39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0713 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0713  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  428  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0189  hypothetical protein  48.68 
 
 
196 aa  178  4.999999999999999e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2264  hypothetical protein  45.45 
 
 
199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0680426  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1832  hypothetical protein  49.13 
 
 
197 aa  170  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1310  hypothetical protein  45.5 
 
 
197 aa  159  2e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2333  hypothetical protein  41.8 
 
 
195 aa  157  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000127187  normal  0.606412 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0063  hypothetical protein  42.7 
 
 
210 aa  154  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3403  membrane lipoprotein lipid attachment site  32.31 
 
 
197 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00726225  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3601  membrane lipoprotein lipid attachment site  32.31 
 
 
201 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3478  membrane lipoprotein lipid attachment site  32.31 
 
 
201 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0966746  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0884  membrane lipoprotein lipid attachment site  32.31 
 
 
201 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000370182  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0824  membrane lipoprotein lipid attachment site  32.31 
 
 
201 aa  107  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.525373  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1060  hypothetical protein  32.31 
 
 
197 aa  106  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0898  hypothetical protein  32.31 
 
 
201 aa  106  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000138757  normal  0.418189 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3039  hypothetical protein  32.31 
 
 
201 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000888459  normal  0.414715 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0935  hypothetical protein  32.31 
 
 
201 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000406943  normal  0.0868767 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2914  hypothetical protein  32.82 
 
 
201 aa  105  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000421511  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3015  membrane lipoprotein lipid attachment site  32.31 
 
 
201 aa  105  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3243  hypothetical protein  32.31 
 
 
201 aa  104  8e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.126868  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0964  membrane lipoprotein lipid attachment site  32.65 
 
 
197 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0219897  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0914  hypothetical protein  31.63 
 
 
201 aa  102  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.310752  normal  0.0133601 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0637  hypothetical protein  31.28 
 
 
201 aa  101  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0353203  normal  0.98697 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0836  membrane lipoprotein lipid attachment site  31.09 
 
 
197 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0143317  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0596  putative lipoprotein  32.26 
 
 
200 aa  84.7  9e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2065  putative lipoprotein  30.67 
 
 
196 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.274451  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0633  membrane lipoprotein lipid attachment site  30.15 
 
 
196 aa  84.3  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1313  membrane lipoprotein lipid attachment site  31.41 
 
 
196 aa  83.2  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.565237  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01522  hypothetical protein  29.44 
 
 
195 aa  82.4  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1812  membrane lipoprotein lipid attachment site  31.1 
 
 
204 aa  82  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004000  putative lipoprotein  29.29 
 
 
196 aa  82  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1484  putative lipoprotein  29.08 
 
 
196 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.233925  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1891  membrane lipoprotein lipid attachment site  30.06 
 
 
204 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0606  membrane lipoprotein lipid attachment site  28.22 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  0.467937 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1298  putative lipoprotein  30.11 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.41074  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2514  putative lipoprotein  27.18 
 
 
204 aa  72  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3947  membrane lipoprotein lipid attachment site  24.19 
 
 
200 aa  71.6  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191679  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5474  putative lipoprotein  26.63 
 
 
195 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3851  membrane lipoprotein lipid attachment site  23.37 
 
 
199 aa  46.6  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.160992  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1219  hypothetical protein  26.58 
 
 
213 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.702073 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>