61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5484 on replicon NC_008147
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008147  Mmcs_5484  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.671648 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5884  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5559  hypothetical protein  56.77 
 
 
250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2239  hypothetical protein  38.03 
 
 
211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal  0.581311 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4055  hypothetical protein  36.36 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1520  hypothetical protein  37.98 
 
 
273 aa  128  7.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289695  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4287  Domain of unknown function DUF1994  41.71 
 
 
303 aa  126  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.671447  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3140  hypothetical protein  43.51 
 
 
239 aa  124  9e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3402  hypothetical protein  38.81 
 
 
249 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0136  Excalibur domain protein  40.24 
 
 
382 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0048  Excalibur domain protein  41.32 
 
 
268 aa  116  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.670171  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1135  hypothetical protein  35.23 
 
 
252 aa  115  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.446215 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4279  hypothetical protein  44.97 
 
 
220 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.845853  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2160  hypothetical protein  42.38 
 
 
250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0411791  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0142  hypothetical protein  40.24 
 
 
291 aa  113  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0758265  hitchhiker  0.0048896 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1376  hypothetical protein  40.61 
 
 
208 aa  112  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1732  hypothetical protein  37.82 
 
 
208 aa  111  9e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5392  hypothetical protein  34.33 
 
 
279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.664126  normal  0.295298 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0369  hypothetical protein  41.56 
 
 
240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2818  Domain of unknown function DUF1994  40.36 
 
 
231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1886  hypothetical protein  42.48 
 
 
239 aa  109  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4424  hypothetical protein  38.65 
 
 
252 aa  109  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.323203 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2741  hypothetical protein  36.41 
 
 
306 aa  108  9.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00247299  hitchhiker  0.00910563 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0951  Excalibur domain-containing protein  37.57 
 
 
461 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.353483  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0128  Domain of unknown function DUF1994  40.85 
 
 
291 aa  106  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1001  hypothetical protein  38.1 
 
 
247 aa  106  3e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02630  protein of unknown function (DUF1994)  39.02 
 
 
389 aa  106  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.91242  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0353  hypothetical protein  33.66 
 
 
236 aa  105  5e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2156  hypothetical protein  36.59 
 
 
235 aa  102  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.490202  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2437  hypothetical protein  37.58 
 
 
265 aa  100  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.145721  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12987  membrane or exported protein  35.55 
 
 
237 aa  101  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0415  hypothetical protein  34.74 
 
 
243 aa  99.8  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0388856  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3199  hypothetical protein  38.32 
 
 
250 aa  97.4  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2187  hypothetical protein  36.42 
 
 
222 aa  95.5  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000250704 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1937  hypothetical protein  38.32 
 
 
236 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.15913  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1983  hypothetical protein  38.32 
 
 
236 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.014395  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1634  hypothetical protein  35.66 
 
 
272 aa  89.7  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1917  hypothetical protein  37.72 
 
 
236 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4211  hypothetical protein  36.53 
 
 
236 aa  85.1  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.790434  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11046  conserved hypothetical protein  37.04 
 
 
202 aa  83.6  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2568  hypothetical protein  39.1 
 
 
242 aa  79.7  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2276  secreted protein  35.07 
 
 
212 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4275  Domain of unknown function DUF1994  31.94 
 
 
219 aa  76.3  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.651112  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1094  hypothetical protein  35.25 
 
 
215 aa  75.1  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3853  secreted protein  36.11 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0421  hypothetical protein  39.42 
 
 
199 aa  73.2  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.609894  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26810  protein of unknown function (DUF1994)  32.3 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284972  normal  0.400066 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38220  protein of unknown function (DUF1994)  32.92 
 
 
228 aa  70.1  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140342  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0261  hypothetical protein  35.34 
 
 
214 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0161313  decreased coverage  0.000404846 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3044  Domain of unknown function DUF1994  31.94 
 
 
235 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0222  hypothetical protein  34.31 
 
 
249 aa  67  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.584066 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4178  hypothetical protein  32.88 
 
 
204 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00705375  normal  0.0874836 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0139  Domain of unknown function DUF1994  29.45 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119645  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6910  hypothetical protein  33.33 
 
 
212 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02560  protein of unknown function (DUF1994)  28.82 
 
 
256 aa  63.9  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5375  hypothetical protein  32.93 
 
 
220 aa  63.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0298613 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0481  Domain of unknown function DUF1994  30.77 
 
 
197 aa  63.2  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.952883  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0227  hypothetical protein  34.92 
 
 
231 aa  62  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5967  hypothetical protein  29.01 
 
 
226 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1891  hypothetical protein  36.67 
 
 
219 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4047  hypothetical protein  28.15 
 
 
170 aa  55.8  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>