181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0788 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  315  1e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1685  hypothetical protein  62.67 
 
 
149 aa  203  7e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365398  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5236  hypothetical protein  44.83 
 
 
151 aa  133  9e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  46 
 
 
149 aa  130  7.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5047  hypothetical protein  42.18 
 
 
151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0419469  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5083  hypothetical protein  42.76 
 
 
151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268045  normal  0.309651 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  40 
 
 
152 aa  122  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  45.89 
 
 
153 aa  122  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  42 
 
 
153 aa  122  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4421  hypothetical protein  40 
 
 
152 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0262  hypothetical protein  40 
 
 
152 aa  120  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3919  hypothetical protein  40.69 
 
 
151 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0968412  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4597  hypothetical protein  41.38 
 
 
151 aa  116  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0971888 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0568  hypothetical protein  43.45 
 
 
151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0607  hypothetical protein  42.07 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1364  hypothetical protein  40.69 
 
 
150 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968684  normal  0.0104776 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0613  hypothetical protein  38.62 
 
 
151 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5176  hypothetical protein  41.22 
 
 
184 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00299086  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1574  hypothetical protein  37.24 
 
 
150 aa  107  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3976  protein of unknown function DUF1568  34.27 
 
 
151 aa  90.1  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183049  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0943  protein of unknown function DUF1568  34.01 
 
 
163 aa  88.6  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  34.03 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16060  hypothetical protein  39.77 
 
 
86 aa  77.4  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02923  hypothetical protein  28.57 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  28.67 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  29.69 
 
 
163 aa  64.3  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  28.57 
 
 
178 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5411  protein of unknown function DUF1568  32.04 
 
 
218 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000187281  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  26.85 
 
 
176 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3702  hypothetical protein  27.97 
 
 
208 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000809832 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  35.37 
 
 
1345 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  35.9 
 
 
1372 aa  57.8  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  29.08 
 
 
171 aa  57.4  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3477  hypothetical protein  27.07 
 
 
188 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.379705  normal  0.40189 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  28.15 
 
 
176 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  28.19 
 
 
236 aa  53.9  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2468  hypothetical protein  26.76 
 
 
181 aa  53.9  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.321631  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3592  protein of unknown function DUF1568  26.47 
 
 
235 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00165115  hitchhiker  0.000000708999 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4599  hypothetical protein  31.58 
 
 
160 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0364  transposase-like protein  25.74 
 
 
235 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.72516  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  34.48 
 
 
224 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4223  hypothetical protein  28.69 
 
 
212 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2531  transposase  26.49 
 
 
187 aa  51.6  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  32.03 
 
 
163 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  32.03 
 
 
163 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  26.06 
 
 
177 aa  52  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1966  hypothetical protein  37.33 
 
 
231 aa  52  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.74185  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  27.15 
 
 
187 aa  51.6  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1784  hypothetical protein  28.57 
 
 
197 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  28.85 
 
 
221 aa  51.6  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5035  protein of unknown function DUF1568  22.67 
 
 
214 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.916294 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2789  hypothetical protein  25.74 
 
 
235 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603101  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02732  hypothetical protein  36.84 
 
 
91 aa  51.2  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.979452  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  26.62 
 
 
177 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4825  transposase and inactivated derivative  30.23 
 
 
163 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1423  protein of unknown function DUF1568  27.27 
 
 
180 aa  50.4  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7985800000000005e-18 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  25 
 
 
233 aa  50.4  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0300  hypothetical protein  26.17 
 
 
193 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.401229  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0844  hypothetical protein  28.89 
 
 
340 aa  50.4  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0740  hypothetical protein  24.46 
 
 
255 aa  50.1  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345588  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2643  transposase domain-containing protein  24.82 
 
 
335 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0240  hypothetical protein  31.52 
 
 
165 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  32.97 
 
 
234 aa  49.7  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  24.82 
 
 
179 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1552  hypothetical protein  24.03 
 
 
205 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0339239 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  27.97 
 
 
258 aa  49.7  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3015  hypothetical protein  25 
 
 
237 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1689  hypothetical protein  25.68 
 
 
184 aa  49.3  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.625848  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3379  conserved hypothetical protein  29.55 
 
 
165 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2737  hypothetical protein  25 
 
 
237 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3719  transposase  25 
 
 
237 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1084  transposase and inactivated derivatives  23.4 
 
 
338 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1092  hypothetical protein  26.03 
 
 
223 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462205  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  28.74 
 
 
168 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  25.53 
 
 
232 aa  48.9  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3215  hypothetical protein  25 
 
 
237 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1766  hypothetical protein  25 
 
 
237 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3691  hypothetical protein  25 
 
 
237 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3749  hypothetical protein  25 
 
 
237 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2788  hypothetical protein  25 
 
 
237 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  26.02 
 
 
216 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0796  hypothetical protein  23.6 
 
 
159 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3498  hypothetical protein  24.26 
 
 
237 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.827202  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0380  hypothetical protein  24.26 
 
 
237 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2706  hypothetical protein  24.26 
 
 
237 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0803898  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  26.72 
 
 
236 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0401  hypothetical protein  24.26 
 
 
237 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  29.17 
 
 
222 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0242  protein of unknown function DUF1568  26.76 
 
 
298 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0717597  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  24.26 
 
 
253 aa  47.8  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  24.26 
 
 
253 aa  47.8  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0361  hypothetical protein  25.85 
 
 
191 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0320  hypothetical protein  24.26 
 
 
237 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396962  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0329  hypothetical protein  24.26 
 
 
237 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  25.36 
 
 
321 aa  47.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  26.09 
 
 
316 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1962  hypothetical protein  27.27 
 
 
164 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2530  hypothetical protein  27.27 
 
 
179 aa  47  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0304  hypothetical protein  24.26 
 
 
237 aa  47  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00227  hypothetical protein  28.41 
 
 
165 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>