More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5402 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  100 
 
 
333 aa  671    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  100 
 
 
333 aa  671    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  100 
 
 
333 aa  671    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  88.67 
 
 
336 aa  558  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  87.7 
 
 
331 aa  556  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  79.1 
 
 
335 aa  499  1e-140  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  76.8 
 
 
330 aa  490  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  75.64 
 
 
330 aa  483  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  74.03 
 
 
331 aa  459  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  73.14 
 
 
318 aa  461  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  65.33 
 
 
361 aa  429  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  66.35 
 
 
359 aa  416  9.999999999999999e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  67.32 
 
 
310 aa  413  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  68.18 
 
 
310 aa  412  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  66.13 
 
 
319 aa  412  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  63.91 
 
 
346 aa  406  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  65.15 
 
 
348 aa  402  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  64.38 
 
 
310 aa  402  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  61.32 
 
 
353 aa  402  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  65.61 
 
 
330 aa  398  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  63.87 
 
 
313 aa  399  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  64.14 
 
 
310 aa  396  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  67.97 
 
 
309 aa  393  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  62.18 
 
 
332 aa  388  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5084  thioredoxin reductase  67.22 
 
 
325 aa  390  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  64.29 
 
 
340 aa  389  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  62.38 
 
 
318 aa  390  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  63.41 
 
 
348 aa  387  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  60.45 
 
 
318 aa  387  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  66.03 
 
 
317 aa  382  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  61.98 
 
 
333 aa  382  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5097  thioredoxin reductase  64.67 
 
 
362 aa  373  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121367  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  60.66 
 
 
332 aa  370  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  62.86 
 
 
344 aa  370  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0214  thioredoxin reductase  63.78 
 
 
329 aa  369  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  63.11 
 
 
327 aa  368  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  61.88 
 
 
329 aa  367  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  57.51 
 
 
319 aa  358  8e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3024  thioredoxin reductase  62.66 
 
 
325 aa  357  9.999999999999999e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.352085 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  57.68 
 
 
333 aa  355  5.999999999999999e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  58.42 
 
 
334 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  57.61 
 
 
311 aa  352  5.9999999999999994e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  58.86 
 
 
325 aa  348  6e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  56.82 
 
 
313 aa  346  3e-94  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9042  thioredoxin reductase  58.77 
 
 
317 aa  342  4e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1914  thioredoxin reductase  56.58 
 
 
325 aa  342  5e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  56.48 
 
 
314 aa  341  9e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  58.84 
 
 
320 aa  341  1e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  56.48 
 
 
314 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  55.88 
 
 
311 aa  338  5e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3650  thioredoxin reductase  62.62 
 
 
327 aa  338  8e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1444  thioredoxin reductase  53.59 
 
 
339 aa  338  9e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  55.19 
 
 
311 aa  335  7.999999999999999e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  55.88 
 
 
311 aa  334  1e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  53.92 
 
 
311 aa  332  6e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  52.88 
 
 
334 aa  331  1e-89  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  54.58 
 
 
311 aa  330  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3988  thioredoxin reductase  55.7 
 
 
325 aa  328  6e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.717161 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  56.15 
 
 
314 aa  325  5e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  53.09 
 
 
311 aa  322  5e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2343  thioredoxin reductase  51.08 
 
 
461 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2394  thioredoxin reductase  51.08 
 
 
461 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  54.15 
 
 
320 aa  318  6e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  51.74 
 
 
361 aa  318  7e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  51.6 
 
 
456 aa  318  7.999999999999999e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1780  thioredoxin reductase  49.51 
 
 
323 aa  318  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3654  thioredoxin reductase  50.93 
 
 
458 aa  314  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24215  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11253  putative thioredoxin reductase  46.98 
 
 
326 aa  314  1.9999999999999998e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  53.14 
 
 
321 aa  311  7.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  49.84 
 
 
460 aa  311  9e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1354  thioredoxin reductase  52.16 
 
 
313 aa  311  1e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  51.66 
 
 
321 aa  311  1e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1778  thioredoxin-disulfide reductase  50 
 
 
315 aa  311  1e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246241  decreased coverage  0.00675935 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0199  thioredoxin reductase  50 
 
 
315 aa  310  2e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1016  thioredoxin reductase  52.61 
 
 
320 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4165  thioredoxin reductase  53.53 
 
 
314 aa  310  2.9999999999999997e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.571587  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  50.65 
 
 
319 aa  309  5e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  50.99 
 
 
321 aa  309  5e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1178  thioredoxin reductase  52.29 
 
 
320 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  49.18 
 
 
323 aa  308  5.9999999999999995e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  49.18 
 
 
323 aa  308  5.9999999999999995e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1613  thioredoxin reductase  51.83 
 
 
322 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1337  thioredoxin reductase  51.77 
 
 
311 aa  307  2.0000000000000002e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  49.2 
 
 
322 aa  306  3e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4061  thioredoxin reductase  49.04 
 
 
453 aa  306  3e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1269  thioredoxin reductase  51.66 
 
 
309 aa  306  4.0000000000000004e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28227  predicted protein  51.91 
 
 
547 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0120159 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  50.81 
 
 
324 aa  305  6e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3442  thioredoxin reductase  50 
 
 
333 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  49.03 
 
 
314 aa  305  8.000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0086  thioredoxin reductase  49.68 
 
 
320 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0887  thioredoxin reductase  51.63 
 
 
320 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0803  thioredoxin reductase  50.33 
 
 
318 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  49.85 
 
 
345 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1692  thioredoxin reductase 1  48.7 
 
 
314 aa  303  2.0000000000000002e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160177  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03581  Thioredoxin reductase (EC 1.8.1.9) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q08GE2]  50.3 
 
 
339 aa  303  3.0000000000000004e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.813979  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2753  thioredoxin reductase  53.07 
 
 
320 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  49.52 
 
 
316 aa  302  4.0000000000000003e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  49.35 
 
 
324 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2721  thioredoxin reductase  49.52 
 
 
317 aa  302  4.0000000000000003e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.49521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>