More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0463 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0463  periplasmic binding protein  100 
 
 
308 aa  629  1e-179  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1523  periplasmic binding protein  51.51 
 
 
313 aa  299  4e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2940  periplasmic binding protein  52.03 
 
 
316 aa  296  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1043  periplasmic binding protein  45.21 
 
 
340 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2670  periplasmic binding protein  49.43 
 
 
272 aa  268  5.9999999999999995e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2590  periplasmic binding protein  48.47 
 
 
301 aa  255  8e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37556  normal  0.0169021 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  40.68 
 
 
330 aa  228  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000014163  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  40.68 
 
 
330 aa  228  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100605  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  37.93 
 
 
324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  38.85 
 
 
324 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  34.37 
 
 
322 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  35.4 
 
 
321 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  34.37 
 
 
322 aa  186  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  35.4 
 
 
321 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0133  periplasmic binding protein  36.59 
 
 
306 aa  186  5e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  36.56 
 
 
322 aa  183  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2237  putative iron compound-binding protein  37.06 
 
 
305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  35.03 
 
 
320 aa  179  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  36.33 
 
 
321 aa  179  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268482  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  36.33 
 
 
321 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  36.33 
 
 
321 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  36.2 
 
 
321 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  35.84 
 
 
321 aa  178  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  36.27 
 
 
316 aa  178  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  34.29 
 
 
320 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000270129  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  34.29 
 
 
320 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1737099999999999e-45 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  34.29 
 
 
320 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000324878  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  34.29 
 
 
320 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  37.19 
 
 
662 aa  177  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2283  substrate-binding family protein, putative  36.46 
 
 
321 aa  176  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2036  iron(III) dicitrate-binding protein  34.29 
 
 
320 aa  176  6e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010516  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2078  periplasmic binding protein  33.44 
 
 
320 aa  175  9e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0923581  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  36.01 
 
 
320 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2122  periplasmic binding protein  34.98 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10692  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  37.32 
 
 
319 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  36.58 
 
 
300 aa  166  5.9999999999999996e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1784  hypothetical protein  34.74 
 
 
309 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.933909 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3525  periplasmic binding protein  35 
 
 
310 aa  143  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7985  substrate-binding family protein, putative  33.68 
 
 
336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5759  periplasmic binding protein  31.94 
 
 
331 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4780  periplasmic binding protein  35.36 
 
 
305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2440  periplasmic binding protein  29.67 
 
 
348 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000012115 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1777  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.95 
 
 
331 aa  126  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4123  periplasmic binding protein  31.41 
 
 
346 aa  124  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2409  periplasmic binding protein  33.22 
 
 
333 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0140485  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0667  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  30.98 
 
 
306 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3654  periplasmic binding protein  32.86 
 
 
329 aa  117  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.841476  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0763  iron(III) dicitrate transport system, periplasmic iron-binding protein FecB  30.51 
 
 
306 aa  116  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30510  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  32.18 
 
 
326 aa  115  7.999999999999999e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163783  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2208  periplasmic binding protein  28.12 
 
 
327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.970371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2246  periplasmic binding protein  28.12 
 
 
327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.13483  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1282  periplasmic binding protein  30.26 
 
 
357 aa  113  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1119  periplasmic binding protein  27.55 
 
 
319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000565066  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0974  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  30.19 
 
 
304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37813  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1097  periplasmic binding protein  27.55 
 
 
319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000153945  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0693  periplasmic binding protein  27.93 
 
 
306 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3865  periplasmic binding protein  28.57 
 
 
329 aa  110  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2421  periplasmic binding protein  29.25 
 
 
309 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06007  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  28.09 
 
 
298 aa  109  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001069  iron(III) dicitrate transport system iron-binding protein fecB  30.11 
 
 
307 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4867  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  28.29 
 
 
302 aa  105  8e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04156  iron-dicitrate transporter subunit  28.52 
 
 
300 aa  105  9e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04119  hypothetical protein  28.52 
 
 
300 aa  105  9e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0742  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  28.52 
 
 
300 aa  104  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3710  periplasmic binding protein  28.52 
 
 
300 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.508283  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2829  twin-arginine translocation pathway signal  29.96 
 
 
300 aa  97.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.582079  normal  0.501847 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0550  periplasmic binding protein  28.08 
 
 
313 aa  97.4  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3139  periplasmic binding protein  27.06 
 
 
315 aa  96.7  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000355327  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1806  periplasmic binding protein  29.58 
 
 
358 aa  95.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.455628  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0599  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.24 
 
 
324 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.717603  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3901  periplasmic binding protein  27.65 
 
 
313 aa  95.1  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4424  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  29.24 
 
 
324 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000518711  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4641  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.24 
 
 
324 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4264  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.24 
 
 
324 aa  94.7  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4636  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.24 
 
 
324 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.471711  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4766  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  29.24 
 
 
324 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00286539  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2754  periplasmic binding protein  28.82 
 
 
312 aa  94.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4356  periplasmic binding protein  29.24 
 
 
324 aa  94.7  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200584  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5503  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.87 
 
 
312 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0640  periplasmic binding protein  30.07 
 
 
337 aa  94  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.451068  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5448  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.87 
 
 
312 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5509  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.53 
 
 
314 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2064  periplasmic binding protein  27.27 
 
 
313 aa  92.4  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4269  periplasmic binding protein  26.2 
 
 
314 aa  91.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2757  periplasmic binding protein  26.58 
 
 
309 aa  91.7  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5229  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  26.83 
 
 
314 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5060  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.83 
 
 
314 aa  90.9  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.320975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5077  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.83 
 
 
314 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5173  periplasmic binding protein  27.18 
 
 
312 aa  91.3  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5628  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  26.83 
 
 
314 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4541  putative iron compound-binding protein  26.27 
 
 
314 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00289345  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5558  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.83 
 
 
311 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0694  putative iron compound-binding protein  26.27 
 
 
314 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00869259  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5472  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.48 
 
 
314 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1739  periplasmic binding protein  29.35 
 
 
352 aa  89.7  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4317  substrate-binding family protein  25.48 
 
 
314 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000712566  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4166  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.48 
 
 
314 aa  89  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000245758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4652  substrate-binding family protein  25.48 
 
 
314 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152488  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4501  putative iron compound-binding protein  25.48 
 
 
314 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170385 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1898  periplasmic binding protein  27.09 
 
 
353 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>