137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0485 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0485  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  346  1e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.482808  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3639  hypothetical protein  57.82 
 
 
174 aa  166  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1974  hypothetical protein  58.55 
 
 
176 aa  156  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5246  hypothetical protein  48.21 
 
 
184 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.197347 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7394  hypothetical protein  46.26 
 
 
156 aa  141  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0620055  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4141  hypothetical protein  46.26 
 
 
156 aa  141  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0176  hypothetical protein  46.75 
 
 
172 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  47.1 
 
 
172 aa  124  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3106  hypothetical protein  48.84 
 
 
172 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4323  hypothetical protein  50 
 
 
163 aa  120  9e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313057  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21090  hypothetical protein  46.76 
 
 
151 aa  117  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.577572  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2306  hypothetical protein  48.44 
 
 
172 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385132  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3609  hypothetical protein  44.38 
 
 
176 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1317  hypothetical protein  43.88 
 
 
162 aa  110  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1800  hypothetical protein  46.76 
 
 
151 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6155  hypothetical protein  40.28 
 
 
148 aa  98.6  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  39.84 
 
 
148 aa  94.7  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0539  protein of unknown function DUF606  35.04 
 
 
147 aa  90.1  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.907326  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0736  hypothetical protein  40.43 
 
 
149 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300113  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2916  hypothetical protein  31.97 
 
 
151 aa  88.6  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  36.55 
 
 
146 aa  88.2  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6145  hypothetical protein  35 
 
 
148 aa  88.2  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2381  protein of unknown function DUF606  39.72 
 
 
146 aa  87.4  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0418  protein of unknown function DUF606  31.85 
 
 
146 aa  84.7  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.47239 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3239  hypothetical protein  37.23 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1669  protein of unknown function DUF606  37.4 
 
 
178 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304547  normal  0.52087 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3563  protein of unknown function DUF606  37.23 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.452592  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0326  hypothetical protein  35.88 
 
 
132 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.845681  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0378  protein of unknown function DUF606  31.62 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1919  hypothetical protein  30.77 
 
 
307 aa  80.1  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  38.64 
 
 
146 aa  80.1  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1394  hypothetical protein  36.51 
 
 
170 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  hitchhiker  0.00247418 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1161  hypothetical protein  32.86 
 
 
164 aa  79  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.275769  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3721  hypothetical protein  32.52 
 
 
148 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.230408  normal  0.105166 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0012  protein of unknown function DUF606  33.09 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0252  hypothetical protein  34.48 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2226  protein of unknown function DUF606  38.57 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1865  protein of unknown function DUF606  33.33 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.522195 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3609  hypothetical protein  34.06 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2106  protein of unknown function DUF606  36.59 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0923123 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0320  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5052  protein of unknown function DUF606  31.82 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.691333 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4539  hypothetical protein  32.58 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.194485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4999  protein of unknown function DUF606  32.58 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  28.31 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5534  hypothetical protein  34.56 
 
 
149 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1923  protein of unknown function DUF606  31.45 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000281356  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63650  hypothetical protein  34.56 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0150824  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3901  protein of unknown function DUF606  33.33 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.936435  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1137  hypothetical protein  34.01 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206431  normal  0.232987 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4040  protein of unknown function DUF606  32.03 
 
 
148 aa  68.6  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000995458 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4583  protein of unknown function DUF606  31.03 
 
 
148 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal  0.0675209 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  29.91 
 
 
317 aa  67  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4213  hypothetical protein  31.03 
 
 
148 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187648  normal  0.19224 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0262  protein of unknown function DUF606  29.33 
 
 
147 aa  67  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3996  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  29.46 
 
 
163 aa  66.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.318499  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0608  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4730  protein of unknown function DUF606  29.93 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  0.0111323 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0814  protein of unknown function DUF606  26.81 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3699  hypothetical protein  36.89 
 
 
146 aa  63.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0326  hypothetical protein  33.09 
 
 
144 aa  63.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.649286  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0202  protein of unknown function DUF606  33.09 
 
 
142 aa  62.8  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5229  hypothetical protein  31.16 
 
 
147 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274596  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3312  hypothetical protein  31.16 
 
 
167 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5055  hypothetical protein  31.16 
 
 
147 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0200  hypothetical protein  26.72 
 
 
153 aa  61.2  0.000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4288  protein of unknown function DUF606  30.53 
 
 
147 aa  60.8  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251888  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4917  hypothetical protein  31.29 
 
 
147 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0102673 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0276  hypothetical protein  25.17 
 
 
297 aa  59.7  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196948  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3965  hypothetical protein  33.33 
 
 
313 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4333  protein of unknown function DUF606  33.33 
 
 
313 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.289222 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1162  hypothetical protein  30 
 
 
151 aa  58.5  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4444  protein of unknown function DUF606  36.19 
 
 
320 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.148381 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2577  protein of unknown function DUF606  28.39 
 
 
183 aa  57.8  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1092  hypothetical protein  26.22 
 
 
163 aa  57.8  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0792  hypothetical protein  27.94 
 
 
305 aa  57.4  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.846156  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4918  hypothetical protein  28.47 
 
 
177 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0108975 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4220  hypothetical protein  32.23 
 
 
315 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.285237 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2509  protein of unknown function DUF606  31.25 
 
 
144 aa  55.5  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1547  protein of unknown function DUF606  30.15 
 
 
149 aa  54.7  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2829  hypothetical protein  33.09 
 
 
149 aa  54.3  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  29.17 
 
 
145 aa  53.9  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2811  hypothetical protein  30.6 
 
 
149 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.989638  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0641  hypothetical protein  22.67 
 
 
309 aa  53.9  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0656  hypothetical protein  22.67 
 
 
309 aa  53.9  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.473315  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2954  hypothetical protein  30.6 
 
 
149 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4070  hypothetical protein  30.53 
 
 
145 aa  53.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215234  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2345  hypothetical protein  25.56 
 
 
152 aa  52.8  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785933  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3765  hypothetical protein  30.22 
 
 
151 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0823  hypothetical protein  32.26 
 
 
142 aa  50.1  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1140  hypothetical protein  25.93 
 
 
147 aa  50.1  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1093  hypothetical protein  30.26 
 
 
144 aa  49.3  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.962371  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5702  hypothetical protein  29.63 
 
 
161 aa  48.9  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2578  protein of unknown function DUF606  33.87 
 
 
144 aa  48.5  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1296  hypothetical protein  29.17 
 
 
147 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.443184  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3818  hypothetical protein  25.95 
 
 
323 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3861  hypothetical protein  25.95 
 
 
322 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3740  hypothetical protein  25.95 
 
 
323 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3751  putative inner membrane protein  25.95 
 
 
323 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3920  putative inner membrane protein  25.95 
 
 
323 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.324261  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>