78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5485 on replicon NC_008147
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008704  Mkms_5885  prevent-host-death family protein  100 
 
 
94 aa  191  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5485  prevent-host-death protein  100 
 
 
94 aa  191  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.822453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13393  hypothetical protein  77.66 
 
 
91 aa  149  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.046844 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1663  prevent-host-death family protein  64.38 
 
 
92 aa  101  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0199822 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2555  prevent-host-death protein  66.2 
 
 
85 aa  96.7  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.29386  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1639  prevent-host-death family protein  49.32 
 
 
83 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0329629  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2156  antitoxin YefM  49.32 
 
 
83 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2309  antitoxin YefM  49.32 
 
 
83 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.516264  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1214  antitoxin YefM  49.32 
 
 
83 aa  71.6  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1927  prevent-host-death family protein  47.95 
 
 
83 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00504779  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2293  prevent-host-death family protein  47.95 
 
 
83 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0178348 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0794  prevent-host-death family protein  50.75 
 
 
83 aa  69.7  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4023  prevent-host-death family protein  47.95 
 
 
84 aa  68.2  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0407  prevent-host-death family protein  48.53 
 
 
87 aa  65.5  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.951779  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1308  prevent-host-death protein  49.32 
 
 
112 aa  66.2  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0247  prevent-host-death family protein  43.84 
 
 
83 aa  65.1  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0311  prevent-host-death family protein  43.84 
 
 
84 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1845  hypothetical protein  43.84 
 
 
83 aa  63.9  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745967  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3894  prevent-host-death family protein  44.44 
 
 
88 aa  63.5  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16280  Prevent-host-death protein  49.18 
 
 
69 aa  63.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1939  prevent-host-death family protein  43.06 
 
 
83 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3147  prevent-host-death family protein  38.36 
 
 
78 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0351  prevent-host-death family protein  40.79 
 
 
84 aa  61.6  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2972  prevent-host-death family protein  38.36 
 
 
78 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.297792 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4634  prevent-host-death protein  39.73 
 
 
107 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374921  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2263  prevent-host-death family protein  40.62 
 
 
85 aa  60.8  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01350  prevent-host-death family protein  45.21 
 
 
85 aa  58.5  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0337  prevent-host-death family protein  43.06 
 
 
92 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.703493  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2606  prevent-host-death family protein  45.45 
 
 
80 aa  58.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1752  prevent-host-death family protein  44.74 
 
 
121 aa  58.2  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0588193 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5458  prevent-host-death family protein  44.44 
 
 
74 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4434  prevent-host-death family protein  36.62 
 
 
83 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.318074  normal  0.388841 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2432  prevent-host-death family protein  40.45 
 
 
95 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1402  prevent-host-death family protein  43.06 
 
 
84 aa  55.1  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.333938  normal  0.826973 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2940  hypothetical protein  40.28 
 
 
94 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2964  prevent-host-death family protein  36.84 
 
 
80 aa  54.7  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1841  prevent-host-death protein  40.85 
 
 
97 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.208689  normal  0.186119 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0869  addiction module antitoxin, Axe family  43.64 
 
 
80 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0994  prevent-host-death family protein  43.64 
 
 
80 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000587691 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3814  putative YefM protein  44.44 
 
 
84 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000265887 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0028  prevent-host-death protein  40.28 
 
 
86 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0227799  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0044  prevent-host-death family protein  43.64 
 
 
80 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1787  prevent-host-death family protein  44.44 
 
 
80 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4765  prevent-host-death family protein  41.33 
 
 
86 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3489  prevent-host-death protein  41.33 
 
 
86 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00502392  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1101  prevent-host-death protein  31.87 
 
 
90 aa  52.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0844  prevent-host-death protein  41.33 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0811736 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4877  prevent-host-death family protein  41.33 
 
 
86 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2481  prevent-host-death family protein  42.86 
 
 
83 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.041466  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2433  prevent-host-death family protein  42.86 
 
 
83 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.137149  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5409  prevent-host-death family protein  41.33 
 
 
86 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0075  prevent-host-death family protein  40.74 
 
 
80 aa  52  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0554  antitoxin  40.26 
 
 
83 aa  52  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0694482  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16060  putative antitoxin  60.98 
 
 
67 aa  52  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3298  hypothetical protein  43.84 
 
 
87 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1443  prevent-host-death family protein  43.64 
 
 
80 aa  50.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0390  prevent-host-death family protein  39.24 
 
 
84 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2039  prevent-host-death family protein  41.33 
 
 
95 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.274153 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0975  prevent-host-death protein  41.67 
 
 
85 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0832169  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2484  prevent-host-death family protein  41.18 
 
 
85 aa  47.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000069999  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2533  prevent-host-death family protein  41.18 
 
 
85 aa  47.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000898748  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1751  prevent-host-death protein  39.39 
 
 
145 aa  47.4  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6160  Antitoxin of toxin-antitoxin stability system  42.62 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0989  prevent-host-death family protein  43.42 
 
 
94 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0433  prevent-host-death protein  28.38 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2448  prevent-host-death family protein  34.72 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3905  prevent-host-death family protein  41.07 
 
 
83 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.542624  normal  0.0844002 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0238  prevent-host-death family protein  41.67 
 
 
91 aa  44.3  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.030686  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2087  prevent-host-death protein  31.03 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000757578  unclonable  0.0000000885843 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01044  Antitoxin of toxin-antitoxin stability system, StbD family protein  40.68 
 
 
68 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4120  hypothetical protein  33.33 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4120  prevent-host-death family protein  37.5 
 
 
72 aa  42  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4160  prevent-host-death family protein  37.5 
 
 
72 aa  42  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.505447 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14180  prevent-host-death family protein  33.82 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.662389  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5998  prevent-host-death protein:addiction module toxin, Txe/YoeB  42 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2531  prevent-host-death family protein  32.18 
 
 
92 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7794  hypothetical protein  36.11 
 
 
94 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2089  RelB  29.73 
 
 
84 aa  40.4  0.009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.674522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>