More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1003 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1003  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
630 aa  1275    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.941233  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1731  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.36 
 
 
621 aa  213  7e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144225  normal  0.746753 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4049  histidine kinase  40.71 
 
 
630 aa  201  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431231  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1209  histidine kinase  37.45 
 
 
621 aa  198  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1420  histidine kinase  37.6 
 
 
621 aa  196  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.990056  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0714  C4-dicarboxylate transport sensor protein ATPase subunit  41.31 
 
 
594 aa  196  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0478  histidine kinase  37.32 
 
 
616 aa  194  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1259  ATPase domain-containing protein  37.07 
 
 
626 aa  194  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.27586 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.34 
 
 
606 aa  192  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.381822 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1815  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.87 
 
 
583 aa  192  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.308963 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.77 
 
 
622 aa  188  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.534155 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0276  sensor histidine kinase  41.73 
 
 
659 aa  187  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2682  histidine kinase  38.85 
 
 
635 aa  187  6e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249281 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0331  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  39.62 
 
 
665 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0193  histidine kinase  39.08 
 
 
670 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0541233 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3454  histidine kinase  38.04 
 
 
623 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4562  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.23 
 
 
591 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3170  histidine kinase  38.17 
 
 
597 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111612  normal  0.304086 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.16 
 
 
672 aa  183  7e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.622547  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0368  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.94 
 
 
620 aa  182  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.48 
 
 
652 aa  182  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0131  histidine kinase  39.04 
 
 
630 aa  182  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399979  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.27 
 
 
585 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1043  histidine kinase  40.48 
 
 
585 aa  181  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3461  histidine kinase  38.17 
 
 
600 aa  180  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350821  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3901  histidine kinase  39.13 
 
 
615 aa  180  9e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.896437  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 
635 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4321  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.87 
 
 
585 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.48 
 
 
585 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1248  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 
628 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4927  histidine kinase  37.87 
 
 
627 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0008  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  39.05 
 
 
634 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.368078  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3025  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
634 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5341  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
634 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4656  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 
650 aa  173  9e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0229  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 
668 aa  173  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.930854  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18010  C4-dicarboylate transport sensory histidine protein kinase, two-component; DctB  40.89 
 
 
592 aa  172  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892386  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6227  two component sensor kinase for C4-dicarboxylate transport  38.37 
 
 
600 aa  171  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.970393  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0307  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.92 
 
 
627 aa  171  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.876198  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4457  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 
586 aa  171  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3259  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.7 
 
 
622 aa  170  9e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157895  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5668  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.88 
 
 
623 aa  169  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2542  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 
588 aa  168  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206032  normal  0.256758 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4691  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 
638 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5220  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
631 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.747879 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3935  histidine kinase  33.78 
 
 
667 aa  168  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707276  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3994  sensor histidine kinase  38.04 
 
 
585 aa  167  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1462  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
600 aa  167  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0277816  normal  0.69414 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1515  C4-dicarboxylate transport sensor protein  37.88 
 
 
597 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0225348  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3284  histidine kinase  38.43 
 
 
625 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4771  histidine kinase  38.43 
 
 
624 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15318  normal  0.415438 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2883  histidine kinase  33.92 
 
 
669 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296171  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3060  ATPase domain-containing protein  38.74 
 
 
625 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457203  normal  0.839364 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4339  histidine kinase  38.58 
 
 
600 aa  166  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
597 aa  165  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0801303  normal  0.115737 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 
683 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2258  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 
669 aa  165  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72740  putative two-component sensor  38.28 
 
 
588 aa  165  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.658354  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2872  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 
669 aa  165  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13678  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0477  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  33.94 
 
 
677 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.277779  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0457  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  33.94 
 
 
677 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7577  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6214  histidine kinase  32.85 
 
 
669 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 
602 aa  163  7e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0519  histidine kinase  33.95 
 
 
666 aa  164  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541835  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0589  histidine kinase  39.16 
 
 
590 aa  163  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1436  histidine kinase  37.21 
 
 
617 aa  163  9e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2789  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 
677 aa  163  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4196  histidine kinase  34.07 
 
 
666 aa  163  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.531315 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2718  histidine kinase  38.4 
 
 
623 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 
672 aa  163  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6314  putative two-component sensor  38.28 
 
 
586 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2212  putative two-component sensor histidine kinase protein  36.94 
 
 
600 aa  161  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3479  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 
621 aa  161  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2979  histidine kinase  37.07 
 
 
622 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0797138 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4539  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 
637 aa  160  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0810573  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0431  histidine kinase  34.63 
 
 
668 aa  160  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2012  C4-dicarboxylate transport sensor protein  35.04 
 
 
611 aa  160  7e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68230  two-component sensor  36.08 
 
 
612 aa  160  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0604681 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2710  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 
756 aa  160  9e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.438958  normal  0.796256 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4294  histidine kinase  36.23 
 
 
626 aa  160  9e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0465122  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2874  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
693 aa  159  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0266107 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 
627 aa  158  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420715  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1136  putative C4-dicarboxylate transport sensor protein  34.7 
 
 
684 aa  158  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00183456  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4406  histidine kinase  38.43 
 
 
622 aa  158  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0714  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
604 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362965  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0641  C4-dicarboxylate transport sensor protein  33.94 
 
 
677 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2537  phosphoglycerate transport system sensor protein PgtB  33.56 
 
 
668 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5904  two-component sensor  36.08 
 
 
599 aa  158  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1457  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 
618 aa  157  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.798107  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
634 aa  157  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2668  histidine kinase  37.65 
 
 
638 aa  157  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4291  sensor histidine kinase  37.65 
 
 
585 aa  157  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1723  histidine kinase  32.43 
 
 
608 aa  157  7e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.10547 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2626  phosphoglycerate transport system sensor protein PgtB  33.22 
 
 
668 aa  156  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.339586  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3718  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 
826 aa  156  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2586  phosphoglycerate transport system sensor protein PgtB  33.22 
 
 
668 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0953396  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0914  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
771 aa  155  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4177  histidine kinase  31.91 
 
 
620 aa  155  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661658  normal  0.571454 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1360  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 
603 aa  155  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2650  phosphoglycerate transport system sensor protein PgtB  33.22 
 
 
668 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>