50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0830 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0830  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 267 aa  550  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3316  phytanoyl-CoA dioxygenase  37.74 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2304  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.82 
 
 		 277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.462122 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11532  hypothetical protein  24.9 
 
 		 273 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.547495 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0445  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.71 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13664  hypothetical protein  27.75 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0231349 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3752  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.84 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.263917 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0212  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.14 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06818  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00480)  26.61 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.434401 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2677  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.34 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0852  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.8 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2409  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.61 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937335 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.51 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2807  hypothetical protein  27.89 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00870169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5239  hypothetical protein  22.91 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.768643  normal  0.611643 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6398  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.24 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1305  hypothetical protein  21.16 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96448 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6790  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.48 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4440  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.14 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588314 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4330  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.14 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.0982563 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3404  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin, putative  23.75 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000622866 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3772  phytanoyl-CoA dioxygenase  20.55 
 
 		 285 aa  54.3  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  25 
 
 		 281 aa  53.1  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2814  hypothetical protein  29.87 
 
 		 289 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0110408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2811  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.63 
 
 		 394 aa  49.7  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3154  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.95 
 
 		 302 aa  49.7  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0588837  normal  0.0946962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3967  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.85 
 
 		 400 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  22.27 
 
 		 268 aa  48.9  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0914  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.08 
 
 		 394 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10130  dioxygenase  23.08 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000187903  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1391  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.33 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.633515  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.07 
 
 		 280 aa  47  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5728  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.4 
 
 		 287 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4420  ectoine hydroxylase  32.65 
 
 		 299 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4259  ectoine hydroxylase  32.65 
 
 		 299 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104748  normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4193  ectoine hydroxylase  32.65 
 
 		 299 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0556414  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2614  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.03 
 
 		 387 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41990  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.4 
 
 		 248 aa  46.2  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1704  MmcH, putative  20.27 
 
 		 256 aa  45.4  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.408123  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  20.09 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2447  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.27 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1239  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.93 
 
 		 295 aa  43.9  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.424145 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1278  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.43 
 
 		 389 aa  43.5  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0445475  normal  0.279697 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.31 
 
 		 253 aa  42.7  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05540  ectoine hydroxylase  24.66 
 
 		 298 aa  43.1  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 		 260 aa  42.7  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7153  hypothetical protein  22.22 
 
 		 304 aa  42.4  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1343  ectoine hydroxylase  26.97 
 
 		 304 aa  42.7  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00503536 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0110  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.82 
 
 		 260 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.806567 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5271  ectoine hydroxylase  22.58 
 
 		 304 aa  42.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442083 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>