More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0794 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  40.48 
 
 		 852 aa  673    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  100 
 
 		 869 aa  1749    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  56.05 
 
 		 869 aa  1012    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  38.67 
 
 		 919 aa  627  1e-178  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  38.88 
 
 		 910 aa  618  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  38.13 
 
 		 931 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  37.69 
 
 		 922 aa  610  1e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  38.17 
 
 		 915 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  38.85 
 
 		 897 aa  606  9.999999999999999e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  39.38 
 
 		 828 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  39.22 
 
 		 827 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  37.51 
 
 		 920 aa  599  1e-170  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  39.49 
 
 		 828 aa  595  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  38.43 
 
 		 920 aa  588  1e-166  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  37.17 
 
 		 912 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  37.33 
 
 		 919 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  37.68 
 
 		 921 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  39.49 
 
 		 828 aa  572  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  35.52 
 
 		 833 aa  498  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000033468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  32.83 
 
 		 837 aa  326  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  32.83 
 
 		 837 aa  326  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  32.53 
 
 		 837 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  32.38 
 
 		 948 aa  260  8e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  31.5 
 
 		 781 aa  242  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  32.08 
 
 		 1055 aa  238  4e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  32.83 
 
 		 833 aa  238  5.0000000000000005e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  32.3 
 
 		 936 aa  234  7.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  31.39 
 
 		 834 aa  229  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  32.28 
 
 		 869 aa  226  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  27.46 
 
 		 947 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  30.73 
 
 		 977 aa  219  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  30.24 
 
 		 952 aa  214  4.9999999999999996e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  26.72 
 
 		 824 aa  211  5e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  33.15 
 
 		 940 aa  199  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  37.34 
 
 		 849 aa  195  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2568  Soluble ligand binding domain protein  27.38 
 
 		 812 aa  193  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  28.93 
 
 		 779 aa  192  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  27.63 
 
 		 753 aa  190  9e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4937  polysaccharide export protein  26.54 
 
 		 800 aa  184  6e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00100729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  28.04 
 
 		 830 aa  184  7e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1986  polysaccharide biosynthesis protein, putative  28.71 
 
 		 877 aa  181  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  24.75 
 
 		 846 aa  180  8e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3949  polysaccharide export protein  26.59 
 
 		 823 aa  180  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.256427 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0660  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  28.52 
 
 		 877 aa  180  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  24.34 
 
 		 830 aa  178  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4605  polysaccharide export protein  25.42 
 
 		 791 aa  178  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  34.51 
 
 		 803 aa  178  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1959  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  30.65 
 
 		 875 aa  173  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.940843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0566  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  30.4 
 
 		 800 aa  172  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  34.69 
 
 		 576 aa  162  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1345  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  32.3 
 
 		 568 aa  154  7e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291611 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1344  polysaccharide export protein  41.84 
 
 		 425 aa  123  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232143 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2584  polysaccharide export protein  30.23 
 
 		 605 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000240824 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  29.24 
 
 		 580 aa  111  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  29.22 
 
 		 478 aa  108  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  27.76 
 
 		 495 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  27.49 
 
 		 473 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3241  polysaccharide export protein  30.29 
 
 		 587 aa  101  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2475  polysaccharide export protein  30.18 
 
 		 283 aa  100  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0246  polysaccharide export protein  30.25 
 
 		 537 aa  99  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000856367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  30.08 
 
 		 508 aa  99  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001787  capsular polysaccharide export system periplasmic protein KpsD  26.95 
 
 		 579 aa  98.6  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1985  outer membrane protein, putative  29.25 
 
 		 282 aa  97.4  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3865  putative polysaccharide export protein  28.63 
 
 		 379 aa  96.3  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  28.98 
 
 		 379 aa  96.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4938  polysaccharide export protein  27.91 
 
 		 603 aa  95.5  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03058  capsular polysaccharide transport protein, putative  30.67 
 
 		 609 aa  95.1  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1618  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  29.89 
 
 		 552 aa  93.6  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  29.03 
 
 		 347 aa  94  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1779  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  28.85 
 
 		 552 aa  92.8  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1438  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  29.5 
 
 		 552 aa  92.8  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.473166  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5729  polysialic acid transport protein KpsD  29.39 
 
 		 606 aa  92.4  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  27.15 
 
 		 379 aa  92.4  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  27.78 
 
 		 277 aa  92  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0293  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  27.82 
 
 		 552 aa  92  4e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.994472  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0621  KpsD protein  26.18 
 
 		 606 aa  91.7  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  28.37 
 
 		 270 aa  91.3  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  31.36 
 
 		 392 aa  90.9  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1690  polysaccharide export protein  27.53 
 
 		 558 aa  89.7  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  26.49 
 
 		 495 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1769  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  32.52 
 
 		 268 aa  89.7  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  27.45 
 
 		 551 aa  89.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0359634 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  28.19 
 
 		 392 aa  89.7  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0819  polysaccharide export protein  27.1 
 
 		 379 aa  89.4  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  27.57 
 
 		 388 aa  89.4  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1826  polysaccharide export protein  28.47 
 
 		 516 aa  89.4  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.698968  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  26.19 
 
 		 495 aa  89.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  28.19 
 
 		 392 aa  89  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  26.42 
 
 		 387 aa  88.2  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  27.44 
 
 		 264 aa  88.2  7e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2478  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  32.38 
 
 		 268 aa  87.8  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02816  KpsD protein  27.19 
 
 		 558 aa  87.4  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1307  polysaccharide export protein  27.76 
 
 		 565 aa  87.4  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3221  polysialic acid capsule transport protein KpsD  27.19 
 
 		 558 aa  87.4  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.364488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02766  hypothetical protein  27.19 
 
 		 558 aa  87.4  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000332683  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0310  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.45 
 
 		 703 aa  87  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  27.14 
 
 		 373 aa  86.3  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  27.85 
 
 		 392 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  27.85 
 
 		 387 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  27.85 
 
 		 387 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>