More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0638 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  100 
 
 
127 aa  259  6.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1191  rare lipoprotein A  57.69 
 
 
137 aa  148  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0103428  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1159  rare lipoprotein A  56.92 
 
 
137 aa  147  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1099  rare lipoprotein A  61.11 
 
 
137 aa  147  6e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3199  rare lipoprotein A  60.32 
 
 
137 aa  146  9e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.476215 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1087  rare lipoprotein A  69.39 
 
 
137 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198857  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2925  rare lipoprotein A  55.47 
 
 
131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542762  normal  0.960084 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0060  rare lipoprotein A  58.2 
 
 
129 aa  144  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1773  rare lipoprotein A  57.26 
 
 
127 aa  142  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3104  rare lipoprotein A  65.98 
 
 
131 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3007  rare lipoprotein A  65.98 
 
 
147 aa  137  6e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0729065  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  54.81 
 
 
163 aa  131  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  57.45 
 
 
167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  49.59 
 
 
124 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  64.04 
 
 
140 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  46.83 
 
 
145 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  47.62 
 
 
124 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  48.76 
 
 
124 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  48.76 
 
 
155 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  50 
 
 
181 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  48.76 
 
 
124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  52.78 
 
 
122 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1517  rare lipoprotein A  50.39 
 
 
127 aa  125  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000581263  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  63.74 
 
 
124 aa  122  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  49.18 
 
 
139 aa  120  5e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  49.17 
 
 
163 aa  119  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  57.61 
 
 
150 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  41.96 
 
 
163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  55.32 
 
 
114 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  47.11 
 
 
199 aa  117  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  56.57 
 
 
267 aa  117  6e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0201  rare lipoprotein A  50.85 
 
 
133 aa  117  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3653  rare lipoprotein A  51.85 
 
 
175 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.812873 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  55.56 
 
 
267 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  47.86 
 
 
119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  57.14 
 
 
360 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  57.14 
 
 
360 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  57.61 
 
 
171 aa  115  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  54.74 
 
 
142 aa  115  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  58.33 
 
 
263 aa  114  6e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  48.18 
 
 
121 aa  114  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2527  rare lipoprotein A  51.59 
 
 
214 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00936406  normal  0.0858396 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4765  rare lipoprotein A  61.8 
 
 
179 aa  113  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  54.64 
 
 
342 aa  113  7.999999999999999e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  53.68 
 
 
121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0084  rare lipoprotein A  55.66 
 
 
213 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.332012  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  55.21 
 
 
125 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  53.1 
 
 
168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7192  Lipoprotein-like protein  61.11 
 
 
257 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0272359 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  51.92 
 
 
211 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  55.91 
 
 
125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2481  rare lipoprotein A  52.68 
 
 
162 aa  111  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.383159  normal  0.0948331 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  56.52 
 
 
170 aa  111  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  53.76 
 
 
381 aa  111  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2181  rare lipoprotein A  53.33 
 
 
239 aa  110  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000683407  decreased coverage  0.000000439992 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  56.04 
 
 
165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  54.95 
 
 
171 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  55.21 
 
 
285 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  52.58 
 
 
332 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  55.21 
 
 
243 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  46.38 
 
 
134 aa  110  7.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  52.08 
 
 
293 aa  110  9e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  51.38 
 
 
206 aa  110  9e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  52.58 
 
 
333 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  50.96 
 
 
211 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  50.96 
 
 
230 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  55.91 
 
 
153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  50.96 
 
 
230 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  52.58 
 
 
333 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  47.27 
 
 
324 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  50.96 
 
 
211 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  50.96 
 
 
211 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  50.96 
 
 
242 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  51.38 
 
 
206 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  53.76 
 
 
358 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  50.96 
 
 
242 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  39.85 
 
 
142 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  54.17 
 
 
264 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  49.54 
 
 
198 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  54.84 
 
 
212 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3972  rare lipoprotein A  52.13 
 
 
145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134475  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  53.12 
 
 
297 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  54.17 
 
 
265 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  53.26 
 
 
144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  51.55 
 
 
321 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  56.84 
 
 
323 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  52.08 
 
 
246 aa  108  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  52.58 
 
 
333 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  52.08 
 
 
265 aa  108  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  53.12 
 
 
322 aa  108  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0738  rare lipoprotein A  53.61 
 
 
163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  54.08 
 
 
278 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  52.08 
 
 
282 aa  108  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  52.04 
 
 
342 aa  107  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  52.04 
 
 
342 aa  107  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  49.12 
 
 
371 aa  107  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  54.17 
 
 
238 aa  107  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  50.96 
 
 
202 aa  107  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  52.04 
 
 
341 aa  107  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  59.18 
 
 
391 aa  107  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>