45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5448 on replicon NC_008147
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008147  Mmcs_5448  cupin 2, barrel  100 
 
 		 147 aa  301  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.708388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5845  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 147 aa  301  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0630  cupin 2 domain-containing protein  89.73 
 
 		 147 aa  270  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0548  cupin 2 domain-containing protein  89.73 
 
 		 147 aa  270  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.915131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1675  cupin 2, barrel  89.73 
 
 		 147 aa  270  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1649  cupin 2 domain-containing protein  89.73 
 
 		 147 aa  270  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.316822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0535  cupin 2 domain-containing protein  89.73 
 
 		 147 aa  270  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1700  cupin 2 domain-containing protein  89.73 
 
 		 147 aa  270  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.792463 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5649  cupin 2 domain-containing protein  89.73 
 
 		 147 aa  270  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4525  cupin 2 domain-containing protein  36 
 
 		 147 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0378  cupin region  33.59 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930622  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5084  cupin superfamily protein  33.94 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0259637  normal  0.536671 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.19 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.2 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.81 
 
 		 159 aa  50.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.48 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0356258  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.88 
 
 		 181 aa  47.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2609  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.52 
 
 		 160 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0625  hypothetical protein  36.49 
 
 		 166 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0262  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.67 
 
 		 121 aa  46.2  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.6 
 
 		 165 aa  44.7  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.41 
 
 		 160 aa  44.7  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  28.1 
 
 		 190 aa  44.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.1 
 
 		 192 aa  44.7  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3670  cupin 2 domain-containing protein  36.67 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801583 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  29.55 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  32.71 
 
 		 179 aa  43.9  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0452  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.82 
 
 		 136 aa  42.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.95 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0454  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.53 
 
 		 356 aa  42  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  31.76 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3113  cupin 2 domain-containing protein  33.73 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.487782  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.82 
 
 		 135 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3737  cupin 2 domain-containing protein  39.06 
 
 		 135 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107824  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0445  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.27 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.205887 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1620  cupin 2 domain-containing protein  30.91 
 
 		 176 aa  41.2  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3503  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.37 
 
 		 182 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0281  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.64 
 
 		 161 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.58 
 
 		 186 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.399642  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4448  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 193 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0311191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0323  XRE family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 191 aa  40.4  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000737434  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0321  XRE family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 191 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250107  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2414  hypothetical protein  34.29 
 
 		 155 aa  40  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478977  normal  0.947675 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3906  cupin 2 domain-containing protein  38.46 
 
 		 133 aa  40  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000227782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  31.96 
 
 		 163 aa  40  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>