More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0036 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0036  GntR domain-containing protein  100 
 
 		 255 aa  528  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3872  GntR family transcriptional regulator  50.43 
 
 		 243 aa  246  3e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  49.38 
 
 		 258 aa  244  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1597  GntR family transcriptional regulator  51.05 
 
 		 252 aa  237  1e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00340794  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0138  GntR domain-containing protein  48.95 
 
 		 268 aa  233  3e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000290412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0020  GntR family transcriptional regulator  50.64 
 
 		 256 aa  232  5e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.321852  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3324  GntR domain protein  48.72 
 
 		 244 aa  230  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0986  GntR domain protein  48.72 
 
 		 244 aa  231  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4902  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0759  GntR domain protein  45.31 
 
 		 255 aa  226  4e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1506  uxu operon transcriptional regulator  48.1 
 
 		 247 aa  225  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2780  GntR domain-containing protein  48.1 
 
 		 247 aa  225  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2703  uxu operon transcriptional regulator  48.1 
 
 		 247 aa  225  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3466  GntR domain protein  46.38 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0739  GntR domain protein  44.83 
 
 		 255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0933877  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3280  GntR family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 257 aa  218  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0977  GntR domain protein  47.44 
 
 		 244 aa  215  4e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.243501  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04193  DNA-binding transcriptional repressor  45.93 
 
 		 257 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3673  regulatory protein GntR HTH  45.93 
 
 		 257 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4851  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  44.72 
 
 		 257 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3740  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  45.93 
 
 		 257 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.714727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04155  hypothetical protein  45.93 
 
 		 257 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5830  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  44.72 
 
 		 257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4789  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  44.72 
 
 		 257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4923  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  44.72 
 
 		 257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4550  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  44.72 
 
 		 257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4837  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  45 
 
 		 257 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4911  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  45 
 
 		 257 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4908  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  45 
 
 		 257 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  0.0431827 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4861  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  45 
 
 		 257 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.25238 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4761  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  45 
 
 		 257 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.553058 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02963  DNA-binding transcriptional repressor  45 
 
 		 258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3548  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  46.03 
 
 		 258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.701913 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0602  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  45 
 
 		 258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02914  hypothetical protein  45 
 
 		 258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3391  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  45 
 
 		 258 aa  188  8e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0607  regulatory protein GntR HTH  44.58 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3566  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  44.58 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4409  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  44.58 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.652539 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3281  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  44.58 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.368173  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3267  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  44.17 
 
 		 258 aa  187  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4323  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  45.19 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.469986 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3387  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  43.9 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3513  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  43.44 
 
 		 259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.494425  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0744  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  42.74 
 
 		 258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0552  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  43.21 
 
 		 264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.406636  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0527  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  42.74 
 
 		 258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0489  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  43.21 
 
 		 264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298725  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1106  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  43.21 
 
 		 264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000240199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3301  GntR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0570986 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3428  Uxu operon transcriptional regulator  40.41 
 
 		 249 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000900091 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3331  Uxu operon transcriptional regulator  40.41 
 
 		 249 aa  175  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.172597 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3323  Uxu operon transcriptional regulator  40.41 
 
 		 249 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.198283  normal  0.784875 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3247  Uxu operon transcriptional regulator  40.41 
 
 		 249 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  37.5 
 
 		 253 aa  149  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2876  GntR domain protein  39.27 
 
 		 245 aa  146  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4155  GntR domain-containing protein  37.22 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585899  normal  0.800121 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1834  GntR domain-containing protein  36.64 
 
 		 250 aa  141  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1359  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0317585 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3048  GntR-family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.168987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1888  GntR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 257 aa  135  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3977  GntR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 245 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.355862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3676  GntR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1891  GntR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 265 aa  125  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00390754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5812  GntR domain-containing protein  35.87 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4492  GntR domain-containing protein  35.87 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0787  GntR domain protein  35.47 
 
 		 237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.812552  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3963  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 269 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3660  GntR-like  37.44 
 
 		 245 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.596872  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1542  GntR domain-containing protein  33.78 
 
 		 244 aa  118  7.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.408327  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5136  transcriptional regulator GntR family  33.96 
 
 		 223 aa  118  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3567  GntR domain-containing protein  34.6 
 
 		 245 aa  117  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5153  GntR domain-containing protein  34.56 
 
 		 239 aa  116  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25689  normal  0.577182 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3689  GntR domain-containing protein  33.18 
 
 		 247 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  32.33 
 
 		 235 aa  115  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4767  GntR domain protein  35.23 
 
 		 252 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.821835  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4817  GntR domain protein  35.6 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.999229 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1270  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3102  GntR domain-containing protein  33.94 
 
 		 246 aa  112  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01468  putative regulatory protein, GntR family  33.48 
 
 		 243 aa  112  6e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  31.11 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0254  GntR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  34.36 
 
 		 238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0553  GntR domain protein  32.46 
 
 		 253 aa  105  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  32.08 
 
 		 239 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3287  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 256 aa  102  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0416745  normal  0.920841 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  34.04 
 
 		 258 aa  102  9e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  31.65 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0743  GntR domain-containing protein  34.35 
 
 		 286 aa  99.8  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 247 aa  99  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  29.22 
 
 		 231 aa  98.6  8e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  31.53 
 
 		 253 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 247 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  31.36 
 
 		 250 aa  97.1  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  31.48 
 
 		 247 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  31.91 
 
 		 239 aa  96.7  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  31.46 
 
 		 239 aa  96.3  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6346  GntR domain-containing protein  32.08 
 
 		 233 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385639  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  31.34 
 
 		 240 aa  96.3  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  31.98 
 
 		 251 aa  96.3  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>