More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0963 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0963  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
308 aa  634  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377381  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1739  transcriptional regulator CysB-like protein  66.78 
 
 
314 aa  419  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  2.79611e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0621  transcriptional regulator CysB-like protein  65.78 
 
 
309 aa  414  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2129  transcriptional regulator CysB-like protein  60.06 
 
 
311 aa  393  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.74673e-16  decreased coverage  1.24662e-06 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1777  transcriptional regulator CysB-like protein  58.5 
 
 
308 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16529  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2466  transcriptional regulator CysB-like protein  58.5 
 
 
308 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0810  transcriptional regulator CysB-like protein  57.52 
 
 
308 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.259681  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1851  transcriptional regulator CysB-like protein  57.52 
 
 
308 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1865  transcriptional regulator CysB-like protein  57.52 
 
 
308 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0350  transcriptional regulator CysB-like protein  57.52 
 
 
308 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0871745  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1205  transcriptional regulator CysB-like protein  57.52 
 
 
308 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.215298  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1694  transcriptional regulator CysB-like protein  57.52 
 
 
308 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.272702  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2476  transcriptional regulator CysB-like protein  57.52 
 
 
308 aa  371  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2018  transcriptional regulator CysB-like protein  57.52 
 
 
308 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.962244  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1501  transcriptional regulator CysB-like protein  57.52 
 
 
308 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33535  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4743  transcriptional regulator CysB-like protein  59.12 
 
 
308 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217696  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1605  transcriptional regulator CysB-like protein  59.12 
 
 
308 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339549  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1632  transcriptional regulator CysB-like protein  57.52 
 
 
308 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1582  transcriptional regulator CysB-like protein  59.12 
 
 
308 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.610687  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1521  transcriptional regulator CysB-like protein  57.52 
 
 
308 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1125  transcriptional regulator CysB-like protein  58.78 
 
 
308 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1625  transcriptional regulator CysB-like protein  57.19 
 
 
308 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.879627  normal  0.658708 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1287  transcriptional regulator CysB-like protein  55.15 
 
 
319 aa  352  4e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.767639  normal  0.313196 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1224  transcriptional regulator CysB-like protein  55.15 
 
 
319 aa  352  6e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.178615  normal  0.191747 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1348  transcriptional regulator CysB-like protein  54.49 
 
 
327 aa  350  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1394  transcriptional regulator CysB-like protein  56.39 
 
 
317 aa  350  2e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5610  LysR family transcriptional regulator  52.94 
 
 
354 aa  348  6e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.519955 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1379  transcriptional regulator CysB-like protein  54.3 
 
 
316 aa  348  7e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1967  transcriptional regulator CysB-like protein  54.1 
 
 
315 aa  347  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2917  transcriptional regulator CysB-like protein  56.9 
 
 
317 aa  347  2e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1658  transcriptional regulator Cbl  53.44 
 
 
316 aa  347  2e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  7.65107e-08  normal  0.0208007 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2831  transcriptional regulator Cbl  53.44 
 
 
316 aa  346  4e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  1.01541e-08  normal  0.682702 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1792  transcriptional regulator CysB-like protein  56.07 
 
 
317 aa  343  1e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1289  transcriptional regulator CysB-like protein  55.74 
 
 
317 aa  343  2e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2269  transcriptional regulator Cbl  53.44 
 
 
316 aa  342  5e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  8.89139e-13  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01897  DNA-binding transcriptional activator of cysteine biosynthesis  53.44 
 
 
316 aa  342  5e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000685239  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1668  transcriptional regulator, LysR family  53.44 
 
 
316 aa  342  5e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.12362e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01886  hypothetical protein  53.44 
 
 
316 aa  342  5e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000554591  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3810  LysR family transcriptional regulator  52.6 
 
 
312 aa  342  6e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1137  transcriptional regulator Cbl  53.44 
 
 
316 aa  341  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.42733e-08  hitchhiker  5.52963e-05 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2110  transcriptional regulator Cbl  53.44 
 
 
316 aa  340  2e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.31787e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0971  transcriptional regulator Cbl  53.11 
 
 
316 aa  339  4e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000168411  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0127  LysR family transcriptional regulator  53.97 
 
 
311 aa  337  2e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.191807  hitchhiker  0.00233416 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2705  transcriptional regulator CysB-like protein  55.08 
 
 
317 aa  337  2e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2563  transcriptional regulator Cbl  54.1 
 
 
316 aa  332  4e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00294474  normal  0.0988351 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0699  sulfur assimilation transcriptional regulator, LysR family  51.32 
 
 
320 aa  328  9e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.735105  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0847  transcriptional regulator, LysR family  51.32 
 
 
320 aa  328  9e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.960379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1296  transcriptional regulator, LysR family  50.66 
 
 
320 aa  326  3e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1669  transcriptional regulator CysB-like protein  50.65 
 
 
312 aa  324  1e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0453898  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3039  LysR family transcriptional regulator  51.31 
 
 
309 aa  324  1e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.0769631 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2393  transcriptional regulator CysB-like protein  49.68 
 
 
313 aa  321  1e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2525  transcriptional regulator CysB-like protein  49.68 
 
 
313 aa  321  1e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0818  transcriptional regulator CysB-like protein  49.35 
 
 
313 aa  320  2e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2476  transcriptional regulator CysB-like protein  49.68 
 
 
313 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14516  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1865  transcriptional regulator CysB-like protein  49.68 
 
 
313 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2481  transcriptional regulator CysB-like protein  49.68 
 
 
313 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0061  transcriptional regulator, LysR family  52.27 
 
 
314 aa  318  7e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5807  transcriptional regulator CysB-like protein  49.35 
 
 
313 aa  318  9e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0834641 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2910  transcriptional regulator CysB-like protein  49.02 
 
 
313 aa  317  1e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.170902  normal  0.254391 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0800  transcriptional regulator CysB-like protein  49.51 
 
 
313 aa  317  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0813  transcriptional regulator CysB-like protein  49.35 
 
 
313 aa  317  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2427  transcriptional regulator CysB-like protein  50.66 
 
 
313 aa  313  3e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2231  transcriptional regulator CysB-like protein  50.66 
 
 
313 aa  312  5e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2349  transcriptional regulator CysB-like protein  48.38 
 
 
313 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2936  transcriptional regulator CysB-like protein  48.38 
 
 
313 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1165  transcriptional regulator CysB-like protein  48.38 
 
 
313 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1012  transcriptional regulator CysB-like protein  48.38 
 
 
313 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1663  transcriptional regulator CysB-like protein  48.38 
 
 
313 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0662  transcriptional regulator CysB-like protein  48.38 
 
 
313 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631688  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1005  transcriptional regulator CysB-like protein  48.38 
 
 
313 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2236  transcriptional regulator CysB-like protein  49.03 
 
 
313 aa  310  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1145  transcriptional regulator CysB-like protein  50.16 
 
 
308 aa  309  3e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.207377  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0969  transcriptional regulator CysB-like protein  48.38 
 
 
313 aa  310  3e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2691  transcriptional regulator CysB-like protein  50 
 
 
313 aa  310  3e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.644017  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3665  transcriptional regulator CysB-like protein  48.05 
 
 
313 aa  308  6e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.891363 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0341  transcriptional regulator CysB  50 
 
 
333 aa  306  3e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.136754  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0071  LysR family transcriptional regulator  51.83 
 
 
314 aa  306  4e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16172  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2818  transcriptional regulator CysB-like protein  48.17 
 
 
313 aa  300  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2698  transcriptional regulator CysB-like protein  48.5 
 
 
313 aa  300  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2341  transcriptional regulator CysB  49.67 
 
 
335 aa  298  6e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00664929 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0620  transcriptional regulator CysB-like protein  48.5 
 
 
313 aa  298  8e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0418657  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1768  transcriptional regulator CysB  49.02 
 
 
324 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  1.42013e-07 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2469  transcriptional regulator CysB  48.34 
 
 
324 aa  296  3e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2327  transcriptional regulator CysB  49.02 
 
 
324 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184075  hitchhiker  4.6762e-05 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3443  transcriptional regulator CysB  49.02 
 
 
324 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0457028  hitchhiker  0.00255719 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1928  transcriptional regulator CysB  49.02 
 
 
324 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0221409  hitchhiker  1.99307e-11 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4003  transcriptional regulator CysB  49.02 
 
 
324 aa  295  6e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.260583  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2546  transcriptional regulator CysB  48.04 
 
 
324 aa  294  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  8.91923e-06 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2726  transcriptional regulator CysB-like protein  45.51 
 
 
313 aa  293  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.634553  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2292  transcriptional regulator CysB-like protein  47.54 
 
 
306 aa  293  3e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.524252  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2077  transcriptional regulator CysB  48.04 
 
 
324 aa  292  5e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047105 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1624  transcriptional regulator CysB  48.5 
 
 
324 aa  292  6e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.483368  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3535  transcriptional regulator CysB-like protein  46.51 
 
 
326 aa  292  6e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00820033 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23140  transcriptional regulator CysB  48.04 
 
 
324 aa  291  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2279  Cys regulon transcriptional activator  48.04 
 
 
324 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0003435  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1200  transcriptional regulator CysB  48.34 
 
 
324 aa  290  3e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1946  transcriptional regulator CysB-like protein  43.55 
 
 
317 aa  290  3e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.226921  normal  0.0811949 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2428  transcriptional regulator CysB  46.56 
 
 
323 aa  288  6e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1697  transcriptional regulator CysB  45.1 
 
 
326 aa  288  9e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.828749 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2248  transcriptional regulator CysB  46.89 
 
 
325 aa  287  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.841929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>