More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1087 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1121 aa  2299    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01755  putative two-component member protein  39.47 
 
 
1111 aa  763    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3335  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.41 
 
 
1122 aa  806    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3722  ATP-binding region, ATPase-like protein  41.29 
 
 
1120 aa  834    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2249  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.88 
 
 
1143 aa  789    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.673162  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0791  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.94 
 
 
1118 aa  815    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3232  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.94 
 
 
1118 aa  815    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2504  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.84 
 
 
1132 aa  806    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3110  putative integral membrane sensor protein  41.08 
 
 
1141 aa  794    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0940316 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  39.54 
 
 
853 aa  381  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25170  hybrid histidine kinase  41.98 
 
 
642 aa  358  2.9999999999999997e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.89 
 
 
803 aa  356  1e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.02 
 
 
1313 aa  352  2e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6017  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.55 
 
 
1044 aa  349  2e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.59 
 
 
882 aa  347  5e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.97 
 
 
973 aa  345  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.2 
 
 
969 aa  344  5e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3242  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 
1027 aa  341  5e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.073449  normal  0.0177381 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4715  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.01 
 
 
1350 aa  340  9e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726459  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.35 
 
 
1350 aa  340  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.61 
 
 
969 aa  332  2e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3675  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.18 
 
 
966 aa  332  3e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.31 
 
 
1075 aa  328  3e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.63 
 
 
765 aa  327  8.000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.64 
 
 
767 aa  327  8.000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.05 
 
 
1433 aa  325  4e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.24 
 
 
738 aa  324  7e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  31.68 
 
 
823 aa  324  7e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.56 
 
 
647 aa  321  5e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.79 
 
 
1059 aa  318  5e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3403  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.26 
 
 
957 aa  316  1.9999999999999998e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1424  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.05 
 
 
1050 aa  313  2e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4662  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.55 
 
 
1287 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.56 
 
 
1064 aa  311  2.9999999999999997e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 
667 aa  311  4e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0107  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 
774 aa  311  5e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.32 
 
 
1229 aa  311  5.9999999999999995e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  30.26 
 
 
982 aa  308  3e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.24 
 
 
647 aa  308  3e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00025473 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 
940 aa  308  3e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0144  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.23 
 
 
1009 aa  308  3e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162275  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 
995 aa  308  3e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.08 
 
 
1222 aa  308  4.0000000000000004e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.05 
 
 
791 aa  307  8.000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.45 
 
 
902 aa  306  1.0000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 
781 aa  306  1.0000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.93 
 
 
865 aa  305  3.0000000000000004e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.42 
 
 
1007 aa  301  5e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  44.31 
 
 
544 aa  300  8e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.72 
 
 
1596 aa  300  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.26 
 
 
780 aa  299  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.95 
 
 
1177 aa  299  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.92 
 
 
1116 aa  299  3e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.03 
 
 
1202 aa  298  3e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.21 
 
 
2213 aa  297  7e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.37 
 
 
785 aa  296  1e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.09 
 
 
1070 aa  295  2e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.32 
 
 
1120 aa  295  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  42.93 
 
 
661 aa  295  3e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 
1044 aa  295  4e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 
984 aa  295  4e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.16 
 
 
989 aa  295  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  34.66 
 
 
968 aa  293  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.32 
 
 
1078 aa  293  1e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.97 
 
 
957 aa  292  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  38.55 
 
 
882 aa  292  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3683  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 
1124 aa  293  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  35.55 
 
 
1193 aa  292  3e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1451  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.09 
 
 
877 aa  292  3e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 
1611 aa  291  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.71 
 
 
989 aa  291  6e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3466  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.55 
 
 
1362 aa  290  9e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185791  normal  0.474676 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.44 
 
 
1578 aa  290  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.68 
 
 
785 aa  289  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.94 
 
 
1452 aa  289  2e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.23 
 
 
827 aa  289  2e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.01 
 
 
674 aa  288  4e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.12 
 
 
1927 aa  288  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.57 
 
 
717 aa  286  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.96 
 
 
902 aa  285  3.0000000000000004e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.86 
 
 
911 aa  285  3.0000000000000004e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1642  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.61 
 
 
1131 aa  285  3.0000000000000004e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0330659  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.52 
 
 
1369 aa  285  4.0000000000000003e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  34 
 
 
939 aa  283  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.2 
 
 
1193 aa  282  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.2 
 
 
1193 aa  282  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.09 
 
 
1127 aa  283  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.88 
 
 
1029 aa  282  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0718  sensory box histidine kinase/response regulator  36.66 
 
 
589 aa  281  3e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.97168  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0551  PAS  32.79 
 
 
1026 aa  281  4e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.425664 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03166  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.58 
 
 
959 aa  281  5e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.53 
 
 
846 aa  281  5e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.22 
 
 
873 aa  281  5e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.21 
 
 
1068 aa  281  6e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.53 
 
 
896 aa  281  7e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2964  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.73 
 
 
647 aa  280  8e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.443547 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.41 
 
 
916 aa  280  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5292  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.94 
 
 
524 aa  280  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4954  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.76 
 
 
1016 aa  279  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0561599 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 
881 aa  279  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>