More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0176 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  70.87 
 
 
722 aa  1083    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  77.23 
 
 
738 aa  1181    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 
716 aa  1457    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  59.4 
 
 
746 aa  795    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  71.79 
 
 
716 aa  1090    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  54.38 
 
 
704 aa  777    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  67.73 
 
 
722 aa  1010    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  56.38 
 
 
712 aa  760    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  71.71 
 
 
722 aa  1087    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  70.11 
 
 
717 aa  1062    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  68.29 
 
 
717 aa  985    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  59.47 
 
 
713 aa  892    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  71.93 
 
 
717 aa  1084    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  65.68 
 
 
720 aa  930    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  57.2 
 
 
713 aa  783    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  51.79 
 
 
705 aa  632  1e-180  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  34.5 
 
 
714 aa  402  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  34.21 
 
 
714 aa  397  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.86 
 
 
475 aa  364  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.86 
 
 
475 aa  365  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1976  mercuric reductase  41.86 
 
 
515 aa  365  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121394  normal  0.267836 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.2 
 
 
473 aa  363  4e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3749  mercuric reductase  40.57 
 
 
510 aa  357  5e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1118  mercuric reductase  41.03 
 
 
516 aa  352  2e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.583122  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1315  mercuric reductase  41.14 
 
 
505 aa  345  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0473  mercuric reductase  40.37 
 
 
507 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000001036 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4940  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  42.61 
 
 
472 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1982  mercuric reductase  39.55 
 
 
507 aa  340  7e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1598  mercuric reductase  40.16 
 
 
510 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0457  mercuric reductase  39.42 
 
 
507 aa  336  7e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0315  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.87 
 
 
471 aa  323  5e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0341  mercuric reductase  40.37 
 
 
513 aa  323  8e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.262154  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0309  mercuric reductase  40.87 
 
 
525 aa  322  9.999999999999999e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1481  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.96 
 
 
494 aa  321  3e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1463  mercuric reductase, putative  40.47 
 
 
486 aa  320  5e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0144411  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3049  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.41 
 
 
472 aa  318  2e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0397378  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2431  mercuric reductase  37.58 
 
 
509 aa  316  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2535  mercuric reductase  37.4 
 
 
508 aa  316  9.999999999999999e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.22 
 
 
482 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1239  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.09 
 
 
495 aa  315  1.9999999999999998e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.375161 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0304  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.09 
 
 
474 aa  311  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1498  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40 
 
 
488 aa  307  4.0000000000000004e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000511741  hitchhiker  0.0000458564 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1429  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  38.85 
 
 
515 aa  306  9.000000000000001e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.905339  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4228  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.39 
 
 
482 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.86 
 
 
482 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0751  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.41 
 
 
473 aa  304  3.0000000000000004e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0352  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.33 
 
 
475 aa  303  6.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6515  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  39.42 
 
 
520 aa  294  4e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1956  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.54 
 
 
480 aa  293  5e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0335  putative mercuric reductase MerA  40.39 
 
 
470 aa  293  6e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0257756  normal  0.865003 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0898  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.21 
 
 
508 aa  288  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00115945 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0645  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  40 
 
 
472 aa  285  2.0000000000000002e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  37.04 
 
 
546 aa  285  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3132  mercuric reductase  36.21 
 
 
504 aa  282  1e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16069  predicted protein  37.45 
 
 
532 aa  282  2e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258027  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2088  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.43 
 
 
484 aa  278  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  36.54 
 
 
546 aa  276  1.0000000000000001e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  36.32 
 
 
546 aa  273  1e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0072  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.55 
 
 
470 aa  267  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2552  SNARE associated Golgi protein  60.99 
 
 
231 aa  266  8e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2549  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.48 
 
 
472 aa  262  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0494976  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1057  putative mercuric reductase protein  36.27 
 
 
470 aa  261  4e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.180423  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.02 
 
 
484 aa  257  5e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.02 
 
 
484 aa  257  6e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2718  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.84 
 
 
470 aa  256  7e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.403702  normal  0.0190809 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6297  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.84 
 
 
466 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  32.74 
 
 
460 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.58 
 
 
484 aa  253  7e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1998  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.02 
 
 
481 aa  251  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.73 
 
 
473 aa  250  8e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0298  hypothetical protein  33.94 
 
 
464 aa  249  1e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.4 
 
 
562 aa  248  3e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  35.23 
 
 
546 aa  247  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.53 
 
 
465 aa  246  9.999999999999999e-64  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0314  hypothetical protein  33.49 
 
 
464 aa  246  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.89 
 
 
458 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  34.22 
 
 
767 aa  245  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02949  putative mercuric reductase  32.34 
 
 
503 aa  244  3.9999999999999997e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187984  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3385  putative mercuric reductase protein  35.85 
 
 
477 aa  243  7e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.329574  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1813  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.04 
 
 
477 aa  242  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0853723  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  32.66 
 
 
548 aa  241  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.84 
 
 
468 aa  241  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.11 
 
 
473 aa  241  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.98 
 
 
473 aa  240  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.58 
 
 
463 aa  240  6.999999999999999e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  32.17 
 
 
550 aa  239  9e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.69 
 
 
472 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0242  putative mercuric reductase  33.4 
 
 
467 aa  238  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  34.71 
 
 
475 aa  238  4e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.42 
 
 
468 aa  237  5.0000000000000005e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2766  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.32 
 
 
473 aa  237  6e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.91 
 
 
465 aa  236  8e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1081  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.03 
 
 
481 aa  236  9e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378558  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1388  mercuric reductase  34.82 
 
 
557 aa  236  9e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000433137  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  33.33 
 
 
464 aa  236  9e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_002936  DET0732  mercuric reductase, putative  32.39 
 
 
489 aa  236  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000844078  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1270  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.68 
 
 
460 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.751643  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_638  mercuric reductase-like protein  32.75 
 
 
499 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000028153  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3205  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.83 
 
 
473 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169727  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  34.99 
 
 
745 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>