192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5460 on replicon NC_008147
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008147  Mmcs_5460  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 159 aa  314  4e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1665  MarR family transcriptional regulator  99.37 
 
 		 159 aa  313  9e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1689  MarR family transcriptional regulator  99.37 
 
 		 159 aa  313  9e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1638  MarR family transcriptional regulator  99.37 
 
 		 159 aa  313  9e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.570464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0641  MarR family transcriptional regulator  99.37 
 
 		 159 aa  313  9e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5638  MarR family transcriptional regulator  98.74 
 
 		 159 aa  311  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0524  MarR family transcriptional regulator  98.74 
 
 		 159 aa  311  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5859  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 89 aa  166  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4836  MarR family transcriptional regulator  65.94 
 
 		 139 aa  166  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.139293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4454  MarR family transcriptional regulator  65.94 
 
 		 139 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.691105  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4541  MarR family transcriptional regulator  65.94 
 
 		 139 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.786222  normal  0.801932 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5020  MarR family transcriptional regulator  59.71 
 
 		 139 aa  160  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5857  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 85 aa  158  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0150711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1731  MarR family transcriptional regulator  63.85 
 
 		 141 aa  149  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0953  transcriptional regulator, MarR family  53.33 
 
 		 144 aa  140  7e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2446  regulatory protein MarR  42.86 
 
 		 149 aa  93.6  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7850  transcriptional regulator, MarR family  39.72 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172522  normal  0.477187 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2015  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3659  MarR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  41.38 
 
 		 158 aa  50.8  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  38.32 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  32.14 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  32.14 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  30.09 
 
 		 214 aa  48.9  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  32.29 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0158  transcriptional regulator, MarR family  40.26 
 
 		 144 aa  48.5  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1178  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 159 aa  48.1  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4551  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 165 aa  48.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3479  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 165 aa  48.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.891709  normal  0.101861 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  29.76 
 
 		 144 aa  48.1  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  36.29 
 
 		 157 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  30.95 
 
 		 146 aa  47.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 		 147 aa  47.4  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4176  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 		 167 aa  47  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  29.76 
 
 		 144 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 		 147 aa  47.4  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  29.76 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  29.76 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 309 aa  47  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  29.76 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  29.76 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  29.76 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  29.76 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  29.76 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  29.76 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  29.76 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  32.58 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  39.33 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  27.63 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 139 aa  46.6  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4307  MarR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  33.07 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 340 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  34.69 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 326 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 340 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  29.03 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  30.77 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  34.12 
 
 		 161 aa  45.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 148 aa  45.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 167 aa  45.1  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  25.17 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 172 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  31.73 
 
 		 158 aa  45.1  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  23.91 
 
 		 162 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  28.42 
 
 		 145 aa  45.1  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  39.34 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2241  transcriptional regulator, putative  21.74 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 		 170 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  25.17 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  25.17 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_002936  DET1163  MarR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 159 aa  44.3  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.404359  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0136  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 151 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0145  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 151 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753357  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0126  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 151 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 158 aa  44.3  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  36.04 
 
 		 153 aa  43.9  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>