More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0874 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  100 
 
 
313 aa  644    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  70.2 
 
 
346 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  69.93 
 
 
346 aa  442  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  70.33 
 
 
346 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  66.89 
 
 
322 aa  418  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1421  ABC transporter related  66.67 
 
 
317 aa  420  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  67 
 
 
318 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  67 
 
 
318 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  67 
 
 
318 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1550  ABC transporter related  66.67 
 
 
318 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  63.55 
 
 
335 aa  395  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  60.13 
 
 
323 aa  387  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  60.78 
 
 
308 aa  382  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  60.13 
 
 
308 aa  380  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  60.19 
 
 
322 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  61.31 
 
 
327 aa  374  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  54.83 
 
 
340 aa  367  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  57.41 
 
 
323 aa  365  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  58.5 
 
 
308 aa  358  7e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  52.3 
 
 
315 aa  320  1.9999999999999998e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  44.78 
 
 
326 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  44.3 
 
 
325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  43.14 
 
 
314 aa  252  5.000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  42.86 
 
 
323 aa  252  6e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  44.78 
 
 
326 aa  249  4e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  42.02 
 
 
324 aa  249  5e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  42 
 
 
322 aa  248  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  41.88 
 
 
320 aa  246  4e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5304  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.85 
 
 
311 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  43.14 
 
 
318 aa  245  6.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  43.43 
 
 
321 aa  245  8e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4311  ABC transporter related  43.23 
 
 
317 aa  245  9e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  40.78 
 
 
318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  42.76 
 
 
307 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  45.21 
 
 
315 aa  242  6e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  43.45 
 
 
319 aa  241  7.999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0718  ABC transporter related  43.28 
 
 
314 aa  241  7.999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226076  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  42.81 
 
 
319 aa  241  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  43.52 
 
 
308 aa  240  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  41.58 
 
 
322 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  41.04 
 
 
323 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  41.04 
 
 
323 aa  238  9e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  43.58 
 
 
316 aa  238  9e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  41.28 
 
 
312 aa  236  3e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  42.91 
 
 
350 aa  236  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2055  export ABC transporter ATP-binding protein  41.72 
 
 
312 aa  236  5.0000000000000005e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.35923  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  42.28 
 
 
328 aa  235  6e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0147  ABC transporter, ATP-binding protein  41.72 
 
 
309 aa  235  8e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000626362  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  51.57 
 
 
304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1793  ABC transporter related  42.57 
 
 
313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00000132087  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3667  ABC transporter related  42.91 
 
 
311 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  40.66 
 
 
312 aa  232  6e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2926  ABC transporter related  41.84 
 
 
316 aa  232  7.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  41.72 
 
 
319 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  42.66 
 
 
314 aa  232  8.000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0505  ABC transporter related  40.47 
 
 
308 aa  231  1e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.509772  normal  0.852772 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  49.54 
 
 
510 aa  228  8e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1341  ABC transporter related  48.67 
 
 
317 aa  228  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  47.51 
 
 
270 aa  228  1e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3112  ABC transporter, ATPase subunit  41.22 
 
 
310 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0349  ABC transporter-related protein  42.81 
 
 
328 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1148  ABC transporter related  40.26 
 
 
307 aa  227  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00842419  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3130  ABC transporter component  41.97 
 
 
316 aa  227  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00961649  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1606  ABC transporter, ATP-binding protein  38.76 
 
 
315 aa  226  4e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.704701  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  47.75 
 
 
257 aa  226  4e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0408  ABC transporter related  44.07 
 
 
331 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  47.58 
 
 
582 aa  226  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  48.62 
 
 
255 aa  225  6e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  41.2 
 
 
322 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3463  ABC transporter-related protein  39.07 
 
 
305 aa  224  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0699  ATPase  42.37 
 
 
354 aa  224  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  42.91 
 
 
309 aa  225  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0457  ABC transporter related  42.95 
 
 
331 aa  223  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0665642  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3306  ABC transporter related  40.54 
 
 
310 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3113  ABC transporter, ATPase subunit  41.22 
 
 
322 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  46.33 
 
 
512 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  40.47 
 
 
333 aa  222  4.9999999999999996e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  40.53 
 
 
314 aa  222  6e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0403  ABC transporter, ATP-binding protein  41.33 
 
 
305 aa  222  7e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0658  ABC transporter-related protein  38.08 
 
 
308 aa  221  8e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3307  ABC transporter related  40.88 
 
 
322 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  45.25 
 
 
580 aa  220  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  45.41 
 
 
247 aa  220  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3221  ABC transporter-related protein  40.2 
 
 
310 aa  219  3e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.357398  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2106  ABC transporter related  41.47 
 
 
311 aa  220  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  45.85 
 
 
912 aa  219  6e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  45.25 
 
 
580 aa  219  6e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  44.3 
 
 
248 aa  218  7.999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1514  ABC transporter related  47.69 
 
 
205 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0860  ABC transporter related  37.17 
 
 
315 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134812  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  47.93 
 
 
576 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  45.25 
 
 
593 aa  216  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3788  ABC transporter, ATP binding protein  43.72 
 
 
913 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3855  ABC transporter permease and ATP-binding protein  43.72 
 
 
913 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3778  ABC transporter permease and ATP-binding protein  43.72 
 
 
913 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0174984  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1913  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  38.87 
 
 
314 aa  216  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173813  normal  0.389183 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3898  ABC transporter permease and ATP-binding protein  43.72 
 
 
913 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0719  hypothetical protein  39.61 
 
 
308 aa  216  5e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1763  ABC transporter related  39.6 
 
 
311 aa  216  5e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.612212  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0738  hypothetical protein  39.81 
 
 
308 aa  215  7e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>