More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0035 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0035  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
312 aa  644    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0374  LysR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
317 aa  225  7e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0608  LysR family transcriptional regulator  41.04 
 
 
309 aa  223  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3696  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 
305 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4285  LysR family transcriptional regulator  38.82 
 
 
312 aa  222  6e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1659  LysR family transcriptional regulator  39.67 
 
 
316 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262273  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4202  LysR family transcriptional regulator  38.61 
 
 
324 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0903744 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3728  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
348 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4295  LysR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
345 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1887  transcriptional regulator of LysR family protein  38.95 
 
 
308 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0293144  normal  0.0439695 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1579  transcriptional regulator, LysR family  38.64 
 
 
315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1095  LysR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
316 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1381  LysR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.727507  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1008  LysR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0495  LysR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.212291  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1455  LysR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0155  LysR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.150061  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0640  LysR family transcriptional regulator  37.91 
 
 
305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148889  hitchhiker  0.000410503 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4666  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 
307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3930  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 
314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4054  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 
316 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0684  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743111  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3205  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 
316 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.241885  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4102  LysR family transcriptional regulator  37.3 
 
 
312 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0595  LysR family transcriptional regulator  37.91 
 
 
305 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.872616  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0635  LysR family transcriptional regulator  37.91 
 
 
305 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210235  normal  0.698608 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4038  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 
331 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4568  LysR family transcriptional regulator  37.83 
 
 
305 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00026007  normal  0.0106541 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1699  LysR family transcriptional regulator  38.26 
 
 
341 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761604  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4743  LysR family transcriptional regulator  38.05 
 
 
334 aa  209  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4436  LysR family transcriptional regulator  37.01 
 
 
352 aa  208  8e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00650478  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2317  LysR family regulatory protein  38.83 
 
 
302 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0209  putative transcriptional regulator  36.21 
 
 
305 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.150203  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0773  transcriptional regulator, LysR family  37.25 
 
 
306 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0564759  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3454  transcriptional regulator, LysR family  37.22 
 
 
314 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.169025  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3864  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
306 aa  206  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.163001 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0677  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.46 
 
 
306 aa  205  9e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4312  LysR family transcriptional regulator  37.85 
 
 
299 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.765284 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01640  LysR family transcriptional regulator  35.88 
 
 
305 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.262408  normal  0.919946 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1124  LysR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
318 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3663  LysR family transcriptional regulator  35.1 
 
 
302 aa  199  7e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3174  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
320 aa  196  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0100  LysR family transcriptional regulator  34.87 
 
 
306 aa  194  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6019  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 
322 aa  193  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1630  LysR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
296 aa  191  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.48911 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6273  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.22 
 
 
301 aa  189  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6363  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 
304 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.284625  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1540  LysR family transcriptional regulator  39.1 
 
 
334 aa  178  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4053  LysR family substrate binding transcriptional regulator  32.79 
 
 
311 aa  170  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3519  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 
315 aa  169  6e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3191  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 
297 aa  161  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3104  LysR family transcriptional regulator  33.83 
 
 
308 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.459931  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5706  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 
298 aa  159  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0443967  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2851  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 
321 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49590  transcriptional regulator  30.97 
 
 
300 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0224866  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3439  LysR family transcriptional regulator  29.86 
 
 
306 aa  156  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.555808 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2060  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
309 aa  155  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.159484  normal  0.0317829 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5120  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
297 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.809897 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1040  transcriptional regulator, LysR family  29.51 
 
 
306 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0665507  normal  0.490523 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3437  LysR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
304 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.395284  normal  0.657554 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0637  LysR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
304 aa  149  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381273  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5172  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
303 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.106584 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0367  LysR family transcriptional regulator  30.46 
 
 
305 aa  149  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.968869  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4643  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 
303 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3917  transcriptional regulator  33.09 
 
 
297 aa  148  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391829  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46060  transcriptional regulator  33.09 
 
 
297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.89621 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1618  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 
305 aa  147  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0301028 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03780  putative transcriptional regulator  29.87 
 
 
320 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.169365 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0380  transcriptional regulator  29.47 
 
 
316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4028  LysR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
297 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119859  normal  0.0962956 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0785  LysR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
304 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.352567  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2197  transcriptional regulator, LysR family  31.23 
 
 
309 aa  145  9e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1458  LysR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
297 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4522  LysR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
297 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.923329 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0638  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 
304 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.327526  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3814  LysR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
297 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0217357 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1389  LysR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
297 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4985  LysR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
305 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2155  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 
304 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1596  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 
304 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2149  transcriptional regulator, LysR family  28.82 
 
 
298 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.463348 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1997  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 
304 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5283  LysR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
305 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.770818  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2242  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 
304 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0675  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 
304 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108594  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3084  LysR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
305 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1799  LysR family transcriptional regulator  32.01 
 
 
299 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0309251  normal  0.330495 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4378  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 
305 aa  139  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840859  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5195  LysR family transcriptional regulator  29.58 
 
 
306 aa  135  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2782  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4054  LysR family transcriptional regulator  30.55 
 
 
298 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1724  transcriptional regulator, LysR family  27.72 
 
 
313 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2574  LysR family transcriptional regulator  29.24 
 
 
320 aa  123  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.475396  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2246  transcriptional regulator, LysR family  28.31 
 
 
311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02726  transcriptional regulator, LysR family protein  29.1 
 
 
308 aa  118  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4499  LysR family transcriptional regulator  29 
 
 
303 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1992  transcriptional regulator, LysR family  28.09 
 
 
313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1818  LysR family transcriptional regulator  31.7 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.631844  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2347  transcriptional regulator, LysR family  27.68 
 
 
313 aa  113  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1551  LysR family transcriptional regulator  28.36 
 
 
306 aa  113  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>