More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5350 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_5729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
263 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
263 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5439  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
263 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2479  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.6 
 
 
258 aa  194  8.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1818  ABC transporter, permease protein  39.43 
 
 
263 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.493092 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.36 
 
 
257 aa  175  9e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0826963  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1812  ABC transporter, permease protein  34.31 
 
 
257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.554956  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.04 
 
 
269 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
261 aa  143  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122201  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1369  ABC transporter membrane protein  36.74 
 
 
272 aa  142  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34320  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  40 
 
 
273 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4671  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.24 
 
 
274 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.62 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.922239  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
276 aa  135  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8275  ABC-type transporter, permease protein  35.2 
 
 
272 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
278 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0649738  hitchhiker  0.00238236 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4332  ABC transporter permease  33.47 
 
 
298 aa  132  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 
266 aa  131  9e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.314921 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18130  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  32.72 
 
 
283 aa  126  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1541  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  37.7 
 
 
281 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.84 
 
 
298 aa  126  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.30367  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.84 
 
 
281 aa  125  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1813  ABC transporter membrane protein  37.38 
 
 
256 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48548  normal  0.635137 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5801  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.75 
 
 
290 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0722  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.06 
 
 
272 aa  121  9e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0102858  normal  0.0961586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7247  ABC transporter permease  30.87 
 
 
286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00669088  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.51 
 
 
285 aa  118  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.987071 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3065  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.61 
 
 
280 aa  118  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.89 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.39 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0593827  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.04 
 
 
280 aa  116  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615395  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 
288 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  hitchhiker  0.00645779 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.32 
 
 
279 aa  115  6e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.208956  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.34 
 
 
277 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.13 
 
 
270 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0890555  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6545  ABC transporter permease  35.2 
 
 
269 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.276106 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.13 
 
 
270 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.93 
 
 
253 aa  115  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.158821  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.91 
 
 
287 aa  115  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0773955  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.13 
 
 
270 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1692  putative ABC transporter membrane protein  33.02 
 
 
281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.16 
 
 
255 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.185051 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0099  nitrate/nitrite/cyanate ABC transporter inner membrane protein  32.64 
 
 
277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.291864  normal  0.355691 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0735  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  36.55 
 
 
273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.714635  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199649  normal  0.0607956 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5985  putative ABC transporter (permease protein)  33.68 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.73 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.73 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0183453  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2012  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.72 
 
 
280 aa  113  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.338733  normal  0.193625 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.59 
 
 
273 aa  112  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.59 
 
 
273 aa  112  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1188  taurine ABC transporter, permease protein  31.49 
 
 
250 aa  112  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0612406  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.8 
 
 
280 aa  112  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4705  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.73 
 
 
270 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.08 
 
 
286 aa  112  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.92 
 
 
275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.92 
 
 
273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.5369  normal  0.169212 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0467  taurine ABC transporter, permease protein, putative  29.95 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.42 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3058  taurine ABC transporter, permease protein  30.4 
 
 
274 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0406  putative taurine ABC transporter, permease protein  29.95 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.22 
 
 
274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.99 
 
 
275 aa  110  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2492  ABC aliphatic sulfonates transporter, innermembrane subunit  32.68 
 
 
280 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.773133 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44530  Binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.77 
 
 
259 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0634098  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1238  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
273 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.466833  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1822  aliphatic sulfonates ABC transporter, permease protein  32.83 
 
 
269 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.14 
 
 
273 aa  109  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.99 
 
 
245 aa  109  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1990  aliphatic sulfonates ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
273 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.088895  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0780  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
273 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.175921  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1837  aliphatic sulfonates ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
269 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.669476  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1724  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
273 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.49 
 
 
273 aa  109  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0381  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
273 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.410212  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2500  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  34.2 
 
 
268 aa  108  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.59 
 
 
329 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5412  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.92 
 
 
260 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.210037  hitchhiker  0.00191971 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.71 
 
 
280 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.39 
 
 
267 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.22 
 
 
280 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.42556  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1819  ABC-type transporter, permease protein  36.36 
 
 
262 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.240116 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.91 
 
 
273 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2630  sulfonate ABC transporter, permease protein, putative  35.43 
 
 
266 aa  107  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.312135  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.67 
 
 
268 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34310  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  31.53 
 
 
256 aa  107  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.35 
 
 
293 aa  105  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113651  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19510  ABC transporter permease  34.54 
 
 
274 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2748  sulfonate/taurine ABC transporter permease  30.37 
 
 
274 aa  105  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947189  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1186  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.84 
 
 
257 aa  105  6e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.409709  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2676  putative ABC transporter, permease protein  31.38 
 
 
258 aa  105  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.931281  normal  0.413503 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.33 
 
 
283 aa  105  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189471  normal  0.0804385 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.49 
 
 
264 aa  105  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3060  taurine ABC transporter, permease protein  30.52 
 
 
274 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244271  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.68 
 
 
301 aa  104  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0309  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.4 
 
 
277 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.409097 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2837  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.02 
 
 
266 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.115716  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
286 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.703431 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>