More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0050 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0050  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  452  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  61.26 
 
 		 229 aa  276  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 223 aa  158  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1382  regulatory protein GntR, HTH  37.44 
 
 		 227 aa  156  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000764152  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  36.99 
 
 		 223 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 223 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 223 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 223 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 233 aa  152  5e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 223 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 223 aa  151  7e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  37.2 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 223 aa  145  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 206 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  36.82 
 
 		 226 aa  143  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  37.69 
 
 		 222 aa  138  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 223 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  37.19 
 
 		 222 aa  134  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  38.21 
 
 		 225 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2063  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00486577  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 268 aa  126  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 226 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  34.3 
 
 		 224 aa  124  9e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 226 aa  124  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5100  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 226 aa  122  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 232 aa  120  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2125  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 230 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 231 aa  115  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 214 aa  111  8.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1651  transcriptional regulator, GntR family  35.53 
 
 		 242 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 230 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 247 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  35.1 
 
 		 232 aa  109  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3814  GntR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 229 aa  108  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 239 aa  104  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1970  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0129  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 236 aa  99  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  36.59 
 
 		 238 aa  99  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  32.67 
 
 		 224 aa  96.7  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 219 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 219 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2118  transcriptional regulator  28.08 
 
 		 226 aa  96.7  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.206974 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 213 aa  96.3  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 213 aa  95.5  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  33.66 
 
 		 237 aa  93.6  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 235 aa  93.6  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 223 aa  92.8  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2466  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 213 aa  93.2  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 260 aa  92.8  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5454  transcriptional regulator, GntR family  27.88 
 
 		 245 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 234 aa  92.4  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2304  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 224 aa  92  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39728 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5008  transcriptional regulator GntR  27.4 
 
 		 245 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4095  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8462  transcriptional regulator, GntR family  40.91 
 
 		 218 aa  89.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  28.99 
 
 		 233 aa  89  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 230 aa  89  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2922  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 221 aa  89  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0278565  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2320  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 207 aa  89  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3010  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 209 aa  88.6  8e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 222 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4029  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 215 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3493  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 215 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.552869 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5066  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 232 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.219495  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6303  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1569  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 227 aa  87.4  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1008  putative glycosyltransferase  28.95 
 
 		 219 aa  86.3  3e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.120442  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2768  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 222 aa  85.9  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.319165  normal  0.0289974 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  30.14 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2775  transcriptional regulator, GntR family  32.31 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3123  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00780857  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1710  transcription regulator AsnC  31.43 
 
 		 217 aa  84.7  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  26.73 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1304  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0497792 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  28.79 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2595  GntR domain protein  34.78 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709124  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2332  transcriptional regulator, GntR family  27.1 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.738063 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1876  GntR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0163  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281276 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  25.36 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0182  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.167799 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1303  GntR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1030  GntR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.48599  normal  0.150605 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0628  GntR family transcriptional regulator  27 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1013  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.972264 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0181  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454577  normal  0.894817 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>