41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0078 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0078  KAP P-loop domain-containing protein  100 
 
 
509 aa  1048    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0601067  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3419  KAP P-loop  35.54 
 
 
394 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4058  KAP P-loop domain-containing protein  33.71 
 
 
506 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3760  KAP P-loop domain-containing protein  33.06 
 
 
542 aa  169  9e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0432517 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2638  KAP P-loop domain-containing protein  31.76 
 
 
459 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0998856 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0333  KAP P-loop domain-containing protein  36.3 
 
 
571 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3681  KAP P-loop domain-containing protein  30.87 
 
 
488 aa  163  9e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3526  KAP P-loop  36.46 
 
 
580 aa  160  6e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3525  KAP P-loop domain-containing protein  29.92 
 
 
489 aa  157  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0414  KAP P-loop domain-containing protein  32.28 
 
 
565 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1063  KAP P-loop domain-containing protein  31.33 
 
 
467 aa  153  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3806  KAP P-loop domain protein  33.78 
 
 
579 aa  153  8e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0472  hypothetical protein  33.22 
 
 
510 aa  148  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3357  KAP P-loop domain-containing protein  37.08 
 
 
463 aa  147  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2930  KAP P-loop domain-containing protein  37.08 
 
 
463 aa  147  6e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.275131 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0128  KAP P-loop domain protein  31.52 
 
 
471 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0689933  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3481  KAP P-loop domain-containing protein  30.03 
 
 
464 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0295082 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0158  KAP P-loop domain-containing protein  27.76 
 
 
445 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3737  KAP P-loop  29.48 
 
 
444 aa  108  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.607075  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2476  KAP P-loop domain-containing protein  28.94 
 
 
443 aa  105  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195004  hitchhiker  0.00802204 
 
 
-
 
NC_002978  WD1179  hypothetical protein  26.22 
 
 
406 aa  100  6e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28360  KAP family P-loop domain protein  24.7 
 
 
564 aa  66.6  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.143031 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1445  KAP P-loop domain protein  23.85 
 
 
461 aa  60.1  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5213  KAP P-loop domain-containing protein  22.71 
 
 
628 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.125841 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3155  KAP P-loop  22.71 
 
 
628 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5061  KAP P-loop domain-containing protein  22.71 
 
 
628 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4250  KAP P-loop domain-containing protein  22.76 
 
 
594 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000235835 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2314  KAP P-loop domain-containing protein  25.6 
 
 
601 aa  57  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.318081  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0675  KAP P-loop domain-containing protein  21.67 
 
 
513 aa  52.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6139  KAP P-loop domain-containing protein  22.61 
 
 
591 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2211  KAP P-loop  21.89 
 
 
650 aa  50.4  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4676  hypothetical protein  21.09 
 
 
736 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0936  KAP P-loop domain protein  28.57 
 
 
647 aa  47.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1472  KAP P-loop  27.78 
 
 
644 aa  47.8  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.628222  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0709  hypothetical protein  33.96 
 
 
1064 aa  47.8  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2881  KAP P-loop domain-containing protein  25.24 
 
 
671 aa  47  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.660206  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3618  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.42 
 
 
830 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387409  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0416  hypothetical protein  27.14 
 
 
559 aa  46.2  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0661  ATPase  26.39 
 
 
615 aa  45.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204839  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2922  P-loop ATPase-like protein  23.08 
 
 
715 aa  45.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.182539 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4815  KAP P-loop domain-containing protein  25.97 
 
 
623 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678803  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>