72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5363 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_5741  hypothetical protein  98.31 
 
 
519 aa  702    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1730  hypothetical protein  96.62 
 
 
507 aa  666    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4731  hypothetical protein  97.46 
 
 
507 aa  698    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1709  hypothetical protein  96.62 
 
 
507 aa  666    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4351  hypothetical protein  98.03 
 
 
507 aa  701    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489972  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5363  hypothetical protein  100 
 
 
355 aa  719    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5454  hypothetical protein  99.72 
 
 
519 aa  712    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157039  decreased coverage  0.0069948 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4437  hypothetical protein  98.03 
 
 
507 aa  701    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.835135  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1777  hypothetical protein  96.62 
 
 
507 aa  666    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159063  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3484  hypothetical protein  82.72 
 
 
552 aa  585  1e-166  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210016  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4912  hypothetical protein  81.41 
 
 
508 aa  570  1e-161  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477526  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4827  hypothetical protein  80.56 
 
 
508 aa  566  1e-160  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.79889  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3231  hypothetical protein  80 
 
 
510 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3477  hypothetical protein  80.28 
 
 
506 aa  557  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.800826  normal  0.648899 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1835  hypothetical protein  76.62 
 
 
489 aa  553  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5865  hypothetical protein  78.59 
 
 
511 aa  548  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563621  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4397  hypothetical protein  79.14 
 
 
501 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3050  hypothetical protein  44.33 
 
 
495 aa  269  7e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4451  hypothetical protein  42.86 
 
 
518 aa  263  4e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3851  hypothetical protein  42.86 
 
 
513 aa  262  8e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.432378 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11151  hypothetical protein  47.38 
 
 
451 aa  261  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11717  hypothetical protein  44.48 
 
 
454 aa  249  4e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.12455 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2152  hypothetical protein  43.34 
 
 
492 aa  246  6e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.166446 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4014  hypothetical protein  44.55 
 
 
464 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00728967 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0338  hypothetical protein  42.49 
 
 
492 aa  242  9e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0348  hypothetical protein  42.49 
 
 
492 aa  242  9e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3379  hypothetical protein  41.69 
 
 
497 aa  241  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.887374  normal  0.158077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3542  hypothetical protein  42.61 
 
 
444 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3615  hypothetical protein  42.61 
 
 
444 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2106  hypothetical protein  42.9 
 
 
446 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.426457  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2089  hypothetical protein  42.78 
 
 
493 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.129503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2779  hypothetical protein  41.93 
 
 
473 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3547  hypothetical protein  41.74 
 
 
444 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0179  hypothetical protein  41.74 
 
 
442 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0170  hypothetical protein  41.74 
 
 
442 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0327  hypothetical protein  41.64 
 
 
490 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2793  hypothetical protein  41.36 
 
 
473 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.925956  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2749  hypothetical protein  41.36 
 
 
473 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.621595  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11173  hypothetical protein  43.59 
 
 
499 aa  224  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4232  hypothetical protein  44.15 
 
 
448 aa  222  7e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815534  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4610  hypothetical protein  44.15 
 
 
448 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3803  hypothetical protein  43.19 
 
 
447 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.866819  normal  0.47715 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11974  hypothetical protein  43.3 
 
 
454 aa  217  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3745  protein of unknown function DUF222  37.08 
 
 
531 aa  176  5e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4127  protein of unknown function DUF222  36.17 
 
 
532 aa  173  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2293  protein of unknown function DUF222  36.26 
 
 
540 aa  169  8e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2470  protein of unknown function DUF222  35.99 
 
 
437 aa  166  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4824  protein of unknown function DUF222  34.58 
 
 
553 aa  166  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2802  protein of unknown function DUF222  33.82 
 
 
551 aa  166  5e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0845411  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10095  hypothetical protein  50 
 
 
317 aa  156  7e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.391031  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4288  protein of unknown function DUF222  33.33 
 
 
524 aa  153  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.429378  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0796  protein of unknown function DUF222  32.76 
 
 
534 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4191  protein of unknown function DUF222  32.48 
 
 
533 aa  140  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.650463  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3811  protein of unknown function DUF222  32.48 
 
 
593 aa  138  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3136  hypothetical protein  32.35 
 
 
387 aa  125  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11604  REP13E12 repeat-containing protein  51.13 
 
 
240 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.81222e-18  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13504  hypothetical protein  51.13 
 
 
239 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  30.38 
 
 
546 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10096  hypothetical protein  38.64 
 
 
260 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.493023  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  29.11 
 
 
561 aa  73.6  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11605  REP13E12 repeat-containing protein  37.12 
 
 
222 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.46537e-16  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  28.82 
 
 
442 aa  68.9  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13503  hypothetical protein  40.16 
 
 
222 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.946921  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4658  hypothetical protein  26.4 
 
 
275 aa  59.3  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449109  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  25.76 
 
 
432 aa  54.3  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5104  hypothetical protein  40.7 
 
 
96 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5192  hypothetical protein  40.7 
 
 
104 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.783231  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5483  hypothetical protein  40.7 
 
 
104 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  27.98 
 
 
413 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  26.69 
 
 
408 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  35.35 
 
 
469 aa  44.3  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  28.37 
 
 
407 aa  43.5  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>