69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0766 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0766  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  100 
 
 		 132 aa  260  4.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2749  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.71 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000604606  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2585  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.5 
 
 		 130 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000212728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1351  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.58 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0110439  hitchhiker  0.00767889 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01827  hypothetical protein  37.04 
 
 		 135 aa  62  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3146  H-NS family DNA-binding protein  32.06 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0019  H-NS histone family  36.84 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1444  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.82 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.292783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2856  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.6 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2867  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.06 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00308675  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1510  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.06 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000161891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2848  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.06 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000899352  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2996  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.06 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.18601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2512  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.6 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00123836  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1404  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.06 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000773951  normal  0.9865 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1416  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.06 
 
 		 130 aa  60.1  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00233677  normal  0.422691 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2540  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  31.3 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000233995  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2148  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  33.59 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00994  DNA-binding protein, H-NS family  31.06 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000272824  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3237  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.58 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.602482 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1168  H-NS family DNA-binding protein  32.82 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.827071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2145  DNA binding protein, global metabolism regulator  34.71 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.110406  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3053  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.37 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0965485  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1152  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.08 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2945  DNA binding protein, nucleoid-associated  30.83 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.14201 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2913  DNA binding protein, nucleoid-associated  30.83 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2980  DNA binding protein, nucleoid-associated  30.83 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.681217  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3102  DNA binding protein, nucleoid-associated  30.83 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.669725  normal  0.844597 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2997  DNA binding protein, nucleoid-associated  30.83 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.0364479 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2158  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  41.33 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232102  normal  0.811955 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2575  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.32 
 
 		 133 aa  51.2  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1489  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.33 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3212  DNA binding protein, nucleoid-associated  33.82 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1014  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.82 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3911  DNA binding protein, nucleoid-associated  33.82 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.268261 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02489  hypothetical protein  33.82 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2789  DNA binding protein, nucleoid-associated  33.82 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.338985 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2949  DNA binding protein, nucleoid-associated  33.82 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2804  DNA binding protein, nucleoid-associated  34.62 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1037  DNA binding protein, nucleoid-associated  33.82 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02525  DNA binding protein, nucleoid-associated  33.82 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003852  DNA-binding protein H-NS  36.5 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0195644  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0123  DNA-binding protein H-NS  33.61 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.577813  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2842  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.11 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00137778  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0700  DNA-binding protein VicH  37.61 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2329  H-NS histone family protein  30.3 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.1305  hitchhiker  0.00000000912792 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1981  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  27.5 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.295466  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2605  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.13 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.730726  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3149  DNA binding protein, nucleoid-associated  29.85 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000112797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1144  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  39.47 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439674  normal  0.582774 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1065  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  39.47 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0838  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.93 
 
 		 94 aa  44.3  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0441  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.31 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.940607  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4476  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.82 
 
 		 132 aa  43.5  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00112117  normal  0.570223 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2282  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  25.98 
 
 		 135 aa  42.7  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2199  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.17 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.927569  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1150  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.83 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1957  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  28.33 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4689  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  39.51 
 
 		 92 aa  42  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0002  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  29.69 
 
 		 131 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0049965  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1341  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.92 
 
 		 74 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000011697  hitchhiker  0.000659538 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1754  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.08 
 
 		 133 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02004  putative HNS-like transcription regulator protein  38.96 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0969964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4285  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.86 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0787  DNA-binding protein H-NS  28.26 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.123185  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3806  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  44.59 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0101066  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1136  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.96 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00265311  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0306  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  25.62 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.265101  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1370  nucleoid protein H-NS  31.58 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.620152  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>