16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5420 on replicon NC_008147
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008147  Mmcs_5420  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000677769  normal  0.66486 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6015  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  1.8465599999999998e-20  hitchhiker  4.394800000000001e-25 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.61 
 
 
378 aa  55.1  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.065739  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0002  DNA polymerase III subunit beta  33.06 
 
 
398 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298765  normal  0.252015 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0826  DNA polymerase III subunit beta  31.3 
 
 
398 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.93 
 
 
380 aa  44.7  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000000143991  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5871  DNA polymerase III, beta subunit  36.28 
 
 
404 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.24159  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.82 
 
 
408 aa  44.3  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0002  DNA-directed DNA polymerase  32.73 
 
 
379 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000640008  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.77 
 
 
398 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0010  DNA polymerase III subunit beta  32.77 
 
 
398 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.716793  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.77 
 
 
398 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.042032 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10002  DNA polymerase III subunit beta  30.47 
 
 
402 aa  42.4  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.68 
 
 
389 aa  42  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.105928  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.25 
 
 
378 aa  42  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0259305  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.73 
 
 
379 aa  42  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000269969  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>