More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0934 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  50.53 
 
 
665 aa  671    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  51.75 
 
 
665 aa  686    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  100 
 
 
655 aa  1347    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  51.75 
 
 
665 aa  686    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  51.6 
 
 
665 aa  684    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  45.37 
 
 
653 aa  578  1e-164  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  47.04 
 
 
652 aa  571  1e-161  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  43.07 
 
 
666 aa  553  1e-156  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  43.05 
 
 
663 aa  546  1e-154  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  43.42 
 
 
663 aa  545  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  41.82 
 
 
666 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  42.2 
 
 
666 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  41.82 
 
 
666 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  41.67 
 
 
666 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  44.13 
 
 
652 aa  520  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  41.53 
 
 
658 aa  495  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  41.97 
 
 
740 aa  482  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  41.41 
 
 
676 aa  479  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  39.39 
 
 
700 aa  458  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  37.21 
 
 
698 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  37.41 
 
 
656 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  37.26 
 
 
713 aa  419  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  36.08 
 
 
715 aa  402  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  38.25 
 
 
680 aa  400  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01120  iron-regulated outer membrane virulence protein  38.56 
 
 
572 aa  385  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1099  TonB-dependent receptor  34.18 
 
 
664 aa  372  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  34.59 
 
 
743 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  36.83 
 
 
702 aa  365  2e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  35.43 
 
 
696 aa  365  2e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  35.43 
 
 
696 aa  365  2e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  33.7 
 
 
739 aa  362  1e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  34.19 
 
 
726 aa  360  5e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  36.17 
 
 
732 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  35.62 
 
 
695 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  33.02 
 
 
656 aa  354  2.9999999999999997e-96  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  34.18 
 
 
698 aa  351  2e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  34.18 
 
 
698 aa  351  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  34.18 
 
 
698 aa  351  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  34.53 
 
 
656 aa  352  2e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  36.07 
 
 
714 aa  345  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  34.09 
 
 
650 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  33.19 
 
 
659 aa  341  2e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  33.14 
 
 
663 aa  340  4e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  34.09 
 
 
650 aa  340  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  34.09 
 
 
650 aa  340  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  33.14 
 
 
663 aa  340  5e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  33.14 
 
 
663 aa  340  5e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  33.14 
 
 
663 aa  340  5e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  34.09 
 
 
650 aa  340  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  34.09 
 
 
650 aa  339  8e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  32.99 
 
 
663 aa  339  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  32.99 
 
 
663 aa  339  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  33.49 
 
 
641 aa  337  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  33.79 
 
 
799 aa  329  9e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  33.63 
 
 
799 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 
799 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  32.72 
 
 
698 aa  306  1.0000000000000001e-81  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  31.65 
 
 
696 aa  300  4e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  31.75 
 
 
702 aa  301  4e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  33.73 
 
 
681 aa  298  2e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  31.61 
 
 
653 aa  297  4e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  31.89 
 
 
697 aa  294  4e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  31.72 
 
 
704 aa  294  4e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  31.32 
 
 
696 aa  292  2e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  31.91 
 
 
635 aa  291  4e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  31.49 
 
 
665 aa  276  6e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  30.72 
 
 
648 aa  269  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  30.79 
 
 
640 aa  268  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  30.31 
 
 
657 aa  262  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  30.21 
 
 
653 aa  258  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  30 
 
 
649 aa  257  4e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 
649 aa  257  5e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 
649 aa  256  7e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 
661 aa  256  8e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 
662 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 
662 aa  251  4e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 
680 aa  249  8e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 
662 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  30.47 
 
 
746 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  29.36 
 
 
744 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  28.79 
 
 
744 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  28.79 
 
 
744 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2972  outer membrane receptor FepA  28.93 
 
 
724 aa  226  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0370731 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2953  outer membrane receptor FepA  28.8 
 
 
724 aa  226  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246738  hitchhiker  0.000000000736095 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3075  outer membrane receptor FepA  28.84 
 
 
724 aa  226  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203578  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2889  outer membrane receptor FepA  28.8 
 
 
724 aa  226  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  27.6 
 
 
650 aa  225  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2919  outer membrane receptor FepA  28.78 
 
 
724 aa  224  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.91274  normal  0.0854265 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1811  diaminopimelate epimerase (DAP epimerase)  35.12 
 
 
330 aa  223  9e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0743  outer membrane receptor FepA  28.26 
 
 
751 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100086  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0681  outer membrane receptor FepA  28.26 
 
 
751 aa  218  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.757968  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0697  outer membrane receptor FepA  28.12 
 
 
751 aa  217  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0624  outer membrane receptor FepA  28.12 
 
 
751 aa  216  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0638  outer membrane receptor FepA  27.98 
 
 
751 aa  216  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1195  outer membrane receptor FepA  28.07 
 
 
749 aa  215  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0821218  normal  0.246562 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1839  outer membrane receptor FepA  28.89 
 
 
703 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3743  outer membrane receptor FepA  28.17 
 
 
766 aa  213  7.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.325826  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3430  outer membrane receptor FepA  28.96 
 
 
759 aa  213  9e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0680  outer membrane receptor FepA  29.58 
 
 
783 aa  213  9e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0125648  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4579  outer membrane receptor FepA  28.44 
 
 
742 aa  210  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>