More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0563 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 
386 aa  769    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  46.74 
 
 
309 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  47.43 
 
 
449 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  39.22 
 
 
381 aa  145  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  43.97 
 
 
521 aa  143  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  45.02 
 
 
234 aa  138  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  43.08 
 
 
264 aa  133  5e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  34.08 
 
 
576 aa  132  6.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  43.89 
 
 
291 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  43.89 
 
 
291 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  39.54 
 
 
340 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  42.92 
 
 
319 aa  130  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  46.83 
 
 
567 aa  130  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  34.42 
 
 
493 aa  130  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  42.73 
 
 
268 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  40.22 
 
 
489 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  47.15 
 
 
214 aa  128  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  40.23 
 
 
517 aa  127  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  39.86 
 
 
333 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  40.25 
 
 
294 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  45.79 
 
 
225 aa  124  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  44.81 
 
 
320 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  38.99 
 
 
1191 aa  123  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  42.05 
 
 
343 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  42.05 
 
 
343 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  39.37 
 
 
311 aa  121  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  41.86 
 
 
336 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  41.86 
 
 
336 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  46.88 
 
 
745 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  39.53 
 
 
351 aa  120  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  45.6 
 
 
213 aa  119  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  42.34 
 
 
286 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  40 
 
 
332 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  50.32 
 
 
1033 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  33.44 
 
 
862 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  40.43 
 
 
440 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  44.16 
 
 
267 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  41.12 
 
 
227 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  40.49 
 
 
448 aa  114  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 
493 aa  114  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  41.15 
 
 
441 aa  113  7.000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  39.41 
 
 
262 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  39.41 
 
 
262 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  37.55 
 
 
266 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  38.22 
 
 
295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  37.3 
 
 
278 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  35.46 
 
 
389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  41.03 
 
 
312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  39.47 
 
 
734 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  45.03 
 
 
366 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  49.68 
 
 
245 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  43.1 
 
 
366 aa  110  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  35.37 
 
 
727 aa  109  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  39.8 
 
 
219 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  48.13 
 
 
416 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  45.13 
 
 
433 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  49.32 
 
 
277 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.92 
 
 
525 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2891  effector protein pipB2  44.37 
 
 
350 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  38.71 
 
 
456 aa  107  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  44.44 
 
 
366 aa  106  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  44.44 
 
 
204 aa  106  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  39.45 
 
 
483 aa  105  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  44.44 
 
 
366 aa  106  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000403936 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  34.88 
 
 
408 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  34.4 
 
 
401 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1585  pentapeptide repeat-containing protein  43 
 
 
237 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000106738  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  44.92 
 
 
216 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  36.36 
 
 
776 aa  104  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  37.33 
 
 
710 aa  103  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  35.29 
 
 
452 aa  103  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  34.11 
 
 
401 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  36.48 
 
 
273 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  41.21 
 
 
213 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  42.13 
 
 
241 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  34.85 
 
 
300 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0870  pentapeptide repeat-containing protein  26.43 
 
 
635 aa  101  2e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 
182 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  41.67 
 
 
203 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  40.11 
 
 
903 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  38.87 
 
 
285 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  38.99 
 
 
384 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  44.17 
 
 
184 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  43.27 
 
 
263 aa  101  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  44.97 
 
 
225 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  38.55 
 
 
706 aa  100  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  43.15 
 
 
182 aa  100  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  38.5 
 
 
250 aa  100  6e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  35.63 
 
 
515 aa  99.8  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  36.27 
 
 
485 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  43.09 
 
 
199 aa  99.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  34.82 
 
 
419 aa  99.4  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  41.81 
 
 
184 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  39.29 
 
 
309 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2330  pentapeptide repeat protein  39.25 
 
 
231 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229245 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  45.03 
 
 
176 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  45.03 
 
 
176 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  47.06 
 
 
180 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  35.42 
 
 
259 aa  97.8  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  40.59 
 
 
446 aa  97.8  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>