0820  Rhs element Vgr protein  35.98 
 
 		 694 aa  421  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.476122  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3386  vgrG protein  36.51 
 
 		 725 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.160309  normal  0.824381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2557  type VI secretion system Vgr family protein  37.36 
 
 		 726 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.482945  normal  0.0643046 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4049  vgrG protein  35.95 
 
 		 771 aa  416  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.253476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2044  Rhs element Vgr protein  35.74 
 
 		 680 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.909849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4488  Rhs element Vgr protein  36.59 
 
 		 702 aa  414  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  35.68 
 
 		 683 aa  411  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  35.99 
 
 		 683 aa  410  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2858  type VI secretion system Vgr family protein  38.04 
 
 		 692 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374803  normal  0.207801 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0649  type VI secretion system Vgr family protein  38.19 
 
 		 633 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69550  hypothetical protein  35.92 
 
 		 680 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256731  normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5415  Rhs element Vgr protein  37.73 
 
 		 678 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18985  hypothetical protein  37.52 
 
 		 808 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261066  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3077  type VI secretion system Vgr family protein  37.79 
 
 		 633 aa  402  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0616  type VI secretion system Vgr family protein  37.79 
 
 		 633 aa  402  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0499415  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21450  hypothetical protein  36.48 
 
 		 688 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43080  hypothetical protein  37.29 
 
 		 680 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000176027  normal  0.282542 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1155  type VI secretion system Vgr family protein  38.51 
 
 		 706 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0542625  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0243  type VI secretion system Vgr family protein  36.45 
 
 		 713 aa  396  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2631  Rhs element Vgr protein  35.7 
 
 		 684 aa  399  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0251  type VI secretion system Vgr family protein  37.26 
 
 		 713 aa  396  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830075 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0587  type VI secretion system Vgr family protein  37.63 
 
 		 633 aa  399  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0245  type VI secretion system Vgr family protein  36.65 
 
 		 713 aa  395  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2064  type VI secretion system Vgr family protein  37.48 
 
 		 702 aa  392  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.201838  normal  0.0713545 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4385  Rhs element Vgr protein  37.15 
 
 		 763 aa  392  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1638  type VI secretion system Vgr family protein  37.64 
 
 		 702 aa  388  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.674786  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67230  hypothetical protein  34.85 
 
 		 790 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2202  type VI secretion system Vgr family protein  37.64 
 
 		 702 aa  388  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0264417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5574  Rhs element Vgr protein  37.48 
 
 		 741 aa  382  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2538  Rhs element Vgr protein  34.47 
 
 		 680 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  34.31 
 
 		 692 aa  373  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000448  VgrG protein  34.72 
 
 		 692 aa  374  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000107078  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1358  VgrG preotein, VgrG-2  34.38 
 
 		 754 aa  372  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3482  Rhs element Vgr protein  34.83 
 
 		 675 aa  362  1e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0192027  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  34.28 
 
 		 754 aa  362  1e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01965  hypothetical protein  33.98 
 
 		 771 aa  352  1e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0153  Rhs element Vgr protein  32.96 
 
 		 689 aa  347  5e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3849  Rhs element Vgr protein  33.53 
 
 		 675 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3949  Rhs element Vgr protein  32.59 
 
 		 691 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0454  Rhs element Vgr protein  34.06 
 
 		 671 aa  340  4e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  39.43 
 
 		 1019 aa  337  5e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  39.22 
 
 		 842 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  36.21 
 
 		 709 aa  330  6e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  33.6 
 
 		 646 aa  330  8e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  38.34 
 
 		 1019 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  33.44 
 
 		 643 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  34.55 
 
 		 668 aa  325  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  35.41 
 
 		 668 aa  323  5e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5597  Rhs element Vgr protein  32.61 
 
 		 1118 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  32.9 
 
 		 741 aa  319  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  32.85 
 
 		 689 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  33.22 
 
 		 741 aa  316  9e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  33.16 
 
 		 668 aa  316  9.999999999999999e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  32.85 
 
 		 689 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  36.73 
 
 		 968 aa  313  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  34.41 
 
 		 669 aa  310  5e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  33.77 
 
 		 741 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>