More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5400 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4843  virulence factor MVIN family protein  41.21 
 
 
1219 aa  796    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5776  integral membrane protein MviN  98.56 
 
 
1168 aa  2065    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24398  normal  0.429874 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13945  transmembrane protein  66.31 
 
 
1184 aa  1407    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.10939  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0842  integral membrane protein MviN  70.2 
 
 
1209 aa  1508    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.194634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5400  integral membrane protein MviN  100 
 
 
1263 aa  2449    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5489  integral membrane protein MviN  100 
 
 
1184 aa  2294    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.250379 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6064  integral membrane protein MviN  70.57 
 
 
1224 aa  1520    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.342364 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4226  virulence factor MVIN family protein  48.84 
 
 
1219 aa  486  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105203  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  32.55 
 
 
1217 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7082  virulence factor MVIN family protein  43.05 
 
 
521 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39630  integral membrane protein MviN  43.63 
 
 
610 aa  364  5.0000000000000005e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal  0.312957 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0037  hypothetical protein  43.89 
 
 
623 aa  335  5e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0046  hypothetical protein  43.89 
 
 
623 aa  335  5e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00847244 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0027  hypothetical protein  43.5 
 
 
623 aa  331  4e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.476694 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5082  integral membrane protein MviN  40.81 
 
 
674 aa  321  6e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0925894  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7324  integral membrane protein MviN  35.84 
 
 
657 aa  229  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414856  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4533  integral membrane protein MviN  32.28 
 
 
918 aa  223  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9372  membrane protein putative virulence factor-like protein  32.96 
 
 
534 aa  222  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7083  hypothetical protein  34.98 
 
 
502 aa  221  7e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39640  hypothetical protein  32.5 
 
 
509 aa  220  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9038  integral membrane protein MviN  31.28 
 
 
899 aa  220  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3104  virulence factor MVIN-like  34.31 
 
 
627 aa  219  2.9999999999999998e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2295  integral membrane protein MviN  38.44 
 
 
533 aa  209  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6435  integral membrane protein MviN  33.76 
 
 
546 aa  209  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.318853 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3574  integral membrane protein MviN  35.81 
 
 
532 aa  209  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4853  integral membrane protein MviN  32.53 
 
 
621 aa  207  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.188841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5795  membrane protein putative virulence factor-like protein  37.02 
 
 
535 aa  198  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.0760131 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2142  integral membrane protein MviN  35.55 
 
 
559 aa  199  4.0000000000000005e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.296197  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4575  integral membrane protein MviN  32.56 
 
 
592 aa  195  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0630035 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5093  integral membrane protein MviN  32.9 
 
 
580 aa  195  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000635167 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4497  integral membrane protein MviN  35.2 
 
 
570 aa  189  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4965  integral membrane protein MviN  33.95 
 
 
526 aa  185  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4210  integral membrane protein MviN  30 
 
 
1652 aa  182  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26920  integral membrane protein MviN  34 
 
 
560 aa  181  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3715  integral membrane protein MviN  32.83 
 
 
580 aa  177  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.516983  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4683  integral membrane protein MviN  32.94 
 
 
552 aa  171  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.499252  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4797  integral membrane protein MviN  34.81 
 
 
665 aa  169  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945849  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4852  integral membrane protein MviN  30.92 
 
 
568 aa  167  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3926  integral membrane protein MviN  30.21 
 
 
715 aa  159  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4159  integral membrane protein MviN  29.35 
 
 
708 aa  155  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31860  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  29.82 
 
 
579 aa  149  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.683518  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2545  integral membrane protein MviN  33.43 
 
 
552 aa  145  5e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0233456  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23360  integral membrane protein MviN  31.03 
 
 
614 aa  144  9e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37920  integral membrane protein MviN  31.92 
 
 
565 aa  135  6e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1446  hypothetical protein  30.47 
 
 
575 aa  135  6e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0027  integral membrane protein MviN  33.18 
 
 
535 aa  127  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0056  putative integral membrane protein MviN  29 
 
 
598 aa  127  1e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2117  virulence factor MVIN family protein  27.55 
 
 
700 aa  124  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0993652  normal  0.569404 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6434  serine/threonine protein kinase  27.65 
 
 
477 aa  115  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.317855 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5094  serine/threonine protein kinase  27.79 
 
 
535 aa  114  8.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000566508 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  28.13 
 
 
539 aa  112  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  27.44 
 
 
521 aa  112  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08730  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  28.53 
 
 
563 aa  110  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.201008  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3365  virulence factor MVIN family protein  27.85 
 
 
569 aa  109  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  27.52 
 
 
523 aa  109  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0896  integral membrane protein MviN  31.62 
 
 
543 aa  107  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.474692 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  29.72 
 
 
516 aa  107  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  30.65 
 
 
515 aa  106  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  30.18 
 
 
573 aa  106  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5413  virulence factor MVIN family protein  28.72 
 
 
648 aa  105  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1855  virulence factor MVIN-like protein  30.69 
 
 
512 aa  103  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  27.41 
 
 
498 aa  103  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  28.61 
 
 
511 aa  103  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  29.68 
 
 
512 aa  102  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1168  integral membrane protein MviN  29.76 
 
 
545 aa  102  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  28.6 
 
 
530 aa  102  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  29.09 
 
 
517 aa  102  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  27.14 
 
 
534 aa  101  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3575  serine/threonine protein kinase  27.18 
 
 
498 aa  102  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  30.2 
 
 
515 aa  101  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2604  integral membrane protein MviN  28.54 
 
 
517 aa  101  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  30.52 
 
 
521 aa  100  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  30.05 
 
 
512 aa  100  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  27.84 
 
 
511 aa  100  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  27.77 
 
 
505 aa  100  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  27.25 
 
 
521 aa  100  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  27 
 
 
522 aa  99.8  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  28.78 
 
 
530 aa  99.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  25.27 
 
 
522 aa  99  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4576  serine/threonine protein kinase  26.94 
 
 
556 aa  99  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0563383 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0137  integral membrane protein MviN  26.51 
 
 
555 aa  99  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3828  integral membrane protein MviN  29.65 
 
 
525 aa  99  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.831164  normal  0.0288471 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3569  integral membrane protein MviN  30.67 
 
 
521 aa  98.2  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2999  integral membrane protein MviN  30.02 
 
 
532 aa  98.2  9e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.31906  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2426  integral membrane protein MviN  30.02 
 
 
521 aa  97.8  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1483  integral membrane protein MviN  28.74 
 
 
541 aa  97.8  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.441389 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  27.23 
 
 
521 aa  97.1  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  28.72 
 
 
512 aa  97.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1575  integral membrane protein MviN  29.37 
 
 
535 aa  97.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337983  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0850  integral membrane protein MviN  26.91 
 
 
522 aa  97.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  28.72 
 
 
512 aa  97.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  26.71 
 
 
529 aa  96.3  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  27.45 
 
 
511 aa  96.7  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09620  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  25.67 
 
 
535 aa  96.3  3e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal  0.0121961 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  26.65 
 
 
512 aa  95.9  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  29.21 
 
 
512 aa  95.9  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  29.36 
 
 
524 aa  95.9  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  29.36 
 
 
524 aa  95.9  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  29.36 
 
 
524 aa  95.9  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  29.36 
 
 
524 aa  95.9  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>