25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0798 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0798  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
106 aa  210  6e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0077  transcriptional regulator, MarR family  53.85 
 
 
123 aa  121  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0075  hypothetical protein  53.85 
 
 
119 aa  121  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.492239  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0358  transcriptional regulator, MarR family  55.34 
 
 
105 aa  120  6e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1145  hypothetical protein  61.22 
 
 
126 aa  119  1e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1236  hypothetical protein  50.98 
 
 
134 aa  113  1e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.82618  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2316  AsnC family transcriptional regulator  47.62 
 
 
125 aa  110  6e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.153749 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1570  transcriptional regulator, MarR family  47.62 
 
 
119 aa  109  1e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587855  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0758  MarR family transcriptional regulator  49.06 
 
 
124 aa  109  1e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.663702  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1794  AsnC family transcriptional regulator  53.66 
 
 
111 aa  86.3  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0756  MarR family transcriptional regulator  54.24 
 
 
77 aa  68.6  3e-11  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.58096  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3448  transcriptional regulator, MarR family  47.56 
 
 
201 aa  67  7e-11  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3514  transcriptional regulator, MarR family  47.56 
 
 
203 aa  67  8e-11  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.74673e-09 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0892  hypothetical protein  43.37 
 
 
198 aa  63.2  1e-09  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.656766  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1123  hypothetical protein  44.87 
 
 
191 aa  63.2  1e-09  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2656  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  37.78 
 
 
691 aa  62.4  2e-09  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3791  regulatory protein, MarR  44.44 
 
 
204 aa  61.6  3e-09  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2889  hypothetical protein  35.58 
 
 
202 aa  60.5  8e-09  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0208213 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1283  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 
192 aa  57.8  4e-08  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3340  sulfate adenylyltransferase  34.04 
 
 
690 aa  58.2  4e-08  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10273  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1291  regulatory protein MarR  33.33 
 
 
170 aa  55.5  2e-07  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0934  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
167 aa  55.1  4e-07  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0625  hypothetical protein  36.36 
 
 
212 aa  54.3  5e-07  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2752  regulatory protein, MarR  37.5 
 
 
205 aa  47.8  5e-05  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3966  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 
180 aa  42.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00108309  normal  0.0312935 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>