83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0201 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0201  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 266 aa  545  1e-154  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2474  solute-binding family 1 protein  33.33 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.734477  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2177  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 		 258 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0443241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2034  extracellular solute-binding protein  30.62 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530629  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3729  periplasmic amino acid-binding protein-related protein  30.62 
 
 		 260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65870  hypothetical protein  30.56 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5716  hypothetical protein  30.56 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3624  hypothetical protein  27.23 
 
 		 262 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.78712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0330  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.9 
 
 		 266 aa  87  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2337  extracellular solute-binding protein  28.46 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.329158  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2109  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.467134 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2837  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 271 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117714  normal  0.871916 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2292  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2704  extracellular solute-binding protein  27.08 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.0872615 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0421  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1240  extracellular solute-binding protein  26 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0802  hypothetical protein  29.24 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2252  hypothetical protein  25.26 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5282  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26540  hypothetical protein  25.6 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.171066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0051  extracellular solute-binding protein family 3  23.87 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0486  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1200  hypothetical protein  26.67 
 
 		 274 aa  55.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.285337  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4979  periplasmic binding protein, putative  30.71 
 
 		 262 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1101  extracellular solute-binding protein family 3  27.81 
 
 		 295 aa  52.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0196876 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4852  extracellular solute-binding protein  29.29 
 
 		 262 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157097  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3508  amino acid ABC transporter  24.07 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3228  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.65 
 
 		 609 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1037  histidine kinase  24.07 
 
 		 608 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1329  extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 		 253 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  22.03 
 
 		 648 aa  49.7  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1010  signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 		 626 aa  49.3  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0459  amino acid ABC transporter periplasmic protein  24.39 
 
 		 255 aa  49.3  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07500  hypothetical protein  28.09 
 
 		 1245 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.411522  normal  0.391796 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2131  extracellular solute-binding protein  22.91 
 
 		 265 aa  48.9  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1958  putative PAS/PAC sensor protein  26.25 
 
 		 598 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1759  histidine kinase  27.17 
 
 		 596 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37697  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2081  histidine kinase  26.59 
 
 		 597 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1889  diguanylate cyclase  25.29 
 
 		 714 aa  47.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.838759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1997  hypothetical protein  23.71 
 
 		 275 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321301  normal  0.0820439 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2175  histidine kinase  26.01 
 
 		 599 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0420  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  26.6 
 
 		 1247 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.285216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0726  histidine kinase  22.88 
 
 		 570 aa  47.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.408803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5028  extracellular solute-binding protein  29.85 
 
 		 262 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0386  sensory box protein  24.12 
 
 		 1247 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.298787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1461  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 		 251 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.617285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4816  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.54 
 
 		 1247 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.201907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1477  extracellular solute-binding protein family 3  24.86 
 
 		 254 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1150  extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2187  hypothetical protein  23.2 
 
 		 275 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1907  histidine kinase  33.33 
 
 		 560 aa  44.3  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.649995 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2755  periplasmic substrate-binding protein/sensor histidine kinase  25.38 
 
 		 590 aa  44.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4130  histidine kinase  25 
 
 		 572 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.964997 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0706  Prephenate dehydratase  29.36 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2634  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  24.64 
 
 		 768 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5150  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25 
 
 		 1248 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  25.79 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0325  extracellular solute-binding protein  31.88 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1653  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0537  hypothetical protein  22.79 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4029  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  24.76 
 
 		 1244 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2115  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.55 
 
 		 604 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00123104  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.92 
 
 		 620 aa  43.9  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.838333  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.46 
 
 		 1165 aa  43.9  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0295  ABC basic amino acid transporter, periplasmic binding protein  31.88 
 
 		 266 aa  43.5  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.874401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3019  extracellular solute-binding protein family 3  25.25 
 
 		 253 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.683657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1594  arginine-binding protein  23.17 
 
 		 269 aa  43.1  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1844  extracellular solute-binding protein  23.55 
 
 		 932 aa  42.7  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1728  histidine kinase  25.93 
 
 		 560 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4115  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 		 267 aa  43.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147352 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3585  extracellular solute-binding protein  22.64 
 
 		 266 aa  43.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2962  extracellular solute-binding protein  23.6 
 
 		 290 aa  42.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.53 
 
 		 729 aa  42.7  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.15545  normal  0.515162 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1260  amino acid ABC transporter  22.22 
 
 		 273 aa  42.7  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00601  probable ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.15 
 
 		 265 aa  42.7  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 		 266 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 		 266 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3526  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.33 
 
 		 584 aa  42.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1503  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  32.1 
 
 		 258 aa  42.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0591  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein  23.17 
 
 		 269 aa  42.4  0.008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0748117  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1508  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 257 aa  42.4  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.118262  normal  0.888378 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3772  hypothetical protein  27.92 
 
 		 273 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1365  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 		 322 aa  42.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.975535 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>