147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1139 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1139  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  215  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.798922  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2955  hypothetical protein  81.82 
 
 
110 aa  187  4e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1341  hypothetical protein  80 
 
 
126 aa  185  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.43803 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1498  hypothetical protein  78.9 
 
 
110 aa  181  3e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0278138  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0916  hypothetical protein  77.98 
 
 
110 aa  179  9.000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.201272  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2554  hypothetical protein  72.73 
 
 
110 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0485  hypothetical protein  75.93 
 
 
108 aa  169  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.376985  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0351  hypothetical protein  73.15 
 
 
110 aa  161  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1326  hypothetical protein  73.33 
 
 
105 aa  161  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.260826 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4032  hypothetical protein  72.38 
 
 
105 aa  159  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.581742 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3679  hypothetical protein  69.52 
 
 
105 aa  157  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2087  hypothetical protein  69.44 
 
 
110 aa  156  8e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.752744 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1668  protein of unknown function UPF0060  68.52 
 
 
110 aa  155  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2845  hypothetical protein  68.52 
 
 
111 aa  151  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215126  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1975  hypothetical protein  64.81 
 
 
108 aa  152  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0587  hypothetical protein  61.47 
 
 
110 aa  149  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0232  hypothetical protein  64.76 
 
 
117 aa  149  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25900  hypothetical protein  67.92 
 
 
222 aa  145  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1656  hypothetical protein  64.76 
 
 
141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110388  normal  0.226472 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4776  protein of unknown function UPF0060  65.71 
 
 
106 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0366686  hitchhiker  0.00123631 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5052  hypothetical protein  61.9 
 
 
106 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.597089 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1996  hypothetical protein  65.71 
 
 
106 aa  143  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.550248  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2632  hypothetical protein  61.68 
 
 
112 aa  142  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_003296  RS05320  hypothetical protein  62.73 
 
 
110 aa  135  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0866851  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1473  hypothetical protein  58.72 
 
 
111 aa  135  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1160  hypothetical protein  62.73 
 
 
110 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760553  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1598  protein of unknown function UPF0060  68.32 
 
 
110 aa  135  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0157763  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1172  hypothetical protein  62.73 
 
 
110 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0240568  normal  0.121257 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4944  hypothetical protein  60.91 
 
 
110 aa  134  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.194262  normal  0.300598 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2289  hypothetical protein  61.68 
 
 
108 aa  128  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.616642  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01551  hypothetical protein  61.39 
 
 
108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.520057  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2061  protein of unknown function UPF0060  61.39 
 
 
108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.151826  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4425  hypothetical protein  64.52 
 
 
110 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00189805  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2746  hypothetical protein  65.69 
 
 
106 aa  125  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.304303  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01541  hypothetical protein  61.39 
 
 
108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1655  hypothetical protein  61.39 
 
 
108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0427679  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1789  hypothetical protein  61.39 
 
 
108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.477899  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2048  hypothetical protein  61.39 
 
 
108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.791171  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1254  hypothetical protein  64.52 
 
 
110 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0263746  normal  0.108455 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2291  hypothetical protein  61.39 
 
 
108 aa  124  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.827947  hitchhiker  0.000000000030396 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1618  hypothetical protein  60.4 
 
 
108 aa  125  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333014  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1931  hypothetical protein  60.4 
 
 
108 aa  124  5e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0387347  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0802  hypothetical protein  63.44 
 
 
110 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1283  hypothetical protein  63.44 
 
 
132 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000413611  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3077  protein of unknown function UPF0060  71.7 
 
 
109 aa  118  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0586655 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1668  hypothetical protein  64.36 
 
 
108 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118229  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1674  hypothetical protein  64.36 
 
 
108 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.975768  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1615  hypothetical protein  64.36 
 
 
108 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1606  hypothetical protein  64.36 
 
 
108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1835  hypothetical protein  62.38 
 
 
108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.132551  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2942  protein of unknown function UPF0060  50 
 
 
109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  hitchhiker  0.00264399 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2715  hypothetical protein  50 
 
 
109 aa  108  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.858893  normal  0.216037 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4243  protein of unknown function UPF0060  60 
 
 
110 aa  107  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4131  protein of unknown function UPF0060  60 
 
 
110 aa  107  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.344067  normal  0.23278 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0701  hypothetical protein  55 
 
 
107 aa  107  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2037  hypothetical protein  61.96 
 
 
155 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0196  hypothetical protein  47.12 
 
 
107 aa  105  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.511333  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3084  hypothetical protein  49.06 
 
 
107 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.662192  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2268  hypothetical protein  60.55 
 
 
111 aa  103  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108701  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0342  hypothetical protein  57.8 
 
 
110 aa  97.4  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.790185  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2216  hypothetical protein  49 
 
 
103 aa  97.1  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.160487  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1837  hypothetical protein  46.67 
 
 
111 aa  95.9  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.39802 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4238  hypothetical protein  48.6 
 
 
112 aa  95.1  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.12468  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1018  protein of unknown function UPF0060  47.12 
 
 
106 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.357312  normal  0.312122 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2511  hypothetical protein  42.86 
 
 
106 aa  94.4  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0462845  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3233  hypothetical protein  47.22 
 
 
119 aa  94  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1170  protein of unknown function UPF0060  46.15 
 
 
106 aa  93.6  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.540258  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1507  hypothetical protein  45.45 
 
 
111 aa  94  7e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0118428  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1184  hypothetical protein  48.18 
 
 
110 aa  92.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.45839e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4423  hypothetical protein  43.93 
 
 
117 aa  91.7  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01651  membrane protein YnfA  72.41 
 
 
84 aa  91.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2204  hypothetical protein  43.81 
 
 
110 aa  91.3  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2837  protein of unknown function UPF0060  52.38 
 
 
109 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.578312  normal  0.331063 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4105  hypothetical protein  46.08 
 
 
113 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0982  protein of unknown function UPF0060  43.93 
 
 
112 aa  89.7  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.236233  normal  0.293859 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2230  hypothetical protein  43.4 
 
 
106 aa  89.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19950  hypothetical protein  41.82 
 
 
112 aa  89.7  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0102643 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4073  protein of unknown function UPF0060  44.55 
 
 
122 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0815  hypothetical protein  40.54 
 
 
111 aa  89  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0009  hypothetical protein  42.86 
 
 
110 aa  87.4  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1789  hypothetical protein  53.76 
 
 
108 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2004  hypothetical protein  52.38 
 
 
130 aa  86.7  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0347623  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0436  hypothetical protein  53.76 
 
 
108 aa  86.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1798  hypothetical protein  42.73 
 
 
110 aa  85.5  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2889  protein of unknown function UPF0060  45.28 
 
 
112 aa  85.1  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.368791  hitchhiker  0.00858506 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1681  hypothetical protein  40.38 
 
 
121 aa  85.1  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05280  hypothetical protein  43.64 
 
 
110 aa  84.3  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.53643  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4957  hypothetical protein  38.74 
 
 
111 aa  84.3  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0343479 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3546  protein of unknown function UPF0060  43.4 
 
 
108 aa  84.3  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3114  hypothetical protein  40.54 
 
 
111 aa  84  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4363  protein of unknown function UPF0060  42.57 
 
 
110 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.313348  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3474  protein of unknown function UPF0060  44.64 
 
 
111 aa  82.8  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.395847  normal  0.288197 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2302  putative transmembrane protein  48.94 
 
 
99 aa  82.8  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0659  hypothetical protein  51.89 
 
 
106 aa  83.2  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14640  hypothetical protein  38.74 
 
 
111 aa  82  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.702088  normal  0.333944 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1757  hypothetical protein  39.45 
 
 
109 aa  81.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1733  hypothetical protein  39.45 
 
 
109 aa  81.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2370  hypothetical protein  50 
 
 
107 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.458203  normal  0.777163 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3331  hypothetical protein  47 
 
 
106 aa  80.5  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0715  hypothetical protein  36.7 
 
 
109 aa  80.5  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>