More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5384 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5384  ABC transporter related  100 
 
 		 247 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.773344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5473  ABC transporter related  100 
 
 		 247 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261714  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5760  ABC transporter related  99.6 
 
 		 247 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6048  ABC transporter-related protein  82.43 
 
 		 243 aa  410  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0164038  normal  0.602445 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0857  ABC transporter related  82.85 
 
 		 243 aa  412  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00848915 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2484  ABC transporter related  73.53 
 
 		 245 aa  366  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000266476 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3865  ABC transporter related protein  70.68 
 
 		 249 aa  362  3e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5881  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  63.45 
 
 		 502 aa  304  9.000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5420  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  61.34 
 
 		 516 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342804 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5124  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  60.5 
 
 		 510 aa  300  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.214157  normal  0.101359 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5550  glutamine ABC transporter  60.5 
 
 		 507 aa  295  4e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1981  ABC transporter related  61.76 
 
 		 260 aa  285  5e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.308178  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  54.88 
 
 		 253 aa  275  6e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  55.23 
 
 		 240 aa  274  9e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  55.65 
 
 		 246 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  55.65 
 
 		 242 aa  272  3e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  51.49 
 
 		 242 aa  271  6e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  53.25 
 
 		 247 aa  271  7e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  55.23 
 
 		 244 aa  270  1e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.43 
 
 		 269 aa  270  2e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  54.01 
 
 		 242 aa  269  4e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  54.01 
 
 		 242 aa  268  5e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  53.97 
 
 		 242 aa  268  8.999999999999999e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  53.97 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  51.43 
 
 		 269 aa  267  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.81 
 
 		 249 aa  266  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  53.25 
 
 		 246 aa  266  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 		 251 aa  265  4e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  53.97 
 
 		 255 aa  265  5e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  51.88 
 
 		 242 aa  265  5e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  51.88 
 
 		 242 aa  265  5e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  54.62 
 
 		 240 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  52.3 
 
 		 240 aa  264  8.999999999999999e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1656  ABC transporter related  50.63 
 
 		 255 aa  264  8.999999999999999e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00836866  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  55.06 
 
 		 257 aa  263  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  51.46 
 
 		 259 aa  264  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  52.3 
 
 		 240 aa  263  3e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4002  ABC transporter related  53.66 
 
 		 253 aa  262  4.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  57.74 
 
 		 243 aa  261  4.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  53.56 
 
 		 240 aa  261  6e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  53.56 
 
 		 244 aa  261  6e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  50.63 
 
 		 240 aa  261  6.999999999999999e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  56.9 
 
 		 243 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  49.8 
 
 		 258 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  49.8 
 
 		 258 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2063  ABC transporter related  57.58 
 
 		 246 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0300144  normal  0.143114 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.41 
 
 		 244 aa  259  2e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  54.43 
 
 		 246 aa  259  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  50.64 
 
 		 249 aa  260  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  53.56 
 
 		 241 aa  259  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  52.72 
 
 		 241 aa  260  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  52.72 
 
 		 244 aa  259  2e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  53.56 
 
 		 241 aa  259  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  54.62 
 
 		 249 aa  259  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  53.11 
 
 		 246 aa  260  2e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  54.13 
 
 		 249 aa  259  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  52.72 
 
 		 241 aa  260  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  53.75 
 
 		 244 aa  259  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  53.56 
 
 		 244 aa  259  2e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.72 
 
 		 241 aa  259  3e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7857  ABC transporter related  53.39 
 
 		 261 aa  259  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  48.83 
 
 		 257 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  49.41 
 
 		 267 aa  259  3e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  51.06 
 
 		 242 aa  259  4e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  48.83 
 
 		 257 aa  258  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 		 240 aa  259  4e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  53.16 
 
 		 240 aa  258  4e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  52.59 
 
 		 248 aa  258  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.3 
 
 		 240 aa  258  5.0000000000000005e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  52.3 
 
 		 241 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  52.32 
 
 		 246 aa  258  5.0000000000000005e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  53.14 
 
 		 241 aa  258  6e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  53.14 
 
 		 241 aa  258  6e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  50.43 
 
 		 242 aa  258  7e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  51.88 
 
 		 246 aa  258  7e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  52.72 
 
 		 241 aa  258  7e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  52.99 
 
 		 241 aa  257  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3458  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  56.96 
 
 		 246 aa  257  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  51.06 
 
 		 249 aa  257  1e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  52.32 
 
 		 249 aa  257  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  53.14 
 
 		 244 aa  257  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  49.4 
 
 		 244 aa  257  1e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3014  ABC transporter related  55.51 
 
 		 252 aa  257  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.101758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3103  ABC transporter related  56.96 
 
 		 246 aa  257  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.209111  normal  0.482435 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  49.38 
 
 		 262 aa  256  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  52.77 
 
 		 243 aa  256  2e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  58.26 
 
 		 240 aa  256  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2581  ABC transporter related  53.33 
 
 		 255 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.507078  normal  0.289132 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  49.38 
 
 		 262 aa  256  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  49.36 
 
 		 249 aa  256  3e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  52.61 
 
 		 256 aa  256  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  51.26 
 
 		 239 aa  256  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  52.54 
 
 		 242 aa  256  3e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  49.79 
 
 		 263 aa  256  3e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  52.72 
 
 		 241 aa  256  3e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  51.41 
 
 		 246 aa  255  4e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2745  ABC transporter related  53.41 
 
 		 248 aa  255  4e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394872  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.3 
 
 		 247 aa  255  6e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  48.97 
 
 		 262 aa  254  8e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  53.14 
 
 		 241 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>