153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0063 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0063  hypothetical protein  100 
 
 
386 aa  807    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.405281  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3017  hypothetical protein  46.6 
 
 
384 aa  350  2e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2871  hypothetical protein  47.64 
 
 
388 aa  347  2e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0679  hypothetical protein  42.19 
 
 
374 aa  335  5.999999999999999e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.323848  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19080  hypothetical protein  46.65 
 
 
374 aa  334  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22410  hypothetical protein  44.01 
 
 
374 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000252116 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3841  hypothetical protein  43.04 
 
 
416 aa  322  7e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.614644  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1865  hypothetical protein  42.6 
 
 
406 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.164344  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1896  hypothetical protein  45.53 
 
 
374 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3828  hypothetical protein  43.49 
 
 
375 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210412  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4092  hypothetical protein  43.08 
 
 
375 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2329  hypothetical protein  42.67 
 
 
392 aa  311  1e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.653635  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1249  hypothetical protein  42.19 
 
 
374 aa  311  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.25813 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3837  hypothetical protein  44.47 
 
 
375 aa  309  4e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29195  normal  0.855927 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4050  hypothetical protein  44.29 
 
 
375 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1930  hypothetical protein  41.94 
 
 
405 aa  309  5e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0856188 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2157  hypothetical protein  39.72 
 
 
455 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.391826  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4543  hypothetical protein  42.11 
 
 
403 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1656  hypothetical protein  37.59 
 
 
433 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.135069  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1347  hypothetical protein  42.86 
 
 
394 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.452511  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0943  hypothetical protein  45.93 
 
 
380 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.118065  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3011  hypothetical protein  42.75 
 
 
392 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350718  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1586  hypothetical protein  42.75 
 
 
392 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215515  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2273  hypothetical protein  42.75 
 
 
392 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1083  hypothetical protein  42.75 
 
 
441 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1088  hypothetical protein  42.75 
 
 
441 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.267189  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0740  hypothetical protein  42.75 
 
 
441 aa  301  9e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.391728  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1241  hypothetical protein  42.75 
 
 
464 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1425  hypothetical protein  42.19 
 
 
374 aa  296  6e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.345024 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2296  hypothetical protein  41.06 
 
 
421 aa  295  7e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.124232  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2368  hypothetical protein  42.71 
 
 
398 aa  295  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0181768  normal  0.305905 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3397  hypothetical protein  40.16 
 
 
389 aa  290  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.6252  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0316  hypothetical protein  39.33 
 
 
445 aa  290  2e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2486  hypothetical protein  40.82 
 
 
421 aa  291  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.954327  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0881  hypothetical protein  42.7 
 
 
410 aa  290  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.642732  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1294  hypothetical protein  40.98 
 
 
393 aa  290  3e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.724983  normal  0.811045 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1116  protein of unknown function DUF482  40.16 
 
 
389 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.492606  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0288  hypothetical protein  39.38 
 
 
450 aa  289  5.0000000000000004e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2085  hypothetical protein  38.43 
 
 
446 aa  289  7e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.817202  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2007  protein of unknown function DUF482  38.3 
 
 
392 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199374  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1728  protein of unknown function DUF482  39.22 
 
 
470 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0347307  normal  0.0114903 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2458  hypothetical protein  41.53 
 
 
374 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0877  hypothetical protein  40.57 
 
 
392 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2323  hypothetical protein  40.1 
 
 
392 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.471895  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5740  hypothetical protein  40.05 
 
 
392 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1668  hypothetical protein  39.67 
 
 
427 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2657  hypothetical protein  39.01 
 
 
470 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00609498  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1444  protein of unknown function DUF482  39.02 
 
 
411 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0135  protein of unknown function DUF482  41.78 
 
 
406 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1793  hypothetical protein  42.9 
 
 
382 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426104  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2417  hypothetical protein  39.85 
 
 
392 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.673667  normal  0.0190965 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2170  hypothetical protein  38.78 
 
 
390 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164145  hitchhiker  0.00000155889 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1801  hypothetical protein  39.59 
 
 
392 aa  282  9e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2413  hypothetical protein  39.59 
 
 
392 aa  282  9e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02848  hypothetical protein  37.8 
 
 
445 aa  281  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.29586  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2025  hypothetical protein  39.11 
 
 
405 aa  281  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0657  hypothetical protein  40.1 
 
 
373 aa  280  4e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2348  hypothetical protein  37.78 
 
 
408 aa  279  7e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.291454  normal  0.220022 
 
 
-
 
NC_004310  BR1167  hypothetical protein  39.95 
 
 
395 aa  278  1e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0877771  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1953  hypothetical protein  40 
 
 
432 aa  277  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2475  hypothetical protein  41.94 
 
 
395 aa  278  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.407377  normal  0.0590595 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2322  hypothetical protein  40.36 
 
 
427 aa  277  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.483949 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2732  hypothetical protein  38.44 
 
 
470 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.96402  normal  0.438738 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2359  protein of unknown function DUF482  39.44 
 
 
393 aa  277  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.597494  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1124  hypothetical protein  39.69 
 
 
395 aa  276  4e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.326303  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4593  hypothetical protein  41.48 
 
 
405 aa  276  5e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0822  hypothetical protein  40.21 
 
 
390 aa  276  5e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.295229  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2619  hypothetical protein  38.79 
 
 
470 aa  276  6e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1377  hypothetical protein  39.32 
 
 
397 aa  275  8e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2969  hypothetical protein  44.35 
 
 
381 aa  275  9e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2533  hypothetical protein  39.43 
 
 
402 aa  275  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.941945  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1760  hypothetical protein  40.05 
 
 
406 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0437  hypothetical protein  40.73 
 
 
387 aa  273  3e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1962  protein of unknown function DUF482  39.8 
 
 
456 aa  272  9e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.846465  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0804  hypothetical protein  40.96 
 
 
402 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1121  hypothetical protein  39.22 
 
 
395 aa  270  4e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.702528  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2114  hypothetical protein  40 
 
 
391 aa  269  5e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0393548 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2734  hypothetical protein  39.84 
 
 
385 aa  269  5.9999999999999995e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1575  protein of unknown function DUF482  38.54 
 
 
396 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.645858  normal  0.365702 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3791  hypothetical protein  40.21 
 
 
390 aa  268  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2786  hypothetical protein  40.36 
 
 
381 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2159  protein of unknown function DUF482  39.03 
 
 
410 aa  266  4e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.296465  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2563  protein of unknown function DUF482  39.29 
 
 
410 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.871216  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3103  hypothetical protein  38.8 
 
 
376 aa  265  8e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.73421  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1772  protein of unknown function DUF482  38.28 
 
 
396 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118924  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2458  hypothetical protein  38.06 
 
 
423 aa  264  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0745  protein of unknown function DUF482  42.06 
 
 
413 aa  264  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00828305 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2802  hypothetical protein  38.85 
 
 
398 aa  264  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0294833  normal  0.670826 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2534  hypothetical protein  38.05 
 
 
384 aa  263  3e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1715  hypothetical protein  39.52 
 
 
377 aa  262  8e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1114  protein of unknown function DUF482  38.89 
 
 
392 aa  260  3e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.333144 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0679  hypothetical protein  39.95 
 
 
400 aa  259  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4685  protein of unknown function DUF482  40.11 
 
 
406 aa  259  6e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3312  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1708  hypothetical protein  38.15 
 
 
418 aa  259  6e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1425  hypothetical protein  40.22 
 
 
414 aa  258  1e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.625932  normal  0.472174 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1665  hypothetical protein  40.88 
 
 
418 aa  258  1e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.750799  normal  0.0965206 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0252  hypothetical protein  40.26 
 
 
393 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4316  hypothetical protein  39.68 
 
 
406 aa  258  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2611  hypothetical protein  38.58 
 
 
415 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4833  protein of unknown function DUF482  39.66 
 
 
406 aa  256  4e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261808  normal  0.379038 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>