More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1023 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1023  Triose-phosphate isomerase  100 
 
 		 249 aa  494  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00613564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  57.37 
 
 		 253 aa  280  2e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2199  triosephosphate isomerase  53.82 
 
 		 250 aa  269  4e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468925  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3448  triosephosphate isomerase  51.78 
 
 		 256 aa  266  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  52.61 
 
 		 253 aa  263  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0717  triosephosphate isomerase  53.78 
 
 		 251 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0103  triosephosphate isomerase  51 
 
 		 256 aa  259  3e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1591  triosephosphate isomerase  51.01 
 
 		 255 aa  259  4e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  48.8 
 
 		 250 aa  258  5.0000000000000005e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  51.41 
 
 		 253 aa  258  5.0000000000000005e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0674  triosephosphate isomerase  48.99 
 
 		 250 aa  258  7e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.260735  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0925  triosephosphate isomerase  49.79 
 
 		 245 aa  256  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0737109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0154  triosephosphate isomerase  50.6 
 
 		 255 aa  256  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5468  triosephosphate isomerase  51.2 
 
 		 251 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.50496  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0169  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 255 aa  256  4e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.543601  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62830  triosephosphate isomerase  51.2 
 
 		 251 aa  255  4e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4494  triosephosphate isomerase  51.2 
 
 		 251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.321001  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  51.41 
 
 		 246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4184  triosephosphate isomerase  51.39 
 
 		 251 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  47.93 
 
 		 248 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0870  triosephosphate isomerase  51.82 
 
 		 250 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695096  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4297  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 		 255 aa  251  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4412  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 		 255 aa  251  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0292909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  53.78 
 
 		 252 aa  251  6e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4327  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 		 255 aa  251  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4480  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 		 255 aa  251  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4410  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 		 255 aa  251  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3808  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 255 aa  251  7e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.102844  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4052  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 255 aa  251  7e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  48.15 
 
 		 245 aa  251  9.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03804  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 255 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4066  Triose-phosphate isomerase  49.8 
 
 		 255 aa  251  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49960  triosephosphate isomerase  52.08 
 
 		 251 aa  250  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4099  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 255 aa  251  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4359  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 255 aa  251  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.626096 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4399  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 255 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4453  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 255 aa  251  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45770  triosephosphate isomerase  52.08 
 
 		 251 aa  250  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4150  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 255 aa  251  1e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5374  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 255 aa  251  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03753  hypothetical protein  49.8 
 
 		 255 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4715  triosephosphate isomerase  51.39 
 
 		 251 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151784  hitchhiker  0.00871946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4581  triosephosphate isomerase  51.39 
 
 		 251 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.299699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4716  triosephosphate isomerase  51.39 
 
 		 251 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  49 
 
 		 256 aa  250  2e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0955  triosephosphate isomerase  51.01 
 
 		 250 aa  249  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000301152 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1140  triosephosphate isomerase  54.66 
 
 		 248 aa  249  3e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.766646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  47.11 
 
 		 248 aa  248  6e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2838  triosephosphate isomerase  47.79 
 
 		 249 aa  247  1e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2707  triosephosphate isomerase  48.19 
 
 		 249 aa  247  1e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2815  triosephosphate isomerase  48.8 
 
 		 270 aa  247  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.394294  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0775  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 251 aa  245  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354266  normal  0.0202698 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1574  triosephosphate isomerase  50.41 
 
 		 249 aa  245  6e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0183532  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0542  triosephosphate isomerase  46.15 
 
 		 271 aa  244  9e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2064  triosephosphate isomerase  46.69 
 
 		 248 aa  243  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0168982  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  46.15 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0947  triosephosphate isomerase  51.81 
 
 		 249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.144972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0169  triosephosphate isomerase  46.8 
 
 		 256 aa  242  3.9999999999999997e-63  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1261  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 		 251 aa  242  3.9999999999999997e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168128 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0096  triosephosphate isomerase  48.78 
 
 		 255 aa  241  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4118  triosephosphate isomerase  48.78 
 
 		 255 aa  241  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0095  triosephosphate isomerase  48.78 
 
 		 255 aa  241  6e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2717  triosephosphate isomerase  45.38 
 
 		 246 aa  241  6e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0490631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36521  predicted protein  50.4 
 
 		 266 aa  239  2e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.144318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1520  triosephosphate isomerase  47.39 
 
 		 272 aa  239  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128427  decreased coverage  0.0000834169 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1499  Triose-phosphate isomerase  47.15 
 
 		 248 aa  239  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0165539 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_24989  predicted protein  50.4 
 
 		 279 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4805  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000667098 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  48.78 
 
 		 249 aa  238  9e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3612  triosephosphate isomerase  48.4 
 
 		 251 aa  237  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0283  triosephosphate isomerase  47.08 
 
 		 256 aa  237  1e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  48.21 
 
 		 253 aa  237  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1401  triosephosphate isomerase  47.77 
 
 		 251 aa  237  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0615206  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  47.58 
 
 		 252 aa  236  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  46.59 
 
 		 250 aa  236  2e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0957  triosephosphate isomerase  45.88 
 
 		 260 aa  236  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0345759  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 250 aa  236  3e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01285  triosephosphate isomerase  49.17 
 
 		 251 aa  236  3e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1767  triosephosphate isomerase  47.18 
 
 		 249 aa  236  4e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.91306  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1200  triosephosphate isomerase  45.88 
 
 		 260 aa  234  9e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3393  triosephosphate isomerase  45.1 
 
 		 260 aa  234  9e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000164415  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1022  triosephosphate isomerase  45.88 
 
 		 260 aa  234  9e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178614  hitchhiker  0.000431545 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1087  triosephosphate isomerase  45.88 
 
 		 260 aa  234  9e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059681  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1026  triosephosphate isomerase  45.88 
 
 		 260 aa  234  9e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000672651  hitchhiker  0.0000521404 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3284  triosephosphate isomerase  45.88 
 
 		 260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371764  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  51.19 
 
 		 251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1124  triosephosphate isomerase  45.88 
 
 		 260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121721  unclonable  0.00000000000528037 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3421  triosephosphate isomerase  45.88 
 
 		 260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000876569  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001760  triosephosphate isomerase  46.25 
 
 		 256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2838  triosephosphate isomerase  45.88 
 
 		 260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000084878  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3243  triosephosphate isomerase  45.88 
 
 		 260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000257421  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  48 
 
 		 255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  47.62 
 
 		 257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2831  triosephosphate isomerase  44.71 
 
 		 260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000042953  hitchhiker  0.00389109 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0986  triosephosphate isomerase  45.1 
 
 		 260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000192621  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00709  triosephosphate isomerase  46.22 
 
 		 250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3565  triosephosphate isomerase  45.1 
 
 		 260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.147919  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1003  triosephosphate isomerase  45.49 
 
 		 260 aa  233  3e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0343606  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3352  Triose-phosphate isomerase  47.79 
 
 		 252 aa  232  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1740  triosephosphate isomerase  47.95 
 
 		 245 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>