111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0796 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0796  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  325  1.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4081  hypothetical protein  49.7 
 
 
177 aa  168  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0580442  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1952  hypothetical protein  49.09 
 
 
178 aa  163  9e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3392  hypothetical protein  52.2 
 
 
165 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00223  hypothetical protein  52.2 
 
 
165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3379  conserved hypothetical protein  52.2 
 
 
165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00227  hypothetical protein  52.2 
 
 
165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4825  transposase and inactivated derivative  49.68 
 
 
163 aa  160  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33360  hypothetical protein  48.47 
 
 
176 aa  160  6e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0240  hypothetical protein  50.96 
 
 
165 aa  159  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  47.27 
 
 
177 aa  158  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1685  transposase, putative  49.04 
 
 
184 aa  155  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.207714 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  44.17 
 
 
175 aa  155  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  48.45 
 
 
171 aa  154  7e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3130  transposase and inactivated derivatives  46.95 
 
 
178 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0127624  normal  0.415202 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  45.12 
 
 
178 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3405  hypothetical protein  47.56 
 
 
179 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0242544  normal  0.205029 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0768  hypothetical protein  44.85 
 
 
175 aa  149  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333217  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1473  transposase, putative  46.95 
 
 
179 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1962  hypothetical protein  45.4 
 
 
164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1384  hypothetical protein  43.98 
 
 
180 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.705846 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2421  hypothetical protein  43.95 
 
 
161 aa  141  4e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2530  hypothetical protein  43.53 
 
 
179 aa  141  5e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  41.21 
 
 
176 aa  140  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1689  hypothetical protein  43.23 
 
 
184 aa  137  7.999999999999999e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.625848  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  44.52 
 
 
179 aa  134  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  42.14 
 
 
187 aa  134  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2531  transposase  41.51 
 
 
187 aa  133  8e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  38.32 
 
 
176 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  40.35 
 
 
191 aa  130  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2478  hypothetical protein  42.47 
 
 
161 aa  130  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0361  hypothetical protein  39.18 
 
 
191 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2890  hypothetical protein  39.18 
 
 
191 aa  121  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  36.59 
 
 
178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0721b  hypothetical protein  46.09 
 
 
133 aa  112  3e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2532  hypothetical protein  33.56 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.709096 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  28.57 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3976  protein of unknown function DUF1568  31.53 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183049  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2244  transposase  32.24 
 
 
161 aa  63.5  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.196666  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4421  hypothetical protein  30.43 
 
 
152 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1552  hypothetical protein  27.48 
 
 
205 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0339239 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1364  hypothetical protein  23.85 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968684  normal  0.0104776 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  26.95 
 
 
153 aa  55.1  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01210  transposase  29.73 
 
 
245 aa  55.1  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3477  hypothetical protein  28 
 
 
188 aa  54.7  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.379705  normal  0.40189 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1784  hypothetical protein  37.89 
 
 
197 aa  53.9  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0568  hypothetical protein  26.21 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2468  hypothetical protein  26.72 
 
 
181 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.321631  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  27.62 
 
 
153 aa  53.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3154  hypothetical protein  44.44 
 
 
58 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0787684 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0607  hypothetical protein  26.21 
 
 
151 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1574  hypothetical protein  27.18 
 
 
150 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0262  hypothetical protein  23.19 
 
 
152 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  25.35 
 
 
152 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  26.73 
 
 
214 aa  50.8  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  25.17 
 
 
234 aa  50.4  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0613  hypothetical protein  26.97 
 
 
151 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4599  hypothetical protein  23.08 
 
 
160 aa  49.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0885  protein of unknown function DUF1568  31.68 
 
 
169 aa  48.5  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5083  hypothetical protein  23.74 
 
 
151 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268045  normal  0.309651 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  30.7 
 
 
224 aa  48.9  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  26.17 
 
 
226 aa  48.5  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  23.6 
 
 
150 aa  48.5  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  24.49 
 
 
216 aa  48.5  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1685  hypothetical protein  24.72 
 
 
149 aa  47.8  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365398  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4462  hypothetical protein  22.94 
 
 
152 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  25.66 
 
 
234 aa  47.4  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4549  hypothetical protein  23.45 
 
 
181 aa  47.4  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5047  hypothetical protein  25.47 
 
 
151 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0419469  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  21.83 
 
 
1372 aa  47.4  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1676  hypothetical protein  27.97 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2563  hypothetical protein  26.95 
 
 
176 aa  47  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000213064  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  25.66 
 
 
222 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  25.16 
 
 
221 aa  47  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  25.18 
 
 
163 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5411  protein of unknown function DUF1568  24.35 
 
 
218 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000187281  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0943  protein of unknown function DUF1568  21.68 
 
 
163 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  26.26 
 
 
235 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4597  hypothetical protein  22.58 
 
 
151 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0971888 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  22.05 
 
 
1345 aa  45.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  26.8 
 
 
232 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5382  hypothetical protein  26.67 
 
 
223 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.588654 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3612  hypothetical protein  26.21 
 
 
201 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0368765  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2065  hypothetical protein  24.84 
 
 
184 aa  44.3  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  25.33 
 
 
236 aa  44.3  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3712  hypothetical protein  27.27 
 
 
177 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013542 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3277  protein of unknown function DUF1568  30.21 
 
 
197 aa  43.9  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  22.95 
 
 
231 aa  43.9  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5176  hypothetical protein  26.97 
 
 
184 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00299086  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  25.81 
 
 
234 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3919  hypothetical protein  24.53 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0968412  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  25.81 
 
 
168 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  25 
 
 
221 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  26.97 
 
 
149 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  20.41 
 
 
326 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  28.04 
 
 
165 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3295  hypothetical protein  24.21 
 
 
230 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5236  hypothetical protein  24.16 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  24.84 
 
 
240 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  25.49 
 
 
174 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>