More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0889 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
378 aa  781    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  58.44 
 
 
393 aa  452  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  55.61 
 
 
394 aa  444  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  57.22 
 
 
381 aa  430  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  58.06 
 
 
381 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  57.51 
 
 
394 aa  429  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  58.06 
 
 
381 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  57.03 
 
 
396 aa  425  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  57.53 
 
 
381 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  57.29 
 
 
390 aa  421  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  55.7 
 
 
383 aa  418  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  55.32 
 
 
384 aa  418  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  57.33 
 
 
390 aa  417  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  59.25 
 
 
390 aa  402  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  54.45 
 
 
395 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  53.66 
 
 
395 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  54.86 
 
 
387 aa  390  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  52.82 
 
 
373 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  56.07 
 
 
346 aa  388  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  52.25 
 
 
394 aa  375  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  50.4 
 
 
385 aa  372  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  51.19 
 
 
390 aa  371  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  55.35 
 
 
364 aa  359  4e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  52.24 
 
 
393 aa  357  9.999999999999999e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  51.34 
 
 
371 aa  355  5e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  48.94 
 
 
376 aa  350  2e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  47.93 
 
 
387 aa  347  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  46.99 
 
 
382 aa  347  2e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  47.76 
 
 
391 aa  345  8.999999999999999e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  47.06 
 
 
377 aa  343  2e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  49.21 
 
 
385 aa  343  2.9999999999999997e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  46.11 
 
 
380 aa  342  5.999999999999999e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  46.98 
 
 
391 aa  342  7e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  48.02 
 
 
378 aa  339  4e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  47.06 
 
 
395 aa  330  2e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  46.87 
 
 
389 aa  328  1.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0362  oxidoreductase domain-containing protein  45.95 
 
 
396 aa  326  5e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  45.8 
 
 
377 aa  323  2e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  46.93 
 
 
373 aa  323  3e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  45.81 
 
 
396 aa  320  3e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  44.41 
 
 
384 aa  318  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  46.77 
 
 
387 aa  317  3e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  43.23 
 
 
399 aa  315  7e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  44.06 
 
 
393 aa  298  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  39.58 
 
 
381 aa  282  6.000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  38.21 
 
 
377 aa  279  7e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  41.49 
 
 
378 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  36.31 
 
 
377 aa  265  1e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  37.3 
 
 
377 aa  261  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3019  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  36.75 
 
 
389 aa  252  7e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261421  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1047  oxidoreductase domain protein  37.66 
 
 
388 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4574  oxidoreductase-like  36.6 
 
 
390 aa  249  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0948  oxidoreductase-like  36.6 
 
 
390 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1430  oxidoreductase domain-containing protein  36.6 
 
 
390 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50260  Oxidoreductase  36.06 
 
 
389 aa  248  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1248  hypothetical protein  37.4 
 
 
390 aa  245  9e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2055  oxidoreductase domain-containing protein  37.08 
 
 
390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1408  oxidoreductase domain-containing protein  36.07 
 
 
390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0728  oxidoreductase domain-containing protein  34.3 
 
 
364 aa  241  2e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1310  oxidoreductase domain-containing protein  36.34 
 
 
390 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1885  oxidoreductase domain-containing protein  36.97 
 
 
390 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1349  oxidoreductase domain-containing protein  35.83 
 
 
390 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1983  oxidoreductase domain protein  39.94 
 
 
407 aa  236  4e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093165  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3196  oxidoreductase domain-containing protein  36.34 
 
 
392 aa  235  8e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0053  oxidoreductase domain-containing protein  35.28 
 
 
390 aa  234  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2924  oxidoreductase domain-containing protein  35.9 
 
 
390 aa  224  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  31.46 
 
 
386 aa  179  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  31.91 
 
 
381 aa  176  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1585  oxidoreductase domain protein  31.64 
 
 
375 aa  176  5e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  34.58 
 
 
382 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  30.98 
 
 
385 aa  169  6e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  32.48 
 
 
382 aa  169  8e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  32.52 
 
 
366 aa  166  9e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  29.32 
 
 
390 aa  162  7e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  30.48 
 
 
381 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  29.11 
 
 
383 aa  160  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  27.66 
 
 
377 aa  159  5e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  31.23 
 
 
380 aa  159  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  29.4 
 
 
384 aa  159  9e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  28.61 
 
 
383 aa  158  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  33.51 
 
 
382 aa  157  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  30.91 
 
 
374 aa  155  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  32.61 
 
 
387 aa  152  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  28.93 
 
 
384 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  29.32 
 
 
384 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  31.33 
 
 
388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  31.72 
 
 
369 aa  135  8e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  28.99 
 
 
384 aa  135  9e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  29.4 
 
 
378 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  30.79 
 
 
386 aa  129  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  32.11 
 
 
382 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  31.33 
 
 
379 aa  127  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0390  oxidoreductase domain protein  28.93 
 
 
397 aa  127  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  decreased coverage  0.00594685 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  28.5 
 
 
385 aa  126  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  26.89 
 
 
394 aa  126  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  30.84 
 
 
380 aa  125  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  29.5 
 
 
376 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  30.38 
 
 
388 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1911  oxidoreductase domain-containing protein  30.15 
 
 
390 aa  122  8e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  29.43 
 
 
388 aa  122  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>