More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0674 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
447 aa  915    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.504244  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  44.8 
 
 
451 aa  381  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  43.65 
 
 
451 aa  377  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  41.56 
 
 
459 aa  347  3e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  43.38 
 
 
456 aa  343  2e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 
485 aa  336  5e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  40.41 
 
 
456 aa  335  1e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  40.62 
 
 
481 aa  334  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.11 
 
 
449 aa  328  9e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 
471 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 
471 aa  324  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 
469 aa  323  4e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6398  histidine kinase  38.63 
 
 
461 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.176497 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  38.22 
 
 
458 aa  319  7e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4528  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 
461 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25442  normal  0.575982 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 
478 aa  316  4e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  38.51 
 
 
470 aa  317  4e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  38.96 
 
 
466 aa  316  6e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  38.96 
 
 
466 aa  316  6e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  38.96 
 
 
466 aa  316  6e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 
461 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  38.74 
 
 
466 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 
459 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 
480 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 
480 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  38.74 
 
 
466 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  38.74 
 
 
466 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  38.74 
 
 
466 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.16 
 
 
475 aa  313  4.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  37.84 
 
 
460 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 
459 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 
459 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0877  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 
474 aa  312  7.999999999999999e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.858486  normal  0.37178 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  40.71 
 
 
456 aa  310  5e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.67 
 
 
486 aa  307  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3522  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.25 
 
 
477 aa  305  8.000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 
488 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3405  histidine kinase  39.78 
 
 
488 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352666  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  39.81 
 
 
501 aa  305  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.47 
 
 
480 aa  300  4e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.165919 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0021  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  40.22 
 
 
487 aa  299  8e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130425  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1405  sensor histidine kinase  36.78 
 
 
483 aa  288  1e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1261  sensor histidine kinase  35.65 
 
 
467 aa  286  4e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2291  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.5 
 
 
464 aa  278  1e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0906  sensor histidine kinase  35.67 
 
 
469 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0178022  hitchhiker  0.0000002134 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5321  histidine kinase  34.51 
 
 
470 aa  262  6.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1122  histidine kinase  33.26 
 
 
467 aa  238  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2596  methyl-accepting chemotaxis protein  35.19 
 
 
564 aa  169  9e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000057467  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3748  histidine kinase  37.28 
 
 
287 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.65 
 
 
564 aa  140  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  38.22 
 
 
388 aa  138  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  34.65 
 
 
557 aa  136  7.000000000000001e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  35.21 
 
 
391 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1423  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.23 
 
 
584 aa  133  7.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2438  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 
599 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  36.77 
 
 
482 aa  131  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  34.08 
 
 
683 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 
403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  35.34 
 
 
1226 aa  125  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1701  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 
521 aa  124  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.279897 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 
1229 aa  123  6e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  34.48 
 
 
1101 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3956  histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  33.77 
 
 
323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  34.45 
 
 
325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1808  histidine kinase  34.91 
 
 
461 aa  121  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 
468 aa  120  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 
700 aa  120  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 
399 aa  120  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1055  putative signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 
401 aa  120  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1071  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 
401 aa  120  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2833  histidine kinase  35.91 
 
 
447 aa  119  9e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.665069  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0253  sensory box histidine kinase  34.53 
 
 
830 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0766  histidine kinase  30.46 
 
 
464 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.701174  normal  0.667801 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
770 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 
447 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 
700 aa  119  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.6571 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1082  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3863  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 
446 aa  118  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.165954  normal  0.826823 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1982  sensor histidine kinase, putative  33.8 
 
 
344 aa  117  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 
490 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  32.57 
 
 
772 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1316  sensor histidine protein kinase  36.54 
 
 
525 aa  117  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176896  normal  0.0650582 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1145  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 
490 aa  116  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894172  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  35.75 
 
 
373 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  34.68 
 
 
373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  27.48 
 
 
559 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  32.87 
 
 
392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2464  ATPase domain-containing protein  33.8 
 
 
344 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
535 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2416  histidine kinase  33.8 
 
 
344 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01020  sensory box histidine kinase  33.18 
 
 
710 aa  114  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  29.79 
 
 
619 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4714  Two-component sensor histidine kinase  34.39 
 
 
447 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06146  sensory box histidine kinase  33.18 
 
 
710 aa  114  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0682167  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  29.79 
 
 
680 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4896  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 
517 aa  114  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133704  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 
359 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1633  sensory box histidine kinase  29.79 
 
 
680 aa  114  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736823  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1847  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 
509 aa  113  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.645356  normal  0.352228 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0179  histidine kinase  34.67 
 
 
418 aa  113  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>